Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AF196970.1	Gene	0	0.00	0.00	0.09	2.37	0.00	0.30	0.11	0.61	0.00	0.32	0.00	0.20	0.07	0.35	0.00	0.00	0.25	0.21	0.18	0.15	0.08	0.00	0.90	0.00	0.39	0.95	0.40	0.00	0.00
2	416061	Transcript	0	0.00	0.00	0.09	2.12	0.00	0.19	0.68	1.01	0.00	0.33	0.00	0.46	0.07	0.73	0.00	0.00	0.23	0.19	0.16	0.22	0.12	0.00	0.92	0.00	0.40	1.17	0.36	0.00	0.00
3	IG46_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	42.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	8.78	0.00	0.59	0.39	0.75	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	0.00	1.12	0.58	0.00	3.69	0.00	1.75	3.00	0.75	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	0.00
6	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11
7	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00
8	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00
9	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00
10	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	Ix	Intron	0	7.28	8.01	8.40	1.52	2.42	7.10	0.29	4.82	6.74	11.44	3.96	10.07	4.58	6.17	4.94	9.95	6.12	8.45	12.20	3.31	12.41	10.20	19.31	4.72	4.35	19.79	11.40	11.53	3.74
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.10	4.46	8.62	0.00	2.50	3.83	1.03	2.77	5.15	6.54	2.44	6.23	5.05	5.62	2.59	6.36	4.81	6.97	9.78	1.77	7.68	5.39	9.31	2.99	4.08	8.17	5.54	6.26	3.16
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.61	9.40	8.35	2.11	2.39	8.37	0.00	5.62	7.38	13.36	4.55	11.58	4.42	6.41	5.86	11.37	6.65	9.05	13.18	3.92	14.27	12.08	23.22	5.40	4.47	24.31	13.69	13.59	3.97
14	Ix	Intron	0	3.50	0.00	0.65	1.67	0.00	1.92	0.31	1.15	0.35	0.34	0.46	1.44	0.20	0.81	2.00	1.19	2.32	1.40	0.99	0.00	1.00	0.42	0.00	1.00	0.22	0.61	0.28	0.63	0.57
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.50	0.00	0.65	1.68	0.00	1.93	0.31	1.15	0.35	0.34	0.46	1.44	0.20	0.81	2.00	1.19	2.33	1.40	1.00	0.00	1.00	0.42	0.00	1.01	0.22	0.61	0.29	0.64	0.57
16	Ix	Intron	0	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00
18	Ix	Intron	0	2.95	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	1.39	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	1.54	0.66	0.00	0.00	0.49	0.00	1.25	0.74	0.49	0.54	1.26	0.00	0.00
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.99	0.00	0.00	2.50	0.00	0.00	1.41	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	0.00	0.00	1.56	0.67	0.00	0.00	0.50	0.00	1.26	0.75	0.50	0.55	1.28	0.00	0.00
20	Ix	Intron	0	3.65	1.40	1.33	1.74	1.73	1.82	0.36	1.18	1.56	2.33	0.71	2.41	0.59	1.88	2.11	1.99	2.08	2.55	2.75	0.61	1.70	0.56	0.80	1.38	1.07	2.40	2.51	2.59	0.56
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.30	1.45	1.12	0.68	0.00	1.78	0.39	2.55	3.80	1.69	0.57	1.39	0.00	1.73	3.06	0.88	1.53	2.10	2.44	0.79	0.88	0.00	0.52	1.80	0.96	1.20	0.70	3.19	1.02
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.93	1.63	1.63	1.95	2.85	2.19	0.24	0.79	0.74	2.98	0.56	3.48	1.03	2.38	1.86	2.20	2.85	3.20	3.73	0.64	2.00	0.84	1.13	1.34	1.34	3.49	2.92	2.86	0.34
23	Ix	Intron	0	4.34	1.77	0.68	1.45	0.99	0.83	1.22	0.37	1.13	0.58	0.24	2.12	0.26	1.37	0.93	0.00	0.91	2.14	3.88	0.56	0.29	1.46	0.37	0.44	0.58	2.54	0.37	2.64	0.27
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.34	1.77	0.68	1.45	0.99	0.83	1.22	0.37	1.13	0.58	0.24	2.12	0.26	1.37	0.93	0.00	0.91	2.14	3.88	0.56	0.29	1.46	0.37	0.44	0.58	2.54	0.37	2.64	0.27
25	Ix	Intron	0	1.08	2.43	0.42	0.00	1.23	0.69	0.51	0.46	0.00	0.00	0.30	0.00	0.33	1.36	0.00	1.87	1.88	3.87	0.80	0.69	1.79	0.45	1.36	0.00	0.36	0.79	5.06	2.05	0.00
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.08	2.44	0.42	0.00	1.23	0.69	0.51	0.46	0.00	0.00	0.30	0.00	0.33	1.37	0.00	1.88	1.88	3.88	0.81	0.70	1.80	0.46	1.37	0.00	0.36	0.79	5.09	2.06	0.00
27	E2_Aa	NovelBoundary	0	142.27	76.88	129.86	79.37	71.03	87.71	70.77	118.94	46.93	86.36	61.21	236.29	112.16	41.17	39.86	112.30	83.96	130.10	72.83	18.61	145.84	224.47	214.73	36.73	56.98	188.14	77.28	220.97	58.63
28	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.34	0.09	0.21	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.24	0.84	0.17	0.00	0.00
29	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	2.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.74	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.37	0.00	0.29	0.33	1.13	0.00	0.00	1.12	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00