Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 PRF1 Gene 0 37.15 0.33 1.51 5.97 13.41 7.05 2.96 10.63 19.16 2.17 1.17 5.19 1.72 3.67 1.10 38.23 0.27 0.00 0.06 0.09 0.18 0.34 0.00 2 441259 Transcript 0 2.84 0.00 0.00 0.03 0.00 1.97 0.00 0.54 1.46 0.15 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 2.04 1.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 318971 Transcript 0 6.52 0.00 0.00 1.70 0.00 2.67 0.00 8.50 16.64 3.89 0.00 7.65 0.00 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 373209 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 473106 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 IG3_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.20 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.57 0.00 0.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 14.68 0.46 6.31 7 IG3_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.24 0.00 11.75 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.79 0.76 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 1.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 18.47 0.00 0.00 2.49 9.46 5.92 1.74 4.26 9.89 3.44 2.59 2.47 0.00 3.21 0.00 38.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E1a_E2a KnownJunction 0 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1a_E2b KnownJunction 0 6.52 0.00 0.00 1.70 0.00 2.67 0.00 8.50 16.64 3.89 0.00 7.65 0.00 0.00 0.00 7.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E1a_E2c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E2_Aa NovelBoundary 0 20.23 0.00 0.00 0.00 3.90 0.00 0.00 0.00 11.31 0.00 2.11 0.00 0.00 0.00 0.00 16.32 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 14 ER2a ExonRegion 0 2.19 0.00 0.00 0.05 0.00 1.22 0.00 1.09 2.93 0.30 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 4.07 2.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2b ExonRegion 0 7.94 0.00 0.00 1.36 0.00 2.75 0.00 8.64 16.98 4.87 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 14.86 3.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2c ExonRegion 0 10.34 0.00 1.38 1.67 4.13 5.08 0.25 6.70 15.55 2.32 0.92 4.36 1.94 3.36 0.55 29.59 0.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E3a KnownJunction 0 21.49 0.00 0.00 5.06 8.23 0.00 0.00 14.21 28.04 1.13 0.00 6.30 6.82 2.30 0.00 53.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 21.23 0.00 0.85 5.47 8.11 4.97 1.56 10.37 20.91 1.84 0.98 5.10 1.35 5.40 2.24 52.64 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3_Ab KnownBoundary 0 16.74 0.00 2.48 3.90 3.74 5.22 2.12 24.89 22.11 4.19 0.00 5.70 0.00 4.94 5.07 67.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER3b ExonRegion 0 11.38 0.00 5.98 7.86 3.32 4.68 1.00 17.04 25.11 3.53 3.52 2.59 0.00 4.15 1.17 45.62 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 21 E3_Da KnownBoundary 0 10.00 0.00 10.41 8.96 0.00 0.00 0.00 18.85 24.22 2.95 0.00 12.60 0.00 4.59 0.00 48.19 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 22 E3a_E3c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER3c ExonRegion 0 45.55 0.41 1.20 6.85 15.52 7.36 4.08 12.17 21.34 1.83 1.16 4.15 2.27 4.32 1.24 40.82 0.28 0.00 0.00 0.04 0.19 0.72 0.00 24 E3_Ac KnownBoundary 0 127.87 17.17 18.63 34.83 43.04 8.35 9.89 36.72 71.21 24.28 0.00 12.00 6.49 0.00 4.45 45.54 4.11 6.59 3.86 2.62 0.00 2.51 0.00 25 ER3d ExonRegion 0 66.70 0.79 2.06 10.09 25.51 10.73 4.71 12.41 19.96 2.46 0.68 11.04 1.12 2.19 1.53 40.44 0.00 0.00 0.00 0.25 0.52 0.00 0.00 26 ER3e ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00