Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 STOX1 Gene 0 6.04 6.45 15.83 6.93 10.09 29.51 14.97 6.18 7.25 1.44 2.84 2.73 1.51 2.57 1.25 0.08 0.28 22.71 15.46 13.31 0.06 2.32 1.09 2 399159 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 3 298596 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 399169 Transcript 0 0.28 0.00 3.46 0.00 0.71 3.18 1.41 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.27 0.00 0.00 0.61 0.00 1.14 0.00 0.56 0.00 5 399165 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.16 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 399162 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 421961 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 1.63 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 2.31 0.00 0.00 0.00 10 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 11 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.56 0.00 0.08 0.00 0.35 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 2.55 0.22 1.28 0.00 0.00 0.00 12 E1_Ad KnownBoundary 0 3.04 0.00 0.00 0.00 0.00 7.67 0.00 1.64 0.00 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.38 3.76 3.13 0.00 0.00 0.00 13 ER1d ExonRegion 0 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 8.81 3.59 1.25 0.00 0.32 0.36 0.05 0.00 2.07 2.49 0.00 0.00 7.37 5.01 1.29 0.00 0.00 0.00 14 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 6.18 0.00 0.00 0.00 0.00 6.01 0.00 0.00 1.50 2.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.55 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 4.23 4.67 12.23 2.03 2.80 18.49 8.68 3.52 6.43 2.20 4.14 3.79 1.29 5.22 2.01 0.00 1.57 27.12 16.99 13.66 0.00 4.17 2.28 16 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 15.70 0.00 3.90 21.07 6.01 1.89 7.41 1.21 2.26 0.00 0.00 0.00 9.64 0.00 4.77 16.75 21.46 2.88 0.00 0.00 4.10 17 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 1.27 3.21 13.23 2.43 7.09 29.39 13.34 7.97 7.50 2.49 2.58 8.77 0.98 4.35 1.77 0.00 0.48 28.70 13.71 15.11 0.00 3.42 3.16 19 E3_Da KnownBoundary 0 3.63 6.51 9.55 3.76 7.47 12.66 10.29 11.67 6.37 4.32 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 42.41 0.00 12.53 0.00 3.12 7.34 20 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.16 0.00 1.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3b ExonRegion 0 5.40 5.64 14.48 6.60 8.21 32.51 15.54 7.46 8.15 1.94 3.28 3.29 3.06 3.00 0.17 0.26 0.53 37.71 20.40 16.12 0.00 1.85 1.53 22 ER3c ExonRegion 0 4.48 14.12 11.68 11.46 6.14 37.97 9.03 10.37 2.98 4.66 0.00 3.31 2.21 8.22 1.88 2.97 0.00 32.61 27.92 20.53 0.00 2.70 0.00 23 ER3d ExonRegion 0 8.75 8.51 21.84 9.89 14.09 42.11 20.32 8.28 9.76 1.79 3.75 1.98 1.75 3.36 1.86 0.06 0.22 28.45 20.56 16.78 0.15 2.70 0.99 24 E3c_E4a KnownJunction 0 23.78 6.51 21.91 3.36 18.25 56.05 34.71 4.64 8.36 2.34 2.68 6.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11.03 8.28 17.77 0.00 2.33 0.00 25 ER4a ExonRegion 0 12.31 12.66 30.41 13.26 22.85 35.05 20.89 5.37 6.82 0.54 4.22 4.66 1.06 1.14 1.13 0.00 0.00 11.16 21.45 14.25 0.00 3.87 1.87 26 E4_Da KnownBoundary 0 19.93 8.95 18.63 10.79 15.70 38.16 19.48 4.64 6.19 0.00 7.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.90 13.74 11.31 0.00 0.00 4.10 27 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER4b ExonRegion 0 5.59 8.56 10.46 7.68 10.89 11.18 13.84 4.99 7.80 0.30 1.23 5.03 0.69 0.00 1.10 0.00 0.00 0.74 3.53 10.09 0.00 2.58 0.35 29 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER5a ExonRegion 0 0.57 0.00 5.09 0.00 1.43 6.37 2.83 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 1.23 0.00 2.27 0.00 1.11 0.00