Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 C1QL1 Gene 0 3.72 1.20 0.75 1.45 28.88 24.91 16.14 42.05 29.05 65.66 0.55 2.03 2.42 0.43 0.76 3.59 2.84 1.13 23.26 0.00 0.81 7.76 0.60 2 298943 Transcript 0 0.00 0.06 0.00 0.00 1.48 1.78 1.90 11.67 3.59 25.68 0.16 0.00 0.00 0.14 0.06 0.00 0.00 0.07 10.44 0.00 0.00 0.06 1.54 3 443738 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 448557 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 IG21 Intergenic 0 0.70 0.48 0.15 0.29 11.91 2.45 3.77 22.23 2.49 25.83 0.08 0.20 0.35 0.13 0.38 0.27 0.31 0.16 1.85 0.14 0.12 0.19 0.29 6 IG21_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 1.00 0.35 0.57 1.39 36.94 13.69 8.07 113.66 9.10 111.17 0.23 0.88 0.00 0.48 0.49 0.71 0.00 0.00 4.24 0.00 0.00 0.00 0.79 7 IG21_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.81 0.35 0.12 0.43 22.28 3.66 6.65 45.79 3.89 45.45 0.14 0.33 0.40 0.09 0.50 0.43 0.40 0.07 3.17 0.00 0.02 0.19 0.24 8 IG21_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.89 0.00 0.00 0.00 19.03 4.32 8.66 27.21 2.13 45.48 0.00 1.11 0.00 0.00 1.44 0.42 0.00 0.00 2.76 0.31 0.00 0.29 0.00 9 IG21_SR3 SilentIntergenicRegion 0 1.43 0.82 0.00 0.51 41.43 7.99 13.24 65.72 5.94 82.26 0.15 0.18 0.60 0.16 1.19 0.30 0.99 0.14 4.08 0.05 0.33 0.63 0.07 10 IG21_AR4 ActiveIntergenicRegion 0 0.57 0.27 0.00 0.41 44.28 8.11 17.63 75.24 8.21 113.15 0.52 0.00 1.23 1.19 0.00 0.90 0.00 0.73 5.26 0.00 0.00 0.00 1.19 11 IG21_SR2 SilentIntergenicRegion 0 0.57 0.54 0.00 1.23 47.31 14.54 19.36 86.12 9.37 131.09 0.63 0.00 4.71 0.95 0.27 0.88 1.77 0.01 6.80 0.00 0.00 0.56 1.18 12 IG21_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.62 0.59 0.33 0.39 19.86 7.78 9.55 51.41 7.03 74.26 0.11 0.00 0.57 0.00 0.29 1.31 0.78 0.00 7.54 0.00 0.00 0.20 0.00 13 IG21_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.48 0.70 0.01 0.00 17.73 6.32 6.89 33.22 4.74 58.36 0.07 0.14 0.29 0.28 1.15 0.00 1.20 0.00 5.27 0.00 0.50 0.00 1.90 14 IG21_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.25 0.24 0.00 0.00 16.32 9.21 8.12 26.77 4.19 42.14 0.00 0.00 0.00 0.32 0.29 0.00 0.00 0.00 2.68 0.00 0.00 0.00 0.71 15 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.11 0.00 0.00 1.89 1.61 1.01 13.51 3.94 26.28 0.31 0.00 0.00 0.29 0.13 0.00 0.00 0.15 5.14 0.00 0.00 0.11 0.32 16 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.16 2.27 0.00 32.20 18.49 77.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17.22 0.00 0.00 0.00 0.00 17 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 4.49 0.34 25.14 7.88 44.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.83 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E1_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 0.00 24.93 1.33 22.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.80 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E1a_E1d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E1_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.07 4.54 21.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E1b_E1c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 1.83 1.32 22.47 5.56 37.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.37 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.07 1.94 2.78 9.83 3.23 25.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15.74 0.00 0.00 0.00 2.77 24 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 5.11 0.00 11.09 2.66 27.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35.77 0.00 0.00 0.00 7.43 25 ER1e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 1.65 0.75 5.96 3.56 23.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26.54 0.00 0.00 0.00 2.07 26 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 1.94 17.29 12.88 29.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.71 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER1f ExonRegion 0 0.00 0.56 0.02 0.00 16.45 19.24 4.52 41.32 26.06 75.38 0.00 0.00 0.00 0.24 0.00 0.54 0.04 0.50 24.97 0.00 0.12 0.02 0.53 28 E1_Dc NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 20.80 13.80 11.26 8.09 0.00 7.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.33 0.00 0.00 0.00 0.00 29 E1c_E2a KnownJunction 0 0.00 3.35 0.00 0.00 28.44 5.51 8.92 41.94 51.62 99.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.66 0.00 2.84 0.00 0.00 30 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 9.21 0.42 0.93 3.68 9.63 3.50 15.91 1.66 1.60 1.19 1.01 3.18 1.76 0.90 1.08 3.76 2.70 0.59 1.08 0.00 0.41 8.76 0.18 31 I1_SR2 SilentIntronRegion 0 14.48 0.49 1.95 3.05 11.15 4.46 13.41 2.19 2.06 1.66 1.16 1.59 2.41 0.69 1.10 6.14 5.09 0.83 2.13 0.00 1.34 9.17 0.54 32 E2_Aa NovelBoundary 0 10.67 0.00 0.00 5.16 11.63 0.00 28.00 0.00 3.53 1.64 0.00 0.00 13.64 0.00 0.00 4.19 9.35 0.00 0.00 0.00 12.11 2.94 0.00 33 ER2a ExonRegion 0 9.61 2.84 1.93 3.75 67.47 56.10 39.07 77.60 61.70 110.48 1.12 5.24 6.25 0.76 1.83 9.11 7.32 2.62 42.65 0.00 2.07 19.92 0.78