Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP4-555L14.2	Gene	0	5.89	2.72	1.89	0.00	1.66	8.75	8.05	1.04	8.15	3.21	2.06	0.09	0.54	6.73	10.16	1.84	4.10	1.23	1.80	0.77	0.70	8.15	0.48	30.87	1.99	2.07	1.72	0.43	1.61
2	489632	Transcript	0	1.64	1.98	0.66	0.00	0.00	4.00	6.08	0.57	2.40	1.04	0.23	0.00	0.13	2.60	5.13	0.18	1.86	0.20	1.74	0.28	0.15	4.59	0.87	13.39	0.59	0.75	0.37	0.00	0.00
3	480632	Transcript	0	7.44	4.64	2.94	0.00	2.54	14.50	10.18	0.00	13.49	4.78	2.98	0.00	0.09	9.63	15.06	3.12	3.10	1.68	1.94	0.29	0.86	7.83	0.40	49.00	4.45	2.45	6.25	0.00	2.40
4	466677	Transcript	0	1.19	0.00	0.26	0.00	0.00	2.62	0.03	0.01	0.43	0.66	0.02	0.00	0.00	0.67	0.05	0.00	0.95	0.03	0.40	0.02	0.21	0.04	0.01	2.59	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01
5	460148	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17
6	ER1a	ExonRegion	0	0.71	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	3.25	1.13	1.12	0.00	0.85	4.36	2.82	0.21	3.34	1.90	1.09	0.00	0.74	1.11	0.00	2.31	2.03	0.00	0.00	0.00	0.16	6.59	0.00	6.51	1.55	0.76	0.00	0.56	2.65
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	4.72	0.00	1.54	0.00	0.00	14.12	7.38	2.04	8.89	5.35	2.91	0.00	1.59	3.79	0.00	3.82	5.15	0.00	0.00	0.00	0.00	19.69	0.00	16.09	1.93	1.76	2.34	1.89	6.47
10	ER1c	ExonRegion	0	5.87	2.19	2.59	0.00	4.22	7.48	9.30	0.78	7.24	3.38	1.30	0.57	0.36	3.54	7.82	0.41	5.87	1.77	1.47	0.91	0.60	13.27	0.00	15.79	0.82	6.26	0.00	1.32	3.78
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E4a	KnownJunction	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.74	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	2.94	0.49	0.88	0.00	1.03	0.73	0.00	0.00	0.36	0.15	0.00	0.00	0.00	1.81	1.74	0.79	0.79	1.02	0.67	0.00	0.00	0.00	0.38	4.32	0.15	0.33	0.00	0.00	0.00
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.95	0.49	0.89	0.00	1.04	0.73	0.00	0.00	0.36	0.15	0.00	0.00	0.00	1.82	1.75	0.79	0.79	1.02	0.68	0.00	0.00	0.00	0.38	4.33	0.15	0.33	0.00	0.00	0.00
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.02	0.00	0.00	0.34
18	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	7.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.97	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I2	Intron	0	0.24	0.35	0.74	0.00	0.54	2.57	0.66	0.20	0.86	0.16	0.00	0.00	0.00	1.94	1.11	0.55	1.97	0.00	1.05	0.00	0.31	0.20	0.00	5.67	0.00	0.52	0.00	0.18	0.00
21	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.31	0.06	0.87	0.00	0.70	3.02	0.87	0.00	1.07	0.21	0.00	0.00	0.00	1.99	1.45	0.55	2.56	0.00	1.37	0.00	0.29	0.26	0.00	5.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	1.33	0.29	0.00	0.00	1.12	0.00	0.89	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.53	0.02	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	5.60	0.00	2.27	0.00	0.78	0.00
23	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.90	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	1.55	2.04	1.61	0.00	0.00	5.01	0.00	0.00	5.45	0.00	0.00	0.00	0.00	4.23	0.00	5.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER3a	ExonRegion	0	1.84	1.28	1.33	0.00	0.00	7.21	6.45	0.00	5.08	0.22	1.39	0.00	0.78	5.77	13.11	0.00	5.03	0.00	0.37	1.65	0.00	8.08	0.81	19.21	0.00	0.50	2.20	0.00	0.00
25	E3a_E4a	KnownJunction	0	4.66	4.65	2.49	0.00	0.00	10.97	24.03	0.00	3.78	3.36	0.00	0.00	0.00	7.62	7.97	0.00	2.79	0.00	8.09	0.00	0.00	10.31	2.17	24.64	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
26	ER4a	ExonRegion	0	12.84	4.09	2.44	0.00	4.05	16.41	20.65	2.81	13.96	6.69	5.53	0.00	0.95	17.80	18.99	4.12	11.33	3.53	5.45	3.63	1.21	18.58	0.34	48.64	2.46	6.73	1.52	2.70	4.69
