Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	Z83843.2	Gene	0	10.09	28.00	13.72	6.96	8.39	14.44	8.15	3.12	16.96	13.80	7.48	10.63	3.59	21.44	23.85	29.68	45.19	13.26	14.65	8.43	9.66	4.81	5.11	21.69	11.47	10.92	10.92	15.94	7.76
2	500433	Transcript	0	3.69	11.13	5.00	2.54	3.06	5.56	2.97	1.40	7.78	5.65	2.84	4.14	1.68	7.82	10.07	10.88	17.24	4.83	6.03	3.07	4.13	1.75	1.86	8.21	4.38	4.21	4.18	6.39	3.58
3	IG50	Intergenic	0	1.79	3.63	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.22	4.75	3.28	0.57	1.62	1.39	0.00	6.14	1.48	3.57	0.46	0.38	0.33	4.77	0.22	0.00	1.54	0.34	0.56	0.00	3.70	1.52
4	IG50_SR1	SilentIntergenicRegion	0	3.00	3.12	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.40	4.79	3.20	0.48	2.37	1.68	0.00	7.91	1.62	2.94	0.48	0.00	0.60	5.96	0.00	0.00	1.87	0.00	1.03	0.00	4.60	1.17
5	IG50_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.34	4.27	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	4.72	3.38	0.68	0.72	1.04	0.00	4.03	1.32	4.33	0.44	0.84	0.00	3.36	0.48	0.00	1.15	0.76	0.00	0.00	2.64	1.94
6	ER1a	ExonRegion	0	0.04	3.04	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.87	5.30	2.05	0.36	0.87	1.23	0.03	4.56	0.21	2.53	0.00	2.26	0.00	2.02	0.00	0.00	1.02	0.67	0.74	0.67	1.92	2.47
7	E1_Da	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	6.73	0.00	0.00	1.87	5.86	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	5.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1	Intron	0	0.93	3.68	0.48	0.32	0.89	1.44	0.56	0.37	4.83	3.54	1.20	2.75	1.68	0.89	7.32	2.00	6.34	0.46	1.55	0.48	5.31	0.32	0.47	2.46	1.21	1.88	1.95	3.30	1.61
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.58	5.05	0.00	0.00	0.44	0.37	0.00	0.00	3.25	1.42	0.32	1.72	0.18	0.25	2.84	0.16	1.81	0.00	1.05	0.42	5.03	0.00	0.16	0.88	0.45	0.21	1.08	1.25	0.27
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.60	1.99	0.16	0.00	0.00	1.28	0.00	0.69	2.52	5.06	1.25	1.36	0.55	0.00	2.89	0.40	2.53	0.18	3.20	0.16	5.09	0.00	0.66	0.00	0.27	1.20	0.00	5.14	0.74
12	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.87	3.94	0.53	0.00	0.00	1.68	0.00	2.25	5.44	3.94	0.35	1.79	1.98	0.20	6.18	0.26	2.72	0.00	1.67	0.00	3.90	0.74	0.04	0.86	0.32	5.21	4.48	2.71	1.27
13	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.40	3.34	0.67	0.00	0.80	0.72	0.20	0.30	5.18	3.67	0.74	3.01	0.67	0.34	4.64	0.63	2.61	0.13	1.23	0.45	6.01	0.24	0.30	0.64	0.96	1.80	1.14	3.54	0.69
14	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.66	3.43	0.10	0.00	0.00	0.24	0.35	0.00	5.07	2.50	1.05	1.84	1.93	0.32	5.25	2.47	4.49	0.24	1.69	0.00	3.41	0.53	0.00	0.63	0.75	2.29	0.75	4.11	1.01
15	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.06	2.11	0.00	0.00	0.00	0.92	0.17	0.47	2.82	2.26	0.20	1.89	1.86	0.38	4.19	1.47	3.58	0.33	0.81	0.00	4.04	0.00	0.77	0.84	0.59	1.47	0.78	1.91	1.06
