Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-168K11.2	Gene	0	1.66	0.00	0.00	0.93	0.00	1.06	0.00	0.71	1.59	2.42	0.00	0.56	0.00	1.11	0.60	2.47	2.51	1.82	0.00	0.00	0.74	0.00	0.23	1.11	0.37	0.41	0.00	0.42	0.35
2	428429	Transcript	0	1.08	0.00	0.00	0.59	0.00	0.69	0.00	0.43	1.01	1.59	0.00	0.33	0.00	0.70	0.38	1.66	1.61	2.24	0.00	0.00	0.47	0.00	0.16	0.74	0.21	0.26	0.00	0.28	0.24
3	ER1a	ExonRegion	0	3.53	0.00	0.00	2.95	0.00	2.83	0.00	1.51	1.15	4.16	0.00	1.02	0.00	2.79	1.90	1.76	1.88	3.02	0.00	0.00	2.35	0.00	0.00	0.88	0.59	1.29	0.00	0.67	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.89	4.27	1.54	0.00	0.00	3.91	0.00	2.09	4.02	5.95	0.00	0.00	0.00	3.17	0.00	6.66	0.00	0.00	0.00	0.00	8.10	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	1.62
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.46	1.56	0.97	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.43	2.65	0.00	0.36	0.00	1.75	1.87	2.64	1.59	1.31	0.93	0.00	1.10	0.35	0.00	0.42	0.28	0.00	0.00	1.10	0.65
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.46	1.56	0.97	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.44	2.66	0.00	0.36	0.00	1.76	1.87	2.65	1.59	1.31	0.93	0.00	1.11	0.35	0.00	0.42	0.28	0.00	0.00	1.11	0.65
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.30	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	4.28	0.00	3.82	3.60	4.62	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	0.00	0.00
9	ER2a	ExonRegion	0	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.05	2.96	3.81	0.00	0.01	0.00	0.40	0.00	6.54	5.17	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	2.84	0.05	0.00	0.00	0.72	1.18
10	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	2.92	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	3.57	16.34	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00	5.66	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	2.20	0.00
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix	Intron	0	5.44	5.33	2.86	2.26	0.10	6.06	1.51	4.64	8.11	5.60	0.98	2.71	0.99	8.53	6.28	3.68	4.20	4.58	4.53	2.16	8.76	3.76	5.80	4.24	1.43	3.16	1.62	1.99	3.45
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.47	4.72	1.78	1.65	0.00	5.04	1.01	4.29	7.58	5.20	0.91	2.25	0.69	6.40	5.62	2.97	3.51	3.80	3.02	1.45	5.81	2.50	3.88	3.23	1.17	1.85	1.39	1.73	2.76
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	11.12	8.89	9.23	5.79	0.66	12.08	4.40	6.67	11.27	7.93	1.44	5.40	2.78	21.02	10.15	7.83	8.24	9.13	13.33	6.30	25.98	11.11	17.08	10.13	3.01	10.80	2.99	3.51	7.47
15	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	3.81	0.00	2.31	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.92	0.00	0.00	0.60	0.00	0.30	0.00	0.00	1.01	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00