Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 Z83001.1 Gene 0 6.30 1.43 2.27 0.66 3.04 0.00 2.51 1.53 0.60 2.50 0.73 5.70 2.82 1.88 1.39 3.86 3.57 1.59 2.93 1.61 0.72 0.00 0.48 2 429821 Transcript 0 2.27 0.00 0.64 0.00 0.76 0.00 0.52 0.00 0.00 0.90 0.66 2.17 1.37 1.06 0.00 1.26 0.98 0.37 0.91 0.00 0.28 0.00 0.00 3 434742 Transcript 0 0.00 0.47 0.00 0.47 0.61 0.00 0.63 0.00 0.85 0.78 0.00 1.81 0.00 0.00 0.00 3.41 3.03 0.00 0.00 4.40 0.00 0.00 0.00 4 454509 Transcript 0 6.76 2.24 2.92 0.81 2.94 0.00 2.24 2.58 0.55 1.54 0.19 2.29 0.39 0.40 2.57 3.57 0.99 2.18 1.59 0.64 0.22 0.00 0.59 5 ER1a ExonRegion 0 9.09 0.00 1.55 0.00 3.05 0.00 2.09 0.00 0.00 3.59 2.65 8.69 5.49 4.23 0.00 3.36 3.92 1.49 3.65 0.00 1.13 0.00 0.00 6 E1_Ab KnownBoundary 0 9.63 0.00 6.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.20 4.74 0.00 21.26 4.83 0.00 3.33 0.00 2.11 15.62 0.00 2.78 0.00 0.00 7 ER1b ExonRegion 0 4.05 0.55 1.89 0.54 2.96 0.00 3.20 0.00 0.49 4.39 1.30 6.52 4.05 3.59 0.00 2.50 4.43 0.96 6.92 1.14 1.01 0.00 0.79 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 E2_Aa NovelBoundary 0 13.93 0.00 0.00 1.73 0.00 0.00 2.16 0.00 1.79 0.00 0.00 7.35 0.00 0.00 0.00 3.50 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 3.61 0.00 0.00 0.01 1.80 0.00 1.33 0.86 0.00 0.66 0.00 9.51 6.48 2.20 0.04 0.00 5.54 0.06 1.07 0.00 1.48 0.00 0.00 11 E2_Da NovelBoundary 0 46.67 9.54 0.00 0.00 8.32 0.00 5.30 0.00 0.00 1.67 5.26 6.30 6.82 4.83 0.00 8.72 8.70 2.57 0.00 3.00 4.94 6.25 8.71 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 Ix_AR10 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 2.29 3.87 16.08 5.36 2.78 2.90 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix_AR9 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 2.29 2.58 28.86 7.04 3.25 0.97 2.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.71 3.28 1.93 35.25 17.42 1.62 0.00 5.94 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.11 0.00 3.71 4.59 0.00 29.07 30.15 1.62 0.00 5.94 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 1.29 0.00 0.00 0.73 3.47 0.00 7.50 0.00 2.04 3.17 1.10 19.43 21.72 1.99 0.38 2.72 5.46 0.00 0.00 2.94 0.00 0.00 0.00 20 E3_Aa NovelBoundary 0 3.33 0.00 0.00 5.26 0.00 4.43 0.00 0.00 5.87 4.43 0.00 18.91 13.64 4.94 0.00 3.67 8.70 0.00 0.00 9.14 0.00 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.93 0.00 0.93 1.23 0.00 1.26 0.00 1.69 1.56 0.00 3.63 0.00 0.00 0.00 6.83 6.07 0.00 0.00 8.80 0.00 0.00 0.00 22 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 2.50 0.00 5.96 3.74 0.00 4.24 0.00 4.05 4.35 2.16 0.00 6.82 0.00 0.00 12.48 4.58 2.03 0.00 5.88 0.00 0.00 0.00 23 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 33.94 4.81 5.28 5.35 2.81 0.00 6.96 4.74 2.90 3.59 1.52 3.01 1.02 0.35 4.08 12.50 7.81 3.38 2.51 0.00 1.16 0.00 0.00 24 E4_Aa NovelBoundary 0 13.71 2.89 4.91 6.86 3.57 0.00 7.68 8.91 2.60 4.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.55 0.00 3.36 0.00 0.00 0.00 0.00 3.16 25 ER4a ExonRegion 0 13.51 4.47 5.84 1.62 5.89 0.00 4.49 5.15 1.10 3.08 0.39 4.58 0.77 0.81 5.13 7.13 1.98 4.37 3.19 1.28 0.44 0.00 1.17 26 E4_Da NovelBoundary 0 37.34 5.00 11.53 4.43 0.00 0.00 12.23 6.37 6.92 4.73 0.00 0.00 12.50 2.47 0.00 0.00 0.00 5.06 3.58 3.13 0.00 0.00 0.00 27 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 40.33 3.73 4.72 2.79 7.08 1.18 6.09 4.83 5.66 6.97 0.00 4.47 1.74 0.47 0.66 4.73 6.48 0.00 2.86 4.50 0.71 0.00 1.57 28 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 12.36 5.57 6.43 6.61 9.78 0.41 6.72 8.37 5.62 8.88 0.67 10.01 8.84 0.18 2.58 3.94 5.71 0.71 2.70 3.90 0.26 0.00 0.97 29 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00