Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	MNX1	Gene	0	0.63	0.21	0.05	0.71	0.56	1.29	0.03	1.27	0.00	5.80	0.12	0.00	0.34	0.12	2.29	0.91	0.00	0.93	1.78	0.00	3.51	6.30	0.00	0.28	0.75	1.01	0.63	0.80	5.31
2	252971	Transcript	0	1.14	0.19	0.06	0.78	0.48	1.47	0.03	3.13	0.00	7.13	0.07	0.00	0.30	0.06	2.14	3.09	0.00	0.73	1.62	0.00	7.78	14.81	0.00	0.24	1.20	0.85	0.50	0.63	8.60
3	479817	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	474448	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	0.20	0.00	1.17	0.06	0.00	0.00	0.00	0.25	0.10	0.00	0.52	0.17	0.00	0.15	0.97	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.35	0.16
5	428439	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	425745	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	469500	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	IG39	Intergenic	0	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.67	0.00	1.57	0.00	0.00	4.26	4.89	0.00	1.17	0.39	1.28	0.99	1.33	6.73
9	IG39_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	1.04	0.00	2.45	0.00	0.00	6.46	7.39	0.00	1.84	0.61	1.97	1.57	2.08	10.62
10	ER1a	ExonRegion	0	0.26	0.28	0.00	0.86	0.22	0.66	0.00	0.64	0.00	1.56	0.00	0.00	0.41	0.00	0.94	0.60	0.00	0.95	1.17	0.00	2.30	4.58	0.00	0.26	0.34	1.13	0.33	0.78	3.55
11	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	13.26	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	7.34	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.21
12	ER1b	ExonRegion	0	0.46	0.00	0.00	0.00	1.75	1.08	0.00	2.89	0.00	2.89	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	2.05	0.00	2.07	3.91	0.00	10.64	15.64	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	9.03
13	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E3a	KnownJunction	0	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	7.02	0.00	7.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.88	0.00	0.00	0.00	0.00	14.40	28.93	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	11.88
15	E1a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	0.73	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.25
18	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	7.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.91
19	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.56
20	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
21	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	4.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	3.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.32
22	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
23	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.40	0.00	2.34	0.13	0.00	0.00	0.00	0.50	0.19	0.00	1.05	0.35	0.00	0.31	1.94	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.71	0.33
27	E2_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00	11.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E2b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	I2	Intron	0	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.08	0.38	0.00	3.25	0.10	0.15	0.00	0.26	0.42	0.21	0.00	0.88	0.93	0.00	1.84	0.68	0.00	0.27	0.24	0.26	0.00	0.14	0.81
30	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.08	0.38	0.00	3.25	0.10	0.15	0.00	0.26	0.42	0.21	0.00	0.88	0.93	0.00	1.85	0.68	0.00	0.27	0.24	0.26	0.00	0.14	0.81
31	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.52	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.42	0.00	0.00	0.33	0.36	0.00	0.00	0.31
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	3.04	0.00	0.00	0.00	0.53	2.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.42	0.00	0.00	0.33	0.37	0.00	0.00	0.31
33	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	8.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER3a	ExonRegion	0	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	3.94	0.00	6.55	0.00	11.16	0.00	0.00	0.60	0.43	1.46	1.10	0.00	0.00	3.04	0.00	7.24	14.22	0.00	0.77	2.18	2.55	0.92	1.90	11.39
35	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E3a_E4a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	10.15	0.00	11.58	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.02	18.09	0.00	2.27	5.42	4.38	10.88	4.31	17.66
37	ER4a	ExonRegion	0	5.63	0.00	0.00	0.00	8.72	2.23	0.00	7.59	0.00	16.11	1.08	0.00	2.35	0.00	13.30	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	12.48	22.70	0.00	2.15	5.58	3.83	8.59	0.82	14.55
38	E4_Da	KnownBoundary	0	5.78	0.00	0.00	0.00	14.74	1.80	0.00	4.58	0.00	24.33	1.61	0.00	1.40	0.00	26.51	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	17.93	21.44	0.00	2.57	1.74	4.03	5.72	0.00	12.68
39	ER4b	ExonRegion	0	0.85	0.29	0.17	1.48	1.23	2.17	0.10	1.73	0.00	12.13	0.21	0.00	0.50	0.19	5.49	1.79	0.00	1.23	3.70	0.00	6.64	10.93	0.00	0.47	1.51	1.40	1.18	1.09	10.35
40	E4_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.82	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER5a	ExonRegion	0	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	1.41	0.00	0.00	0.00	0.56	0.46	0.00	0.00	0.53	0.00	0.97	0.00	1.62	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	1.57