Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-282I1.2 Gene 0 1.73 2.67 11.82 1.33 0.88 0.15 3.09 0.53 0.38 0.21 0.40 0.88 0.77 1.35 0.84 0.24 0.00 0.75 3.26 0.87 0.27 0.26 0.12 2 448347 Transcript 0 0.81 1.21 9.19 1.23 0.32 0.10 2.16 0.44 0.05 0.05 0.10 0.00 0.11 0.82 0.42 0.08 0.00 0.41 1.86 0.40 0.21 0.16 0.07 3 448671 Transcript 0 4.10 1.98 5.14 0.25 0.82 0.00 1.55 0.00 0.45 0.11 0.36 1.32 0.92 2.32 0.13 0.18 0.00 0.17 2.35 0.26 0.00 0.00 0.00 4 IG30_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 6.02 5.01 6.22 4.09 2.68 1.83 13.55 0.00 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 22.79 2.13 0.00 0.00 0.00 5 IG30_AR7 ActiveIntergenicRegion 0 6.35 7.98 3.20 4.09 2.68 1.69 17.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 2.97 0.00 0.00 16.42 2.13 0.00 0.00 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.51 0.72 1.44 0.00 3.55 1.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.13 0.00 1.18 0.00 0.00 7 E1_Da NovelBoundary 0 3.33 0.00 25.66 6.73 4.33 0.00 6.62 0.00 3.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.36 0.00 0.00 11.77 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.85 1.86 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 2.76 4.02 23.61 2.49 0.59 0.40 2.06 1.13 0.40 0.38 0.00 0.00 0.85 1.64 0.90 0.65 0.00 2.19 3.38 2.34 0.48 0.46 0.00 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 22.29 1.63 0.00 0.00 6.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 3.76 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 3.74 3.20 16.20 1.90 0.53 0.36 5.42 1.01 0.00 0.00 0.76 0.00 0.00 0.34 1.21 0.00 0.00 1.11 2.62 0.84 0.02 0.80 0.58 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 Ix Intron 0 3.02 5.15 24.11 2.17 1.81 0.65 2.98 0.09 0.85 0.24 0.00 1.05 0.14 0.27 0.51 0.00 0.24 0.98 4.21 1.59 0.00 0.30 0.00 14 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 3.36 8.00 22.79 2.73 2.43 0.41 3.41 0.29 1.03 0.38 0.00 1.20 0.00 0.13 0.69 0.00 0.74 1.23 1.43 0.95 0.00 0.47 0.00 15 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 6.35 6.42 17.72 0.00 4.08 1.48 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.00 0.93 0.00 0.00 0.00 0.00 5.81 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 4.56 11.54 18.70 0.00 1.20 1.61 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.69 6.70 3.01 0.00 1.33 0.00 17 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 2.06 4.50 32.59 1.60 2.48 2.30 4.96 0.00 0.00 0.28 0.00 0.44 0.81 0.73 0.61 0.00 0.00 1.95 9.06 2.38 0.00 0.55 0.00 18 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 3.15 2.36 25.29 1.43 1.20 0.00 2.61 0.00 0.97 0.31 0.00 0.65 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.78 5.05 1.91 0.00 0.00 0.00 19 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 2.56 3.58 23.09 3.52 0.05 0.00 2.03 0.00 1.98 0.00 0.00 1.98 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 3.00 2.09 0.00 0.00 0.00 20 I3_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.76 5.18 21.36 1.79 2.10 0.00 3.08 0.22 1.07 0.00 0.00 0.05 3.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.12 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 21 ER4a ExonRegion 0 1.77 4.46 7.17 1.29 0.00 0.00 2.16 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 1.49 1.96 0.00 0.00 0.00 1.02 0.68 0.67 0.03 0.00 22 E4a_E5a KnownJunction 0 7.56 2.43 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E4a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER5a ExonRegion 0 0.64 1.53 8.83 0.50 1.65 0.00 3.10 0.00 0.91 0.21 0.71 2.64 1.84 2.34 0.25 0.37 0.00 0.34 4.71 0.52 0.00 0.00 0.00 25 ER6a ExonRegion 0 0.00 2.44 1.10 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00