Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AC009532.1 Gene 0 1.66 0.35 0.64 3.54 0.23 1.60 0.92 0.22 4.65 2.53 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.88 1.39 0.37 4.03 0.18 1.28 2 324928 Transcript 0 0.85 0.87 0.42 3.37 0.10 1.57 0.68 0.11 6.59 2.24 0.00 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.55 1.02 0.21 5.13 0.10 1.58 3 ER1a ExonRegion 0 1.59 0.60 0.34 1.28 0.50 1.60 1.00 0.45 4.35 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.60 0.00 3.07 0.00 1.78 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 2.06 0.00 2.90 0.00 0.00 15.60 1.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.11 0.00 3.76 5 I1_AR2 ActiveIntronRegion 0 92.81 0.00 1.71 5.01 20.96 0.47 8.00 9.87 2.51 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.89 1.50 6 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 57.50 0.18 0.80 1.96 15.59 0.32 5.71 3.16 1.45 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.28 0.19 0.00 2.79 1.29 7 I1_AR3 ActiveIntronRegion 0 66.36 0.00 0.67 1.96 17.86 0.46 7.02 2.90 2.53 1.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.00 0.00 3.75 3.30 8 I1_AR4 ActiveIntronRegion 0 31.75 0.00 0.41 1.36 7.14 0.00 5.00 0.00 0.00 1.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.08 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.40 0.83 6.56 0.00 1.98 2.41 0.08 6.79 4.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 2.90 0.00 6.61 0.00 2.39 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 1.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.35 0.00 11.65 0.00 0.00 1.94 2.34 9.81 8.78 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 2.11 0.00 0.00 11.55 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 2.66 0.00 0.92 4.87 0.00 1.38 0.00 0.00 3.85 2.24 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.00 0.46 1.60 1.07 3.88 0.52 0.00