Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC011899.2	Gene	0	5.39	6.51	14.87	1.33	1.28	18.24	1.43	1.73	3.55	8.89	6.48	6.20	3.15	12.47	4.30	3.93	3.72	5.16	2.83	3.44	5.01	13.76	4.83	14.73	9.52	11.19	6.81	2.98	7.29
2	436151	Transcript	0	7.44	4.97	8.27	0.00	0.00	7.49	0.90	1.27	1.67	3.70	3.13	4.25	3.09	9.18	2.84	3.83	2.11	3.69	0.76	0.80	4.20	7.67	4.97	5.85	2.35	4.74	2.06	2.02	3.09
3	438047	Transcript	0	2.65	3.66	9.77	0.77	0.89	15.19	0.67	0.87	2.30	4.97	3.76	3.24	1.74	6.80	1.82	2.03	2.04	2.60	1.56	1.35	2.87	7.32	2.53	8.98	5.80	7.89	4.21	1.76	4.49
4	434059	Transcript	0	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	1.13	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35
5	443338	Transcript	0	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	1.71	5.87	0.00	1.75	3.25	4.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	2.51	5.19	4.38	7.45	0.00	1.32
6	ER1a	ExonRegion	0	8.99	0.23	3.78	0.00	0.00	9.19	1.80	1.65	3.02	1.29	1.98	2.06	1.16	4.12	4.81	4.26	2.50	3.11	0.32	1.08	4.13	5.44	2.54	2.98	3.08	6.51	0.00	0.00	3.08
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	9.02	0.00	10.76	0.00	0.00	13.20	0.00	0.00	0.00	0.00	6.07	6.75	0.00	5.83	19.93	7.65	2.75	4.62	0.00	4.13	3.97	9.67	2.51	3.05	3.86	10.34	0.00	0.00	7.63
8	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	9.21	4.36	0.00	0.00	10.86	2.29	4.98	3.05	0.00	5.92	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	3.89	4.62	8.09	13.89	2.05	7.10	4.83	0.00	0.00	4.25	2.48	0.00	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	6.24	3.28	6.63	0.00	0.00	14.17	0.88	3.20	0.00	0.00	5.80	3.12	0.00	3.31	11.20	4.84	5.01	4.03	4.53	10.27	4.16	12.15	4.72	2.15	2.05	6.63	0.00	0.00	5.37
10	ER1c	ExonRegion	0	8.22	3.13	4.66	1.52	0.00	11.02	3.70	3.48	2.53	4.68	3.50	5.57	0.86	4.57	5.98	3.08	3.23	5.27	1.06	13.10	3.57	16.62	3.37	2.05	4.77	10.39	3.09	0.00	4.63
11	E1_Ad	KnownBoundary	0	3.01	8.14	8.20	9.06	0.00	16.77	0.00	2.24	0.00	7.27	4.14	15.60	2.71	9.51	24.72	10.33	7.54	9.25	0.00	19.60	8.74	14.63	12.36	7.96	6.59	20.47	25.89	0.00	8.81
12	ER1d	ExonRegion	0	3.63	1.80	18.22	5.85	0.00	25.07	6.75	2.09	4.70	19.54	10.31	11.45	3.15	19.33	29.27	4.99	8.41	13.06	2.17	16.34	6.69	28.70	6.65	11.19	14.35	11.67	20.27	0.00	8.14
13	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.77	0.00	22.90	0.00	0.00	5.76	0.00	2.54	2.86	7.47	4.40	5.93	0.00	12.65	16.34	0.00	2.41	4.62	0.00	3.80	1.52	17.75	0.00	8.25	6.86	3.48	8.40	0.00	3.17
14	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	1.13	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35
15	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	1.71	5.87	0.00	1.75	3.25	4.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	2.51	5.19	4.38	7.45	0.00	1.32
16	ER2a	ExonRegion	0	1.38	3.54	6.89	0.00	0.00	9.74	2.73	1.13	2.34	9.00	4.80	4.57	1.13	11.63	21.85	3.10	3.67	5.10	2.40	11.48	2.64	19.50	2.91	8.50	8.77	6.39	0.95	0.00	2.85
17	E2_Da	NovelBoundary	0	5.78	4.85	1.35	0.00	6.63	9.40	0.00	6.92	1.52	0.00	0.00	1.36	1.97	4.10	33.29	0.00	0.00	4.62	0.00	16.21	1.56	0.00	2.51	11.54	3.33	2.19	0.00	0.00	4.56
