Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PRAP1 Gene 0 1.98 0.84 10.72 1.48 2.22 0.96 2.34 1.07 1.72 0.89 0.60 1.56 1.62 1.68 3.68 2.01 2.40 3.48 5.79 2.21 1.72 1.73 3.20 2 433452 Transcript 0 1.11 0.53 5.39 1.22 0.70 0.00 1.24 0.67 1.36 0.00 0.31 0.00 0.00 0.51 0.83 0.00 0.66 0.19 0.83 0.00 0.20 0.00 1.54 3 415747 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 423766 Transcript 0 0.26 0.00 1.38 0.17 0.33 0.00 0.00 0.00 0.31 0.86 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 0.00 0.69 1.59 1.06 0.00 1.04 1.10 5 458230 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 368554 Transcript 0 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 6.37 0.00 0.73 0.00 0.00 7 463201 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.35 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER1a ExonRegion 0 1.11 0.53 5.39 1.22 0.70 0.00 1.24 0.67 1.36 0.00 0.31 0.00 0.00 0.51 0.83 0.00 0.66 0.19 0.83 0.00 0.20 0.00 1.54 9 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 8.99 1.73 0.00 0.00 2.25 0.00 1.50 0.00 2.68 0.00 0.00 2.47 4.45 0.00 4.11 2.07 0.00 0.00 2.97 0.00 0.00 10 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 5.05 0.87 0.00 0.00 0.33 0.00 2.30 2.05 0.45 0.00 0.00 0.44 1.77 0.00 0.47 3.83 6.48 0.00 2.20 0.00 0.00 11 E1a_E2b KnownJunction 0 0.00 0.00 8.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.25 29.93 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.46 6.37 0.00 0.73 0.00 0.00 13 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 4.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.31 0.00 0.00 0.00 2.07 1.58 0.00 0.00 4.34 8.59 0.00 1.64 1.61 0.00 14 E2_Da NovelBoundary 0 7.04 0.00 14.04 0.00 0.00 0.00 0.00 2.14 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 3.76 0.00 0.00 0.00 2.81 2.59 2.82 4.27 15 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.35 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.86 0.79 2.57 0.00 1.27 0.00 2.99 2.21 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 3.91 0.06 0.29 2.16 0.00 0.00 18 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 6.92 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 3.04 2.95 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 7.21 0.00 2.43 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.53 0.00 2.76 0.34 0.67 0.00 0.00 0.00 0.62 1.72 0.00 0.00 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 1.39 3.19 2.13 0.00 2.08 2.20 21 ER4b ExonRegion 0 2.98 2.94 17.14 2.31 2.37 0.88 1.75 1.24 1.41 1.11 0.00 0.00 0.00 0.23 4.49 0.00 0.00 4.51 12.86 1.83 3.18 2.44 5.29 22 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 26.55 1.60 3.31 0.00 4.11 2.55 4.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.72 0.00 0.00 8.21 16.85 0.00 2.97 3.12 11.69 23 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 22.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.63 1.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.08 8.09 2.56 0.00 0.00 0.00 25 ER4c ExonRegion 0 0.24 0.00 20.06 0.86 0.79 0.00 0.64 0.00 2.47 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 11.28 0.00 0.00 5.82 10.38 0.95 0.00 1.93 1.09 26 E5_Aa NovelBoundary 0 3.26 0.00 15.23 3.50 4.33 0.00 7.95 4.76 4.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.18 0.00 7.95 3.90 0.00 2.88 5.44 3.12 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 24.45 1.98 1.47 0.00 2.91 1.21 2.28 1.15 0.00 0.00 0.00 1.46 0.58 0.00 0.00 6.65 4.46 4.26 0.88 0.00 0.88 28 ER5b ExonRegion 0 0.00 0.00 24.18 2.73 2.68 0.00 3.97 1.73 0.37 1.49 0.97 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 2.09 6.65 1.27 3.55 4.19 0.97 3.13 29 ER5c ExonRegion 0 0.00 0.00 22.49 2.73 1.57 0.00 1.48 1.73 1.02 1.62 1.93 0.00 0.00 1.62 2.90 0.00 6.60 6.63 0.37 0.00 3.89 2.08 6.05 30 ER5d ExonRegion 0 1.02 0.44 17.85 2.37 2.32 0.50 2.16 1.57 2.32 0.61 0.58 1.55 0.00 2.41 4.60 1.86 2.12 5.27 6.18 2.61 0.54 1.13 4.59 31 E5_Dc KnownBoundary 0 9.19 0.00 11.06 2.70 0.00 2.50 1.59 2.46 0.00 2.12 1.90 0.00 0.00 2.47 0.00 3.16 0.00 0.00 4.52 13.68 0.00 2.39 4.35 32 ER5e ExonRegion 0 8.62 2.30 3.67 0.77 7.08 5.39 7.74 2.32 1.39 1.29 2.19 8.66 11.78 3.99 9.41 11.36 11.22 1.74 8.45 8.32 4.16 6.99 7.07