16	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.92	3.92	0.28	0.00	0.00	1.73	1.18	0.00	3.72	0.67	1.10	2.92	0.59	0.80	5.73	1.25	4.14	0.38	1.86	0.46	5.18	0.00	0.46	0.43	0.74	0.21	4.46	2.81	1.27
17	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.49	2.71	0.00	0.00	1.12	0.96	0.46	0.00	2.82	2.32	0.68	2.23	0.53	0.56	1.79	0.91	3.92	0.35	1.11	0.32	8.16	0.21	0.00	1.24	0.82	1.21	0.63	2.30	1.44
18	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.29	0.60	0.23	0.49	0.67	1.51	0.69	0.00	1.47	2.86	0.98	2.37	0.91	0.13	4.30	0.86	3.73	0.00	0.95	0.76	7.18	0.00	0.12	1.61	0.49	0.75	1.01	3.53	0.87
19	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	0.80	2.57	0.16	0.00	0.46	2.64	0.47	0.60	4.16	2.58	1.90	2.51	1.77	0.70	6.16	0.23	5.58	0.36	1.30	0.26	5.26	0.00	0.43	1.32	0.00	3.33	2.49	2.80	1.22
20	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.68	0.00	0.53	0.00	6.19	1.74	0.00	0.00	2.48	2.74	0.38	0.98	1.63	0.29	9.29	2.36	1.89	0.00	1.01	0.87	2.26	0.00	0.00	2.73	0.45	1.99	0.00	5.16	0.43
21	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	1.68	0.00	0.66	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	1.98	2.21	0.47	0.72	2.54	1.24	9.39	0.97	0.00	0.00	1.25	0.00	2.18	0.00	0.71	1.69	0.56	1.85	0.00	5.12	2.35
22	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I1_SR6	SilentIntronRegion	0	1.26	2.15	0.00	0.00	9.62	0.87	0.00	0.00	4.61	5.33	0.89	2.93	2.67	2.90	7.08	2.33	4.09	0.00	0.00	0.00	4.87	0.00	0.27	3.63	0.00	0.23	0.29	3.28	0.22
24	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.07	3.66	0.51	0.00	2.10	0.62	0.00	0.00	3.60	3.01	0.70	1.52	2.08	1.47	5.98	2.39	6.21	0.59	1.22	0.00	5.14	0.00	0.10	1.17	0.93	0.21	1.45	2.83	1.91
25	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	1.29	6.59	0.96	0.64	1.30	2.50	1.79	0.74	8.87	5.27	1.48	3.37	4.23	1.25	14.46	4.44	12.96	0.60	1.56	0.79	6.00	0.32	0.48	6.49	1.74	1.88	4.34	2.87	3.77
26	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	1.22	5.01	0.37	0.00	0.00	2.55	1.25	1.93	1.02	2.34	0.57	1.94	4.58	1.47	32.00	6.99	7.58	0.00	0.00	1.34	9.17	0.00	0.00	4.92	3.54	0.60	3.66	1.16	4.86
27	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	5.85	18.37	4.33	2.34	4.77	7.21	2.54	1.36	22.74	9.01	3.64	10.41	7.78	6.31	57.38	11.21	36.64	1.67	3.64	1.70	9.08	3.23	2.36	19.97	11.15	7.14	9.59	16.11	7.47
28	I1_AR12	ActiveIntronRegion	0	2.24	8.38	1.00	3.21	0.00	3.28	1.50	1.65	12.38	9.90	5.15	7.17	5.02	3.43	23.17	5.18	30.72	1.48	0.95	1.23	8.08	2.69	1.35	15.08	5.33	10.55	5.74	6.32	5.77
29	I1_SR9	SilentIntronRegion	0	1.42	1.77	0.74	0.53	0.72	1.32	0.45	0.27	4.01	5.43	1.93	3.09	1.86	1.03	5.76	2.95	6.82	1.44	2.35	0.81	3.26	0.93	1.33	2.38	2.32	2.43	2.16	3.24	2.47
30	I1_AR13	ActiveIntronRegion	0	0.89	2.41	0.46	0.99	0.67	0.95	0.83	0.25	3.17	3.38	1.97	2.38	1.25	1.43	1.39	2.40	3.09	1.06	0.44	1.90	2.75	0.00	0.25	2.37	0.61	0.43	0.76	0.67	1.01