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	3.01	4.85	1.05	0.00	0.00	10.28	2.92	0.00	0.00	2.04	1.61	4.46	0.00	11.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	16.97	2.51	6.04	3.30	2.19	0.00	0.00	3.24
19	E2a_E4a	NovelJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.68	1.23	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.43	1.40	0.00	5.52	0.00	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	7.12	3.36	10.22	1.41	0.00	10.01	0.63	1.45	0.22	3.70	1.67	6.39	1.86	10.44	0.00	3.63	1.92	4.45	2.46	1.11	2.70	11.55	3.34	6.50	2.33	3.65	1.73	2.27	2.05
21	E3_Da	KnownBoundary	0	7.37	0.00	6.98	0.00	0.00	6.83	0.00	0.00	0.00	5.39	1.49	9.46	3.50	9.51	0.00	6.66	4.70	4.62	0.00	0.00	9.63	7.29	0.00	8.85	0.00	0.00	2.04	6.25	3.50
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	8.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
23	ER3b	ExonRegion	0	6.56	8.50	12.84	0.00	0.00	5.13	0.00	1.25	0.00	6.62	0.74	9.46	5.08	9.31	0.00	3.87	1.53	9.87	0.40	0.00	2.68	9.38	3.62	6.39	0.00	0.00	0.81	4.41	5.29
24	E3_Db	KnownBoundary	0	10.50	14.45	12.56	0.00	0.00	5.29	0.00	2.54	0.00	9.71	0.00	4.25	3.60	7.69	0.00	3.60	0.00	4.50	0.00	0.00	0.00	11.33	8.52	3.05	1.82	0.00	0.00	6.16	5.38
25	ER3c	ExonRegion	0	5.88	9.71	12.77	0.00	0.00	5.78	0.00	0.89	0.32	6.12	4.27	6.44	5.02	14.24	0.87	3.40	1.73	4.28	1.21	0.52	4.27	9.90	7.40	8.72	1.62	2.97	4.12	4.04	3.09
26	E3_Dc	NovelBoundary	0	8.43	13.57	13.30	0.00	0.00	5.56	0.00	0.00	1.89	2.04	0.00	5.00	0.00	24.86	0.00	6.81	2.25	0.00	0.00	0.00	1.80	15.56	13.54	7.12	0.00	9.23	0.00	6.74	3.93
27	Ix	Intron	0	2.16	4.07	6.09	0.00	0.25	5.79	0.21	0.29	0.41	3.84	1.88	3.04	1.77	5.04	1.04	2.67	0.89	3.67	1.57	0.48	3.43	3.21	1.68	3.50	1.96	2.88	1.47	0.67	2.30
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.37	5.17	8.43	0.00	0.00	5.41	0.00	0.34	0.52	3.48	1.31	3.19	1.79	10.49	1.25	3.58	1.34	6.16	3.28	0.37	2.38	6.46	3.28	5.72	1.05	2.75	1.69	1.80	3.43
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.66	3.16	6.94	0.00	0.00	6.48	0.34	0.00	0.44	4.21	1.57	3.81	3.00	5.06	1.88	5.05	1.40	3.60	1.44	0.00	3.55	4.76	1.22	7.77	1.32	3.83	2.27	0.64	2.86
30	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.43	6.33	2.75	0.00	0.00	7.44	0.77	0.28	1.17	2.87	1.24	4.99	5.06	5.14	7.22	3.26	0.00	5.77	0.00	0.35	7.00	5.37	1.10	5.15	2.78	4.05	4.44	0.00	4.59
31	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.55	3.98	5.63	0.00	0.42	5.60	0.17	0.37	0.31	3.94	2.18	2.64	1.13	3.83	0.24	1.67	0.70	2.99	1.36	0.68	3.39	1.83	1.53	1.52	2.33	2.55	0.94	0.49	1.70
32	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	0.00	2.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.74	0.00	2.22	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	3.30
33	ER4a	ExonRegion	0	5.03	5.25	12.99	0.78	1.07	16.26	1.00	1.81	1.54	7.94	5.91	4.68	2.74	9.38	0.60	4.03	3.25	4.45	3.49	1.98	3.63	6.73	4.13	12.70	7.69	7.37	4.12	2.59	5.19
34	E4_Da	KnownBoundary	0	3.01	8.34	10.56	0.00	0.00	13.74	2.92	0.00	1.16	3.99	0.00	9.91	1.27	11.77	0.00	3.29	2.52	0.00	0.00	3.14	1.76	16.34	0.00	29.31	14.24	11.80	2.53	6.87	0.00
35	ER4b	ExonRegion	0	5.31	7.32	17.11	1.54	1.78	21.52	1.35	1.74	4.60	9.95	7.53	6.47	3.48	13.60	3.64	4.05	4.08	5.20	3.12	2.69	5.73	14.65	5.06	17.95	11.60	13.73	8.42	3.52	8.97