Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C10orf41 Gene 0 0.76 2.07 2.97 0.93 1.49 3.07 1.46 3.13 2.54 1.60 1.11 0.00 0.67 0.02 12.59 0.00 0.00 3.45 5.07 3.95 6.00 6.97 13.30 2 466942 Transcript 0 0.07 0.14 0.63 0.49 0.64 0.50 0.23 3.35 1.87 1.70 0.80 0.00 0.43 0.00 6.41 0.00 0.00 1.90 0.66 0.37 5.31 6.12 8.50 3 486015 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.11 0.00 0.00 0.44 1.03 1.37 0.36 3.16 3.53 4 425916 Transcript 0 0.05 0.73 0.95 0.46 0.34 0.56 0.68 1.12 1.71 0.52 0.23 0.00 0.47 0.00 4.31 0.00 0.00 0.83 2.31 1.61 0.97 2.18 3.82 5 484411 Transcript 0 0.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.94 0.70 6 491557 Transcript 0 0.00 3.18 0.82 0.00 0.00 6.80 1.04 1.06 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 8.46 0.00 0.00 0.47 6.71 0.49 3.41 2.33 5.03 7 ER1a ExonRegion 0 0.15 0.28 1.25 0.98 1.29 1.00 0.45 2.14 1.11 1.09 1.59 0.00 0.85 0.00 8.36 0.00 0.00 1.39 1.31 0.73 5.75 7.15 9.57 8 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.56 2.63 2.31 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 2.40 0.00 0.00 4.88 5.08 7.43 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.83 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.17 0.00 0.00 0.89 2.06 0.18 0.71 0.87 2.71 10 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 2.84 0.00 0.00 0.00 6.82 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 9.00 0.00 11 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.06 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 5.45 4.35 12 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 2.43 0.00 5.80 0.00 0.00 0.00 0.00 2.13 0.00 6.11 3.04 13 ER2c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.50 0.49 1.92 0.00 0.37 0.00 0.47 0.00 1.41 0.00 0.00 0.00 1.82 0.00 0.42 0.52 1.12 14 E2b_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER3a ExonRegion 0 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.89 1.40 16 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 17 ER3b ExonRegion 0 2.12 2.24 0.00 0.00 0.00 2.72 0.00 0.89 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00 1.01 3.50 0.00 0.00 1.21 0.00 0.00 1.06 0.93 2.94 18 ER3c ExonRegion 0 0.00 3.41 1.64 0.00 0.00 5.30 0.18 0.23 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 8.02 0.00 0.00 0.95 9.18 0.98 1.45 1.90 1.43 19 E3b_E4a KnownJunction 0 0.00 2.96 0.00 0.00 0.00 8.29 1.90 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.90 0.00 0.00 0.00 4.24 0.00 5.37 2.76 8.62 20 ER4a ExonRegion 0 1.14 2.90 1.72 0.00 0.83 7.14 1.56 3.44 5.98 4.83 1.17 0.00 1.19 0.00 20.10 0.00 0.00 4.03 7.28 7.45 11.46 9.79 23.76 21 E4_Da KnownBoundary 0 6.67 0.00 0.00 0.00 0.00 2.67 1.68 4.11 4.92 4.67 2.68 0.00 0.00 0.00 22.87 0.00 0.00 2.53 15.81 8.50 11.12 11.39 40.46 22 ER4b ExonRegion 0 3.18 5.00 3.79 0.71 3.96 10.66 2.90 3.66 4.60 2.45 2.96 0.00 0.00 0.00 25.79 0.00 0.00 8.28 9.49 9.17 10.09 10.59 26.55 23 E4_Db KnownBoundary 0 3.19 5.85 10.20 1.30 0.00 15.62 0.00 4.07 2.95 4.51 7.53 0.00 0.00 0.00 36.84 0.00 0.00 8.12 9.13 9.52 2.84 9.00 40.04 24 ER4c ExonRegion 0 2.17 5.06 11.32 2.72 3.59 6.78 3.72 6.44 3.95 2.89 2.40 0.00 0.75 0.00 31.74 0.00 0.00 9.77 12.14 8.74 13.79 16.47 36.86 25 E4_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 7.69 1.50 3.40 10.39 3.93 12.94 1.50 2.58 2.47 0.00 0.00 0.00 18.67 0.00 0.00 11.19 17.22 3.20 17.54 8.39 26.29 26 ER4d ExonRegion 0 1.20 3.17 5.36 0.95 2.37 3.95 2.34 7.47 2.68 2.52 0.89 0.00 0.68 0.00 21.40 0.00 0.00 6.31 7.14 6.31 11.35 7.63 14.82 27 E4_Dd KnownBoundary 0 0.00 3.09 1.69 0.00 0.00 0.00 2.16 3.57 2.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31.15 0.00 0.00 1.95 3.86 0.00 2.29 6.00 7.94 28 ER4e ExonRegion 0 0.16 2.20 2.85 1.38 1.01 0.97 1.55 2.86 3.20 1.56 0.31 0.00 0.94 0.00 7.08 0.00 0.00 2.50 5.11 4.83 2.50 6.01 10.36