27	E4_Da	KnownBoundary	0	5.66	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.66	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	5.68	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
28	E4a_E4b	KnownJunction	0	11.68	0.00	5.21	0.00	0.00	19.11	13.85	2.34	11.24	7.87	10.60	0.00	1.97	22.95	26.71	3.52	13.24	18.49	8.09	7.36	0.00	22.75	2.02	82.84	1.48	2.06	0.00	0.00	4.16
29	E4a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER4b	ExonRegion	0	2.39	0.00	0.52	0.00	0.00	2.27	0.07	0.01	0.07	0.99	0.04	0.00	0.01	0.90	0.10	0.00	0.74	0.06	0.80	0.03	0.42	0.08	0.01	2.96	0.01	0.33	0.00	0.00	0.02
31	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4c	ExonRegion	0	10.72	0.00	6.00	0.00	0.50	17.73	17.94	3.82	19.97	6.46	7.41	1.24	2.92	14.97	25.20	2.40	12.95	3.62	3.39	1.76	1.93	19.79	2.71	94.65	3.64	1.49	0.00	0.29	2.45
33	E4_Db	KnownBoundary	0	14.16	0.00	6.55	0.00	0.00	23.44	26.83	4.73	32.89	5.51	5.66	1.27	3.69	15.78	42.06	3.29	14.25	0.00	0.00	3.39	3.37	19.64	2.51	110.30	3.75	3.73	0.00	1.71	1.68
34	ER4d	ExonRegion	0	14.12	5.21	5.79	0.00	6.64	21.49	22.30	3.62	29.51	11.11	2.78	0.22	2.02	15.97	39.83	2.85	13.61	0.95	2.59	2.23	2.33	16.65	2.12	82.46	5.79	0.80	2.97	1.14	1.26
35	E4_Dc	NovelBoundary	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	5.33	2.46	0.00	2.25	1.52	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	5.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E4c_E5a	KnownJunction	0	16.75	0.00	5.16	0.00	5.89	7.14	27.35	3.68	17.30	3.40	5.60	0.00	0.00	20.58	33.09	3.21	10.83	4.62	0.00	0.00	5.58	16.87	1.92	56.82	1.52	0.00	0.00	0.00	1.68
37	E4_Dd	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	2.80	2.00	0.00	0.00	0.00	1.13	7.37	0.00	2.30	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	7.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER4e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.97	0.00	0.00	0.80	0.33	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	I4	Intron	0	0.81	1.22	0.16	0.00	0.00	1.95	0.57	0.17	3.02	0.00	0.23	0.12	0.12	2.02	4.95	0.17	2.40	0.73	0.60	0.52	0.27	0.51	0.17	7.12	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00
40	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.81	1.22	0.16	0.00	0.00	1.95	0.57	0.17	3.02	0.00	0.23	0.12	0.12	2.02	4.95	0.17	2.40	0.73	0.60	0.52	0.27	0.51	0.17	7.12	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.18	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	4.86	0.00	4.11	0.00	0.00	1.36	0.00	5.54	0.00	0.00	4.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.43	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER5a	ExonRegion	0	15.02	7.92	4.01	0.00	2.30	18.77	16.71	2.27	16.19	5.72	5.59	0.00	1.59	16.08	16.01	6.59	5.82	2.95	3.24	0.63	1.38	18.03	0.22	75.45	4.28	3.06	4.10	0.00	2.80
43	E5_Da	KnownBoundary	0	16.87	9.50	6.15	0.00	0.00	18.92	20.77	0.00	20.49	8.79	5.95	0.00	3.41	12.65	18.34	3.44	5.81	4.62	8.09	4.13	1.89	10.50	1.92	87.15	12.96	0.00	17.59	0.00	7.46
44	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER5b	ExonRegion	0	7.44	4.64	2.94	0.00	2.54	14.50	10.18	0.00	13.49	4.78	2.98	0.00	0.09	9.63	15.06	3.12	3.10	1.68	1.94	0.29	0.86	7.83	0.40	49.00	4.45	2.45	6.25	0.00	2.40
46	E5_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	16.61	0.00	0.00	12.61	0.00	4.84	0.00	0.00	12.52	9.97	0.00	11.23	0.00	0.00	0.00	1.52	4.23	0.00	20.28	1.78	2.10	0.00	0.00	1.35
47	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.24	8.01	0.00	14.65	3.87	0.00	0.00	0.00	5.87	7.57	6.27	5.69	0.00	16.18	7.86	0.00	4.96	4.83	36.43	1.63	2.19	0.00	0.00	0.00
48	ER6a	ExonRegion	0	2.63	5.94	0.00	0.00	0.00	3.93	3.72	3.39	5.52	2.64	0.00	0.00	0.00	2.21	9.72	1.10	1.04	1.18	1.96	0.00	0.88	6.65	2.22	31.26	3.51	1.82	0.00	0.00	0.00
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