Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-109A6.3 Gene 0 18.94 10.16 23.78 9.88 23.96 18.08 21.87 15.20 15.47 9.70 2.69 1.94 3.49 2.40 4.05 7.06 5.98 15.19 24.74 13.04 4.03 3.46 7.08 2 430326 Transcript 0 7.44 4.26 16.56 4.17 10.69 9.51 8.67 8.23 10.55 4.87 0.86 0.62 1.11 0.80 1.29 2.48 1.90 8.17 14.17 5.47 1.69 1.29 2.46 3 IG21 Intergenic 0 3.34 0.76 4.76 1.58 3.83 6.90 5.51 5.36 6.63 2.94 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.04 0.00 6.83 16.60 3.12 1.11 0.54 0.79 4 IG21_SR1 SilentIntergenicRegion 0 2.92 0.31 3.64 1.00 4.10 4.82 4.06 3.38 7.90 1.76 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 6.88 19.13 3.74 0.56 0.00 0.45 5 IG21_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 4.60 0.76 5.18 1.08 2.66 9.42 5.54 4.90 10.26 3.86 0.00 0.00 0.00 0.95 0.00 0.00 0.00 7.42 31.34 3.82 3.11 1.32 0.31 6 IG21_SR2 SilentIntergenicRegion 0 3.44 0.89 4.42 0.88 6.45 2.96 3.38 6.23 10.06 4.72 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 6.12 22.01 2.98 2.36 0.00 1.34 7 IG21_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 2.63 0.56 2.31 0.66 2.00 4.59 2.92 6.83 6.69 3.04 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 4.76 16.73 2.80 1.63 0.53 2.00 8 IG21_SR3 SilentIntergenicRegion 0 1.10 0.73 4.44 0.97 3.09 8.82 4.30 3.84 6.90 2.89 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.00 6.54 16.02 2.47 1.12 0.86 0.94 9 IG21_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.96 0.93 2.00 0.46 2.83 8.22 6.31 4.75 10.67 3.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.84 18.15 1.58 1.00 0.24 0.67 10 IG21_SR4 SilentIntergenicRegion 0 3.98 0.59 4.25 1.69 3.28 5.70 5.71 5.59 5.79 3.01 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.03 0.00 6.85 15.59 3.44 0.87 0.47 0.63 11 IG21_SR5 SilentIntergenicRegion 0 5.89 2.42 7.67 2.89 7.41 10.10 8.51 6.93 6.60 4.83 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 8.44 17.06 2.88 0.00 0.40 2.78 12 IG21_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 5.41 1.59 14.90 4.47 11.48 15.72 9.78 13.39 10.25 1.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 9.62 19.62 3.00 1.38 0.33 0.46 13 ER1a ExonRegion 0 26.97 13.78 27.03 14.19 32.68 24.32 30.95 18.78 18.17 12.68 4.29 3.09 5.55 3.70 6.45 10.52 9.51 19.17 31.73 17.94 5.69 5.25 10.66 14 E1_Da NovelBoundary 0 10.67 9.60 17.03 10.55 20.03 5.28 8.08 1.85 3.12 7.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.86 34.92 3.26 0.00 0.00 0.00 15 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 11.38 1.56 3.23 5.22 0.00 0.00 1.16 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 13.74 0.00 0.00 0.00 0.00 16 I1 Intron 0 10.09 2.10 17.87 3.40 10.34 9.45 5.46 7.30 6.16 5.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.41 13.95 2.74 1.98 0.27 0.38 17 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 10.14 2.11 17.96 3.42 10.39 9.49 5.48 7.33 6.19 5.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.46 14.01 2.75 1.99 0.27 0.38 18 E2_Aa NovelBoundary 0 6.74 2.96 18.98 2.73 11.38 0.00 1.99 11.79 5.21 2.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.50 0.00 2.88 2.90 0.00 0.00 19 ER2a ExonRegion 0 4.22 2.88 17.13 2.36 7.19 14.09 5.08 6.92 10.51 3.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.33 11.81 4.55 1.88 1.19 0.00 20 E2_Da NovelBoundary 0 7.56 2.96 24.48 5.63 4.33 5.79 4.28 10.88 8.04 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 13.27 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 8.31 0.00 0.00 0.00 0.00 5.09 11.81 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E3_Aa NovelBoundary 0 3.78 0.00 17.42 5.46 12.14 5.62 12.19 2.34 1.45 1.67 0.00 0.00 0.00 2.30 0.00 0.00 0.00 7.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3a ExonRegion 0 6.00 4.66 18.94 2.72 10.33 3.90 7.31 10.35 11.13 5.38 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 1.87 0.00 7.96 13.55 4.86 0.87 0.00 1.62 24 IG22_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 13.42 2.05 27.60 5.21 12.87 7.69 8.82 8.47 17.54 10.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.13 20.74 8.45 2.55 0.73 3.56 25 IG22_SR2 SilentIntergenicRegion 0 20.44 0.70 37.87 7.87 12.93 10.99 11.93 9.59 20.60 6.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.48 0.00 26.88 32.74 9.73 0.74 2.77 2.70 26 IG22_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 8.08 2.02 15.49 1.91 8.98 3.59 4.57 5.93 6.33 2.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 7.14 11.06 5.19 1.31 1.11 2.03 27 IG22_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 12.45 2.53 13.47 2.68 14.62 1.69 8.10 4.91 8.95 4.71 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 5.15 14.68 3.83 1.17 0.27 0.77 28 IG22_SR4 SilentIntergenicRegion 0 6.06 2.89 9.65 2.57 10.76 4.54 6.13 6.02 8.61 4.82 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.02 0.00 6.42 14.09 3.97 1.29 0.49 1.15 29 IG22_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 10.87 3.71 10.52 1.64 9.76 3.25 3.69 5.44 7.34 4.63 0.00 0.00 0.00 0.14 0.00 0.08 0.00 4.91 8.89 3.55 0.46 0.71 0.38 30 IG22_AR10 ActiveIntergenicRegion 0 5.60 1.70 14.64 1.57 9.14 3.85 3.40 4.05 8.85 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 6.61 0.00 0.00 0.00 0.00 31 IG22_AR11 ActiveIntergenicRegion 0 1.25 6.72 16.99 7.91 23.37 12.51 8.18 6.29 6.71 6.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.29 11.52 0.73 1.10 0.00 0.00 32 IG22_SR8 SilentIntergenicRegion 0 5.57 3.69 15.98 3.39 19.88 17.25 5.24 2.12 4.79 5.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.54 10.14 0.69 0.00 0.00 0.00