Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 TP53AIP1 Gene 0 0.99 1.65 2.28 2.27 1.70 2.19 1.43 1.59 1.95 1.02 0.19 0.21 1.15 0.25 0.83 0.69 0.38 1.80 2.15 1.89 0.30 0.65 0.34 2 458238 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 431649 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 263583 Transcript 0 0.08 1.27 2.72 3.33 1.49 2.40 0.79 1.41 2.38 0.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 1.88 2.07 0.92 0.07 0.20 0.00 5 310686 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.77 2.04 0.11 0.00 0.00 0.04 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.48 2.26 1.54 0.47 1.23 1.24 1.21 1.63 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 1.50 1.00 0.00 0.00 0.00 9 E2_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.03 0.00 3.40 0.00 0.00 0.00 1.30 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER2b ExonRegion 0 0.25 1.01 1.36 1.29 0.70 1.18 0.72 1.75 1.51 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.56 2.37 0.42 0.22 0.23 0.00 12 E2_Ab KnownBoundary 0 3.63 0.00 4.29 0.00 0.00 0.00 0.00 1.97 3.15 1.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 13 ER2c ExonRegion 0 0.61 0.90 5.27 0.12 0.00 1.69 1.06 0.33 0.93 2.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 1.96 0.00 1.65 0.00 14 E2_Db KnownBoundary 0 0.00 6.18 6.00 3.30 0.00 0.00 2.08 0.00 2.92 4.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E2b_E2d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2b_E2e KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER2d ExonRegion 0 0.00 0.82 2.37 3.05 1.03 2.51 1.04 1.37 2.88 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.21 1.88 1.10 2.34 0.00 0.35 0.00 18 ER2e ExonRegion 0 0.00 2.03 3.68 6.81 2.68 1.83 0.00 3.46 3.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.30 1.85 6.37 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER2f ExonRegion 0 0.00 1.98 4.43 5.64 2.74 3.52 0.62 1.12 2.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 2.19 2.75 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E2_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.08 8.82 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E2_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.42 4.03 0.00 0.00 0.00 6.16 4.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER2g ExonRegion 0 0.00 0.00 3.57 9.09 0.00 1.83 0.00 6.05 3.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.93 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER2h ExonRegion 0 0.85 0.69 3.95 3.38 3.88 0.64 1.14 2.95 2.82 1.00 0.18 0.00 1.03 0.01 0.29 0.71 0.12 2.85 1.99 0.59 0.53 0.21 0.30 24 E2_Dd KnownBoundary 0 987.73 1088.29 367.23 364.32 770.80 609.59 942.87 435.47 407.84 340.23 346.46 234.38 314.91 124.61 309.66 1033.15 776.53 639.54 806.99 974.16 572.00 456.31 1032.72 25 ER2i ExonRegion 0 10.30 9.87 3.21 3.05 8.25 8.12 8.27 2.93 2.09 2.34 2.22 2.55 13.74 3.13 10.17 8.14 3.08 2.76 6.62 11.99 2.36 4.94 4.08