Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-18M11.2 Gene 0 1.44 0.57 0.90 0.53 1.24 1.81 0.53 1.39 1.96 0.16 0.27 0.17 0.25 0.08 0.14 0.05 0.51 0.14 0.39 0.39 0.95 0.35 0.00 2 450287 Transcript 0 0.67 0.24 0.28 0.33 0.64 0.51 0.25 0.67 0.93 0.09 0.11 0.15 0.22 0.09 0.17 0.04 0.60 0.03 1.03 0.42 0.37 0.11 0.00 3 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 2.28 0.00 0.00 0.00 0.00 4 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.56 0.00 0.00 0.00 0.00 5 I1 Intron 0 0.43 0.41 0.00 0.62 0.00 0.19 0.00 1.30 1.86 1.04 1.76 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 16.67 0.00 1.61 0.00 1.78 0.42 0.00 6 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.44 0.42 0.00 0.63 0.00 0.19 0.00 1.32 1.89 1.05 1.79 0.00 0.00 0.55 0.00 0.00 16.96 0.00 1.64 0.00 1.81 0.43 0.00 7 Ix Intron 0 0.10 0.09 0.13 0.19 0.06 0.55 0.03 0.12 0.68 0.00 0.13 0.33 0.00 0.31 0.00 0.00 20.88 0.00 0.00 0.10 0.10 0.05 0.00 8 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.11 0.11 0.15 0.22 0.07 0.63 0.04 0.14 0.73 0.00 0.15 0.38 0.00 0.35 0.00 0.00 21.18 0.00 0.00 0.11 0.12 0.06 0.00 9 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 1.92 0.00 0.90 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.47 0.83 0.00 8.03 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER3a ExonRegion 0 1.52 0.74 1.03 0.50 1.72 1.86 0.70 2.73 2.49 0.21 0.47 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.27 0.22 0.26 0.57 1.25 0.59 0.00 13 E3a_E4a KnownJunction 0 3.56 0.00 1.12 0.00 3.57 0.00 0.00 3.86 1.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.26 0.00 0.00 0.00 14 E4_Aa NovelBoundary 0 6.22 17.37 44.94 73.15 3.31 2.38 19.25 61.69 49.54 48.54 7.00 0.00 6.33 4.24 6.18 3.59 25.15 22.84 12.33 74.02 2.35 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 2.78 2.54 0.79 0.84 3.45 1.14 1.10 2.12 2.58 0.71 1.20 2.18 3.37 0.83 0.42 0.62 0.68 0.00 1.98 1.95 3.19 0.86 0.00 16 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 2.96 14.81 8.06 0.00 0.00 3.97 6.86 24.22 10.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.85 0.00 4.39 4.24 0.00 0.00 0.00 3.84 17 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER5a ExonRegion 0 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.31 0.00 0.86 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.51 0.00 0.00 19 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E6_Da NovelBoundary 0 7.04 18.94 5.62 14.25 19.19 7.72 27.34 17.70 10.36 7.98 4.69 12.15 0.00 0.00 0.00 3.67 3.83 2.16 4.05 22.69 0.00 2.57 0.00 22 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER8a ExonRegion 0 1.77 0.27 1.28 0.71 0.94 2.66 0.35 0.45 2.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00 0.16 0.00 0.00 0.58 0.18 0.00