Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PATE3 Gene 0 1.13 9.46 3.62 3.02 0.92 4.06 1.11 0.98 4.21 2.80 0.00 0.00 2.16 0.35 0.39 0.00 2.14 3.68 7.05 35.06 0.08 0.00 0.00 2 445202 Transcript 0 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 0.00 0.00 3 452850 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.39 1.60 0.00 0.00 0.00 4 IG9 Intergenic 0 0.27 2.11 1.03 0.81 0.19 2.43 0.70 0.94 1.47 1.06 0.11 0.06 1.21 0.33 0.04 0.00 0.96 1.71 3.71 21.25 0.00 0.00 0.16 5 IG9_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.27 2.11 1.03 0.81 0.19 2.44 0.70 0.94 1.47 1.06 0.11 0.06 1.21 0.33 0.04 0.00 0.96 1.71 3.71 21.26 0.00 0.00 0.16 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 3.50 0.00 0.00 0.00 1.04 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 20.47 0.00 0.00 0.00 7 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 8.62 3.46 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 4.02 3.90 0.00 22.50 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 I1 Intron 0 0.20 5.58 2.72 1.70 0.25 3.15 0.80 1.32 2.57 1.83 0.00 0.33 1.30 0.50 0.00 0.00 1.99 2.86 6.66 27.40 0.00 0.00 0.14 10 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.20 5.59 2.72 1.70 0.25 3.16 0.80 1.32 2.57 1.83 0.00 0.33 1.30 0.50 0.00 0.00 2.00 2.87 6.68 27.45 0.00 0.00 0.14 11 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 5.71 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 8.65 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.65 41.41 14.57 0.00 0.00 0.00 12 ER2a ExonRegion 0 0.88 1.67 0.75 0.85 0.00 0.00 0.55 0.00 2.31 2.14 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 0.00 2.30 5.38 26.68 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2b_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.26 0.00 0.00 0.00 16 I2 Intron 0 0.84 4.82 2.35 1.81 0.26 3.26 1.18 0.51 5.64 1.86 0.19 0.35 0.46 0.29 0.00 0.00 1.63 3.18 5.35 30.49 0.44 0.00 0.29 17 I2_SR1 SilentIntronRegion 0 0.84 4.84 2.36 1.81 0.27 3.27 1.18 0.51 5.66 1.87 0.19 0.35 0.47 0.29 0.00 0.00 1.64 3.19 5.37 30.61 0.44 0.00 0.29 18 E3_Ab NovelBoundary 0 0.00 5.46 1.48 0.00 0.00 11.58 2.25 1.64 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.52 27.80 0.00 0.00 0.00 19 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.78 3.19 0.00 0.00 0.00 20 ER3b ExonRegion 0 1.25 10.81 4.23 3.51 1.10 4.75 1.14 1.17 4.77 3.11 0.00 0.00 2.57 0.36 0.47 0.00 2.55 4.01 7.80 37.23 0.10 0.00 0.00 21 IG10 Intergenic 0 1.81 7.42 6.82 4.10 1.05 4.42 0.98 4.72 5.37 4.38 0.10 0.62 2.54 0.60 0.39 0.00 2.03 1.92 6.29 23.65 0.10 0.06 0.05 22 IG10_SR1 SilentIntergenicRegion 0 1.81 7.42 6.82 4.10 1.05 4.42 0.98 4.72 5.37 4.38 0.10 0.62 2.54 0.60 0.39 0.00 2.03 1.92 6.29 23.65 0.10 0.06 0.05