Order SeqName SeqType IsAE NBL01_MYCN NBL05_MYCN NBL09_MYCN NBL10_MYCN NBL02 NBL03 NBL04 NBL06 NBL07 NBL08 NBL11_Rel2 NBL11_Rem1 NBL11_Rel1 NBL12_Rel_Left NBL12_Rel_Right NBL13_Rel_Left NBL13_Rel_Right NBL14_MYCN_Met NBL14_MYCN_Pri NBL15_MYCN_Rel1 SKP01 SKP02 SKP03 1 RP11-397P14.1 Gene 0 2.34 1.16 0.61 0.61 1.17 0.98 2.04 1.12 0.49 0.17 0.06 0.29 0.39 0.54 1.21 1.00 0.44 0.68 0.53 2.07 0.59 0.21 0.79 2 281339 Transcript 0 2.06 0.73 0.24 0.15 0.84 0.57 1.94 0.44 0.16 0.02 0.09 0.19 0.52 0.73 1.25 1.33 0.59 0.29 0.57 1.34 0.79 0.28 0.59 3 432950 Transcript 0 0.34 0.59 0.44 0.16 0.00 0.66 0.00 0.21 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.80 0.00 0.34 0.00 0.00 0.24 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.28 0.00 0.00 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.17 0.26 0.00 0.00 0.00 9 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.61 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.72 0.00 1.48 0.00 0.73 6.14 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 2.17 0.00 0.00 0.00 11 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.62 0.81 1.67 0.00 1.56 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00 13 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 2.31 0.00 0.04 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.51 0.00 0.00 0.00 15 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER6a ExonRegion 0 0.00 1.37 3.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER7a ExonRegion 0 1.70 2.43 2.22 0.82 0.00 1.47 0.00 1.03 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.00 0.00 4.02 0.00 1.71 0.00 0.00 1.18 20 E7_Da NovelBoundary 0 0.00 8.68 13.54 3.60 4.33 5.34 8.48 0.00 1.79 4.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.31 0.00 8.69 0.00 0.00 4.27 21 E7a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER8a ExonRegion 0 9.47 6.39 1.63 0.00 7.18 4.92 13.03 0.00 0.82 0.00 0.86 1.94 5.18 7.27 11.15 13.30 5.91 2.48 2.85 10.56 7.89 2.80 5.26 23 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 ER9a ExonRegion 0 0.00 1.89 0.00 0.93 2.55 0.00 1.28 0.00 0.00 0.79 0.00 2.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 1.88 0.00 0.00 0.00 25 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER10a ExonRegion 0 5.37 0.62 0.00 2.50 0.77 0.56 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 0.00 0.98 0.65 0.00 0.00 0.90 27 E10a_E11a KnownJunction 0 3.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER11a ExonRegion 0 1.73 1.23 0.00 0.11 0.00 2.17 1.82 0.00 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 2.61 0.00 0.00 1.80 29 E11a_E12a KnownJunction 0 6.45 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E11b_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 1.83 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER12a ExonRegion 0 4.12 0.00 1.16 1.36 0.00 0.00 1.32 1.82 0.52 0.88 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E12_Da KnownBoundary 0 2.82 0.00 1.83 2.06 0.00 2.33 0.00 6.74 1.36 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.42 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER12b ExonRegion 0 4.72 0.91 0.21 0.19 1.20 0.82 2.67 2.58 0.74 0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.41 0.71 0.95 0.00 0.00 0.66