Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-445N18.3 Gene 0 0.63 0.15 0.00 0.30 0.53 3.47 0.85 0.25 0.63 0.46 0.00 0.33 1.41 0.33 0.86 0.44 0.16 0.38 0.47 0.31 0.33 0.31 0.29 2 450224 Transcript 0 0.80 0.00 0.00 0.11 1.16 1.25 0.21 0.67 0.00 0.37 0.00 0.39 0.60 0.58 1.00 0.48 0.36 0.15 1.03 0.23 0.24 0.34 0.48 3 423875 Transcript 0 0.11 0.04 0.00 0.46 0.59 1.67 0.95 0.10 0.21 0.29 0.00 0.00 0.58 0.00 0.69 0.11 0.00 0.87 0.00 0.34 0.00 0.87 0.26 4 448600 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E2_Aa NovelBoundary 0 248.19 309.62 229.94 319.54 399.07 228.90 358.82 362.72 241.09 259.94 73.97 41.41 81.49 64.22 111.13 279.76 217.77 310.24 287.82 210.73 117.87 91.54 333.00 8 ER2a ExonRegion 0 6.42 0.00 0.00 0.88 4.20 3.68 1.72 1.55 0.00 2.95 0.00 3.08 4.77 4.62 7.97 3.85 2.85 1.19 8.26 1.84 1.90 2.70 3.81 9 E2_Da NovelBoundary 0 14.08 28.94 70.31 50.34 7.56 8.18 43.15 42.84 51.30 38.04 12.58 0.00 0.00 4.59 16.94 32.81 45.07 51.98 19.20 41.93 18.16 5.45 16.82 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.24 2.73 0.00 2.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 2.08 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E4a_E5b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER5a ExonRegion 0 0.33 0.11 0.00 0.46 0.15 2.93 1.12 0.29 0.62 0.48 0.00 0.00 1.74 0.00 0.81 0.33 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.12 0.00 16 E5_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E5_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5b ExonRegion 0 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 5.87 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5c ExonRegion 0 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 1.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E5_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E5a_E5d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 E5_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER5e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.59 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E5b_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.88 0.00 0.00 2.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER6a ExonRegion 0 0.10 0.08 0.00 0.00 0.00 11.50 0.18 0.00 1.90 0.11 0.00 0.64 1.95 0.28 0.00 0.10 0.00 0.29 0.00 0.44 1.06 0.00 0.00 27 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.36 1.83 3.90 5.39 7.99 4.52 5.12 0.00 2.42 0.00 13.96 0.00 0.00 0.00 0.00 6.47 0.00 0.00 0.00 0.00 3.84 28 ER6b ExonRegion 0 3.23 3.17 0.00 1.29 6.12 4.76 7.54 0.00 1.32 2.29 0.00 2.64 5.25 1.16 1.43 2.17 0.00 6.45 0.00 1.44 3.21 2.33 2.14 29 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.91 1.61 1.28 1.72 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 0.00 0.00 2.16 0.00 0.78 0.00 2.50 0.78