31	I1_SR10	SilentIntronRegion	0	1.59	1.61	0.53	0.76	1.03	1.45	0.43	0.97	3.80	5.50	0.88	4.18	0.34	1.67	4.95	5.25	7.74	1.22	4.39	0.29	3.02	0.00	1.53	1.59	1.21	1.33	0.97	1.55	0.63
32	I1	Intron	0	9.16	16.61	3.71	5.81	6.11	10.02	2.27	1.51	5.02	9.68	6.19	6.58	1.92	9.90	5.63	15.84	16.11	11.15	8.54	3.77	7.67	0.89	1.48	5.00	5.00	3.39	2.87	15.76	2.43
33	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	5.69	5.32	3.25	4.23	8.48	9.57	2.08	0.98	2.77	6.79	6.19	5.19	1.52	6.36	3.09	11.83	9.39	4.63	8.49	1.75	6.99	0.34	1.58	1.63	2.66	2.50	0.00	11.93	1.25
34	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.23	17.63	4.23	5.03	6.31	8.30	1.50	0.67	5.75	12.38	5.18	5.66	2.24	8.61	7.00	12.21	16.82	12.07	6.59	2.23	7.60	1.38	1.86	4.06	7.28	6.27	0.43	16.98	2.37
35	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	8.02	12.37	3.15	2.06	2.43	6.37	1.45	2.36	4.41	6.92	6.72	4.11	0.84	8.03	4.23	12.45	6.62	7.58	5.23	4.07	9.02	0.00	1.23	1.85	1.94	1.13	0.57	15.36	1.75
36	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	11.27	17.65	4.45	7.81	5.51	14.93	2.67	0.98	5.66	10.34	6.16	7.09	1.28	10.65	4.50	16.86	16.59	13.72	9.93	4.89	10.16	0.17	1.05	4.17	4.97	2.87	7.03	19.65	2.81
37	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	8.52	17.24	5.79	2.68	5.91	8.99	3.77	4.08	4.20	11.41	5.85	8.23	2.12	13.45	7.18	14.14	20.19	12.38	5.95	3.22	7.23	0.67	3.38	5.39	5.20	6.15	2.92	18.48	2.00
38	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	10.85	22.07	3.52	8.43	8.53	10.78	2.94	2.03	5.04	10.29	8.40	8.39	3.09	13.03	6.87	23.08	20.96	13.02	11.50	5.29	7.17	1.80	1.35	8.74	6.11	2.52	3.20	16.73	3.36
39	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	1.98	4.15	0.39	0.83	1.13	3.17	0.00	0.00	4.60	3.17	0.96	2.56	0.00	0.89	2.97	3.72	5.86	2.78	4.42	0.64	3.13	0.00	0.63	0.99	0.66	1.63	0.00	0.94	0.23
40	I1	Intron	0	18.09	21.00	5.12	7.31	12.68	11.34	5.97	1.88	13.42	14.73	5.18	7.26	2.22	14.93	22.43	43.57	29.21	8.66	6.52	6.94	10.98	4.35	1.51	14.36	7.42	5.83	1.02	14.51	3.90
41	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	10.50	3.28	0.90	20.48	4.98	2.20	0.20	0.00	1.01	5.20	2.86	1.86	0.00	5.26	0.00	7.34	4.21	0.00	0.00	2.81	16.69	2.16	1.27	5.81	0.00	1.41	0.37	6.52	0.00
42	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	18.26	21.37	5.20	7.08	12.85	11.54	6.09	1.92	13.67	14.93	5.24	7.38	2.27	15.14	22.89	44.32	29.72	8.84	6.65	7.03	10.89	4.39	1.52	14.55	7.57	5.92	1.03	14.68	3.98
43	E2_Aa	NovelBoundary	0	26.37	17.64	41.58	0.00	0.00	33.84	8.75	6.77	23.91	19.69	21.70	21.87	4.43	52.36	25.11	70.99	68.34	32.24	16.18	14.64	19.77	6.32	17.98	25.12	29.82	40.68	8.35	35.63	15.68
44	ER2a	ExonRegion	0	11.03	30.34	15.00	7.61	9.18	15.70	8.91	3.34	18.05	14.90	8.15	11.54	3.81	23.44	25.66	32.44	49.18	14.50	15.81	9.22	10.37	5.26	5.59	23.63	12.48	11.88	11.88	17.25	8.25