Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 AGAP7 Gene 0 2.69 0.79 0.87 0.90 6.74 0.27 0.32 1.80 0.78 0.63 1.39 1.01 1.15 0.38 0.15 0.44 0.30 45.84 16.29 0.16 0.32 0.84 2.00 2 416142 Transcript 0 39.29 20.87 18.66 17.75 14.34 16.62 15.19 29.38 28.86 14.36 27.37 17.09 16.72 8.55 5.10 23.04 14.93 18.74 14.01 10.48 10.24 12.57 12.62 3 374095 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.40 0.00 0.34 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 2.06 1.92 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 5 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER1b ExonRegion 0 0.31 0.00 0.80 0.00 0.00 0.27 0.00 0.60 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 7 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.45 0.00 1.76 1.03 0.00 1.73 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 10 E2_Da NovelBoundary 0 15.34 13.48 35.92 19.48 4.41 8.86 4.50 36.97 38.25 20.04 10.69 0.00 8.28 0.00 6.43 8.72 4.77 23.55 4.89 9.91 3.15 0.00 4.35 11 E2a_E3a KnownJunction 0 310.28 163.85 146.06 142.04 110.70 129.87 121.49 233.30 228.79 112.95 216.11 136.69 125.48 62.81 40.79 184.31 119.40 149.90 101.27 83.86 77.84 100.55 100.98 12 E3_Aa NovelBoundary 0 25.93 13.29 23.51 30.80 3.99 13.86 4.59 25.34 46.50 33.79 16.27 0.00 0.00 0.00 6.30 17.60 9.35 36.93 4.52 9.33 9.45 6.25 12.55 13 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.46 0.00 2.29 1.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 3.62 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 2.82 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.69 2.17 0.00 0.00 0.00 0.00 3.19 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4b ExonRegion 0 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.83 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.88 0.00 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.21 6.43 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER7a ExonRegion 0 4.17 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER8a ExonRegion 0 5.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.88 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER9a ExonRegion 0 3.70 1.22 1.10 1.40 10.36 0.21 0.49 2.66 0.90 0.69 2.05 1.57 1.69 0.50 0.23 0.68 0.47 70.78 24.93 0.24 0.00 1.31 3.12 27 ER9b ExonRegion 0 3.66 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00