Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 KLRF1 Gene 0 35.92 0.42 0.30 4.18 9.25 0.68 2.72 3.61 5.99 1.83 0.56 2.59 1.11 0.40 0.41 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 0.00 0.51 0.00 2 354855 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 279544 Transcript 0 29.34 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 8.66 2.51 9.17 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 4 324214 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 279545 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 18.08 0.03 0.00 1.00 4.58 0.63 1.81 0.00 3.61 2.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 12.61 1.01 0.00 2.24 1.70 0.00 0.00 0.00 3.52 3.20 1.00 2.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E3a KnownJunction 0 18.30 0.00 0.00 0.00 3.65 0.00 0.00 0.00 3.99 4.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 25.89 0.00 0.00 3.54 7.88 0.62 3.65 1.22 6.39 0.21 0.00 2.97 5.19 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E3a_E4a KnownJunction 0 29.34 0.00 0.00 4.10 0.00 0.00 8.66 2.51 9.17 0.00 0.00 6.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E4_Aa NovelBoundary 0 21.11 0.00 0.00 5.63 0.00 0.00 0.00 2.01 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4a ExonRegion 0 49.54 0.00 0.00 5.08 1.89 0.91 2.15 4.98 3.20 1.41 0.69 2.69 2.75 0.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.74 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 61.34 0.00 0.00 6.96 7.13 2.90 2.16 8.63 6.66 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 55.12 0.00 0.00 6.55 12.41 1.33 5.17 5.81 8.68 0.53 1.74 1.61 0.08 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 5.69 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 44.08 0.00 0.00 5.73 0.00 0.00 5.61 1.97 4.75 0.00 0.00 0.00 0.00 2.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 39.94 0.71 0.64 4.81 13.26 0.64 2.85 4.99 7.07 2.09 0.51 3.37 0.34 0.47 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 21 IG11 Intergenic 0 12.46 0.00 1.28 0.61 1.87 0.27 1.39 1.41 1.01 0.26 0.10 0.36 0.17 0.27 0.00 0.30 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.10 0.88 22 IG11_SR1 SilentIntergenicRegion 0 12.50 0.00 1.28 0.61 1.87 0.28 1.39 1.42 1.01 0.26 0.10 0.36 0.17 0.27 0.00 0.30 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.10 0.88