Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 CCDC153 Gene 0 3.78 0.80 3.02 1.28 1.76 1.59 2.33 1.69 1.74 1.84 0.25 2.44 3.83 3.07 4.42 2.03 3.12 1.52 1.76 1.01 2.26 1.92 0.93 2 428856 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 375140 Transcript 0 1.96 0.00 2.82 0.59 0.24 0.66 0.71 1.29 1.36 0.87 0.19 0.00 0.00 0.85 0.99 1.16 0.32 0.42 0.56 0.21 1.49 1.48 0.70 4 447948 Transcript 0 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 5 415318 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 6.23 5.21 0.69 1.14 2.46 4.39 8.99 0.47 0.68 1.57 0.71 11.82 24.69 12.77 19.16 6.02 6.08 4.91 5.86 4.31 2.05 1.92 2.16 8 E1_Da NovelBoundary 0 274.64 332.44 550.25 623.33 237.10 205.28 310.95 476.05 396.61 399.68 86.65 135.94 116.55 93.12 118.18 215.84 200.75 467.51 248.01 565.41 373.63 112.49 223.22 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 1.33 0.90 2.87 1.38 6.17 2.21 1.14 1.03 3.83 3.92 0.00 0.00 0.00 2.69 0.32 2.69 4.05 2.10 1.28 0.00 0.87 2.31 0.00 11 E2_Ab KnownBoundary 0 3.78 0.00 4.44 3.76 8.06 0.00 0.00 0.00 3.53 3.92 0.00 0.00 0.00 0.00 4.94 3.42 9.54 1.95 0.00 0.00 0.00 4.65 0.00 12 ER2b ExonRegion 0 3.81 0.00 3.64 5.56 6.64 0.93 1.82 1.98 1.48 2.26 0.00 2.71 0.00 0.58 2.63 1.98 4.09 4.71 3.36 0.00 3.73 1.75 0.00 13 E2a_E3a KnownJunction 0 7.33 0.00 1.24 3.90 4.33 2.50 4.50 6.82 1.71 4.59 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 3.67 8.98 2.16 12.61 0.00 3.15 0.00 0.00 14 ER3a ExonRegion 0 5.18 0.00 2.85 2.62 7.29 1.98 2.65 3.43 2.68 2.85 0.56 5.53 0.00 3.06 1.37 1.53 8.64 0.51 3.10 0.00 2.17 0.82 0.00 15 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.15 0.00 0.00 16 E3a_E4a KnownJunction 0 7.11 0.00 3.19 1.86 8.15 5.17 0.00 1.64 2.81 4.16 2.68 0.00 5.84 2.24 0.00 0.00 3.93 0.00 0.00 0.00 3.15 6.25 0.00 17 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 0.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 18 ER4a ExonRegion 0 7.67 0.00 3.40 0.64 1.04 1.43 1.69 2.52 0.60 2.23 0.78 0.00 0.00 0.79 0.00 0.00 2.20 0.95 1.19 0.00 3.73 1.10 0.00 19 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.27 3.06 0.00 5.45 1.81 4.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 4.21 4.27 7.72 0.00 0.00 2.94 0.00 20 ER5a ExonRegion 0 5.82 0.00 1.24 2.49 2.27 1.71 0.67 2.41 1.09 0.53 0.00 3.21 0.35 1.15 1.69 0.00 0.39 0.60 3.90 0.90 2.22 1.02 1.37 21 E5_Da KnownBoundary 0 7.56 0.00 3.40 0.00 0.00 2.78 0.00 2.34 1.24 3.14 0.00 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 3.12 8.71 22 E5a_E5b KnownJunction 0 3.78 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 6.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 23 ER5b ExonRegion 0 3.92 0.00 5.64 1.19 0.48 1.31 1.41 2.59 2.73 1.74 0.38 0.01 0.01 1.70 1.97 2.32 0.64 0.84 1.11 0.41 2.98 2.96 1.40 24 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.00 0.00 3.14 0.00 6.18 0.00 0.00 3.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 25 ER5c ExonRegion 0 1.98 0.00 3.66 1.29 0.26 1.02 1.51 1.01 1.45 3.81 0.00 0.14 1.63 2.67 2.96 1.65 0.79 2.35 0.00 0.62 4.41 3.40 0.00 26 E5b_E6a KnownJunction 0 3.48 0.00 3.25 3.43 0.00 0.00 0.00 2.18 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 4.39 0.00 0.00 3.26 2.35 0.00 0.00 27 ER6a ExonRegion 0 3.38 0.00 5.16 0.87 0.00 0.71 2.06 2.30 2.30 2.53 0.00 1.26 3.01 1.60 5.29 1.16 6.43 0.00 0.00 1.59 2.37 3.02 1.14 28 E6a_E7a KnownJunction 0 7.26 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 6.60 0.00 0.00 5.44 0.00 13.93 0.00 0.00 3.00 3.09 2.76 0.00 29 ER7a ExonRegion 0 4.27 0.00 1.89 0.92 1.39 0.95 0.69 2.00 1.33 2.21 0.00 1.41 0.00 0.96 3.18 0.77 7.32 0.71 0.00 0.85 1.35 1.23 0.76 30 ER7b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00