Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC129929.3 Gene 0 1.19 0.47 2.05 1.28 0.97 5.58 0.79 2.47 4.87 6.22 0.77 0.00 0.26 0.58 0.71 0.79 1.09 1.82 5.48 0.99 13.92 2.69 2.72 2 413483 Transcript 0 0.51 0.38 0.62 0.54 0.96 2.85 1.08 1.45 2.58 5.00 0.08 0.00 0.15 0.00 0.44 0.50 1.10 0.39 3.68 0.11 6.38 2.26 1.86 3 427151 Transcript 0 0.87 0.00 0.79 0.03 0.00 0.69 0.00 0.22 1.26 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.55 3.90 0.00 3.25 0.90 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.18 0.00 3.30 0.00 0.00 0.00 2.20 0.00 0.73 5 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.26 2.54 0.00 0.01 1.85 0.00 0.98 2.99 2.08 2.45 0.00 0.00 1.35 2.42 0.75 1.64 1.39 4.51 0.27 11.96 1.81 3.04 6 E1_Da NovelBoundary 0 169.96 156.49 852.31 538.39 141.00 258.49 73.71 476.95 315.42 656.37 420.37 81.03 72.88 445.35 453.43 341.62 421.13 327.56 272.38 418.59 3348.77 1501.08 1026.75 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 5.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 0.00 3.15 6.25 3.50 8 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 I1 Intron 0 1.58 1.73 4.10 2.62 0.55 5.92 2.07 0.88 3.13 5.35 0.72 0.48 0.00 1.69 1.20 0.61 1.80 8.31 3.90 7.74 9.29 0.28 2.80 10 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 2.09 1.20 3.16 3.01 0.66 5.34 1.70 0.76 3.73 4.73 0.95 0.18 0.00 1.55 1.54 0.59 0.98 8.39 3.30 7.88 10.22 0.41 3.48 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 1.90 1.71 1.90 3.73 4.27 3.72 1.49 6.14 7.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.54 0.00 1.90 0.00 1.27 4.00 2.48 12 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.01 0.00 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 2.78 0.00 0.00 13 E3_Aa NovelBoundary 0 6.08 0.00 2.37 0.00 7.47 0.00 0.00 0.00 3.10 5.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.79 4.14 2.43 18.35 9.19 13.06 14 ER3a ExonRegion 0 2.60 0.00 2.36 0.08 0.00 2.08 0.00 0.67 3.78 7.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 1.65 11.71 0.00 7.22 2.69 0.00 15 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.39 0.00 3.40 2.33 0.00 2.51 7.96 11.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 7.91 0.00 17.85 6.18 0.00 16 ER3b ExonRegion 0 2.59 1.61 2.81 1.55 1.06 7.68 1.37 4.61 7.54 11.44 0.00 0.00 1.53 0.53 0.81 1.20 1.31 2.61 5.75 1.68 27.66 6.09 3.48 17 E3_Da KnownBoundary 0 13.71 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 8.39 6.65 7.20 11.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.52 0.00 3.73 0.00 0.00 22.73 3.12 0.00 18 E3a_E3c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 19 ER3c ExonRegion 0 2.56 0.00 1.38 0.80 1.05 9.54 1.66 3.76 5.30 10.25 0.38 0.00 0.76 0.00 0.00 2.48 0.65 1.96 7.91 0.55 22.49 1.04 2.58 20 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 6.39 0.00 0.00 5.45 0.00 4.23 5.21 5.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 0.00 1.70 4.61 2.94 23.97 0.00 4.35 21 ER3d ExonRegion 0 1.12 0.37 1.87 2.43 1.23 6.76 0.37 2.93 5.36 5.70 0.18 0.00 0.00 0.49 0.00 0.06 0.91 2.28 4.79 1.90 11.69 3.07 2.85