Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 KRTAP5-3 Gene 0 0.00 0.00 0.10 0.11 0.07 0.10 0.00 0.07 0.05 0.33 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.09 0.00 0.18 0.06 0.16 2 435392 Transcript 0 9.03 10.09 42.21 13.80 3.48 19.17 3.56 26.36 11.13 29.90 1.29 0.00 0.00 0.41 0.72 0.00 0.69 28.54 8.19 35.03 2.82 0.52 1.35 3 359229 Transcript 0 3.08 0.91 22.35 8.56 0.99 4.37 0.59 21.89 7.78 22.51 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19.66 2.57 18.50 0.82 0.00 0.51 4 399685 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.53 0.18 0.30 0.00 0.18 0.01 0.63 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.46 0.14 0.03 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E1c KnownJunction 0 0.00 2.89 0.00 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.93 0.00 0.00 0.00 9 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 3.29 42.55 12.25 0.00 0.00 2.12 25.26 8.07 32.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.47 4.14 13.93 0.00 0.00 0.00 11 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1b_E1d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER1e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER1f ExonRegion 0 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1_Dc KnownBoundary 0 21.93 29.21 67.98 12.75 12.82 38.56 6.58 30.60 22.60 44.54 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22.14 13.08 40.33 3.03 0.00 4.35 18 E1c_E3d KnownJunction 0 33.04 51.24 119.60 39.42 3.74 84.44 12.59 95.95 33.88 104.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 80.96 14.02 77.21 3.15 0.00 0.00 19 ER1g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1d_E3f NovelJunction 0 3.33 0.00 7.86 5.36 0.00 0.00 0.00 24.56 8.13 17.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.35 0.00 0.00 2.47 0.00 4.01 21 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.42 0.55 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 0.00 1.37 0.43 0.00 24 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 25 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 E3a_E3c KnownJunction 0 10.74 3.22 14.37 13.29 3.48 5.34 2.12 31.34 8.54 22.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.29 3.76 18.60 0.00 0.00 0.00 28 ER3c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E3_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER3d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.03 1.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E3_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER3e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 33 E3_Db KnownBoundary 0 3.56 12.83 144.14 49.74 11.63 38.90 6.27 117.64 34.14 117.92 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 107.94 27.29 153.98 8.59 0.00 11.35 34 E3b_E3f KnownJunction 0 10.82 3.16 142.04 46.65 3.48 25.27 2.03 121.87 45.89 135.46 6.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 121.33 14.21 110.90 5.75 0.00 3.59 35 E3_Dc KnownBoundary 0 11.11 3.29 6.86 1.93 17.15 27.71 0.00 2.30 1.68 3.12 5.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.33 13.55 94.15 3.03 0.00 0.00 36 E3c_E3e KnownJunction 0 21.11 6.38 133.67 41.52 17.15 30.61 8.74 62.23 32.87 74.49 7.53 0.00 0.00 2.47 4.33 0.00 4.11 90.00 35.11 119.01 13.78 3.12 8.11 37 ER3f ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 38 E3_Ae KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 39 ER3g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 0.00 0.04 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 40 E3_Af KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 2.90 0.00 0.00 1.68 3.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 3.16 41 ER3h ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 1.24 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.94 42 ER3i ExonRegion 0 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.28 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 43 E3_Dd KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.66 0.00 0.00 44 ER3j ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E3_De KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 3.21 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER3k ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 IG3_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 5.22 26.70 1.69 19.29 19.62 26.19 2.10 57.56 21.09 49.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.00 4.91 4.89 0.00 0.00 0.00 48 IG3_SR2 SilentIntergenicRegion 0 9.30 43.99 1.43 31.33 20.74 29.21 2.79 86.03 22.38 58.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.03 3.16 4.51 0.00 0.00 0.00 49 IG3_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 6.92 30.59 3.58 9.96 45.49 79.73 6.06 42.95 9.03 30.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.13 1.04 4.87 0.00 0.00 0.00