Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC007566.2	Gene	0	8.27	8.34	1.34	5.22	0.36	7.21	2.79	6.17	4.65	6.09	2.16	7.04	1.74	7.87	8.10	30.18	14.34	3.39	9.06	7.83	4.77	1.97	0.53	10.33	9.46	2.29	1.60	4.39	4.91
2	427458	Transcript	0	9.48	4.42	1.39	5.28	0.00	5.67	2.28	5.55	2.86	4.70	1.03	5.43	2.02	6.93	5.57	21.50	9.72	1.98	5.77	6.69	3.25	2.32	0.17	6.23	3.25	1.60	1.84	4.09	3.03
3	441539	Transcript	0	0.98	6.09	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.06	2.54	1.32	2.19	0.78	0.00	0.75	0.00	6.52	1.55	0.00	0.00	2.13	0.00	0.00	0.00	2.10	5.03	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	6.43	1.39	0.78	5.91	0.00	3.33	1.01	3.54	4.88	7.55	0.00	1.71	0.00	3.70	11.42	24.43	4.01	0.00	3.13	4.65	2.63	1.73	0.00	2.07	0.49	1.39	0.00	5.27	1.50
5	I1	Intron	0	3.38	2.79	1.15	3.50	1.54	4.02	1.85	4.07	6.42	4.23	2.53	8.09	2.30	2.87	13.52	14.28	6.04	1.84	3.58	4.45	6.02	1.86	0.57	8.58	5.09	1.08	1.84	1.26	3.95
6	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.54	3.81	1.42	5.39	2.07	6.29	2.99	6.63	11.42	6.90	4.37	9.06	3.72	5.05	19.11	21.58	6.42	2.83	7.90	8.21	9.60	2.93	1.15	12.78	7.84	1.67	4.01	1.38	6.55
7	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.55	3.96	0.44	2.76	1.26	2.14	0.26	1.52	3.03	2.36	2.18	7.23	0.73	1.26	12.49	11.91	5.20	0.44	0.84	3.86	4.39	1.12	0.00	5.46	3.00	0.21	0.72	0.86	2.24
8	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.29	1.84	0.09	6.14	0.20	2.64	0.00	6.19	2.83	3.58	0.00	14.35	0.83	0.44	1.34	7.79	9.14	2.73	0.00	0.34	3.54	2.45	0.00	6.45	0.74	0.00	0.00	1.63	1.34
9	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.50	3.28	1.12	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	1.50	5.78	0.00	16.49	1.30	0.00	5.60	18.56	11.85	0.91	0.00	2.81	3.80	1.80	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	1.63	1.34
10	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	4.57	1.17	1.37	1.00	1.36	3.26	1.97	2.57	3.37	2.60	0.83	9.53	1.90	1.70	11.08	10.55	8.79	1.88	0.45	1.24	4.50	1.36	0.50	7.19	5.18	1.53	0.26	1.44	2.26
11	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	1.24	0.62	1.29	2.76	0.94	1.85	1.16	2.83	2.48	1.95	0.69	3.92	1.50	1.22	4.61	3.55	2.01	1.11	0.61	0.00	1.10	0.69	0.00	4.14	1.10	0.30	0.00	1.25	2.06
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	8.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.56	5.73	5.63	3.23	11.17	2.77	7.51	7.97	10.48	13.46	4.62	0.00	4.13	2.05	0.00	0.00	9.03	0.00	0.00	0.00	0.00	7.82
13	ER2a	ExonRegion	0	21.64	7.82	2.70	11.29	0.00	10.13	2.19	8.71	7.12	9.42	3.30	11.40	1.81	14.84	19.30	34.58	21.89	5.01	10.92	17.05	6.73	3.21	0.00	7.90	8.76	2.19	6.21	9.07	10.58
14	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.95	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	32.80	12.22	4.14	10.14	0.00	15.92	8.53	16.17	5.02	9.35	0.00	16.63	7.39	19.43	0.00	57.53	26.49	4.88	8.09	21.58	7.70	7.15	0.00	23.15	6.82	5.28	6.86	12.22	5.88
16	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00
17	E2a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2a_E6a	NovelJunction	0	7.96	0.00	1.10	0.00	0.00	7.10	0.00	4.78	1.34	5.39	2.91	2.71	1.62	3.90	0.00	3.52	3.51	0.00	0.00	4.13	1.93	0.00	4.33	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78
19	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.36	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	13.05	13.90	2.31	9.22	0.00	9.74	4.18	11.58	2.34	8.08	2.64	8.68	3.82	13.19	13.47	36.05	13.20	2.10	3.15	4.36	3.74	4.39	1.34	8.95	6.03	1.21	1.19	3.99	3.09
21	E3_Da	NovelBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	2.98	0.00	1.13	0.00	0.00	6.93	0.00	0.00	0.00	3.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	1.11	0.00	0.00	3.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
23	E3a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	2.08	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	7.80	3.67	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	2.11	0.00
24	E3a_E6a	NovelJunction	0	9.02	0.00	2.64	0.00	0.00	8.56	2.86	15.13	4.11	7.71	0.00	13.40	4.24	8.44	28.30	35.34	11.43	4.62	0.00	4.13	6.18	0.00	1.97	5.56	10.65	1.93	0.00	0.00	1.39
25	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.65	1.59	0.51	0.00	0.74	0.31	0.00	1.26	0.72	0.55	0.36	0.71	0.00	0.63	2.17	3.60	1.36	0.59	0.24	0.30	1.81	0.00	0.00	0.82	0.58	1.30	0.14	0.37	0.46
26	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.23	2.44	0.00	0.00	0.00	0.53	0.20	0.35	0.22	0.28	0.23	2.46	0.00	1.83	1.93	3.59	2.28	0.52	0.00	1.05	1.24	0.34	0.00	0.41	1.55	0.04	1.40	0.92	0.47
27	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.45	0.00	0.00	0.66	0.00	0.87	0.00	0.34	0.00	0.39	0.69	0.52	1.47	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.84	0.03	0.10
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.95	0.00	3.21	5.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	2.11	1.39
29	ER4a	ExonRegion	0	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	2.34	0.42	1.21	0.84	0.00	1.81	0.68	0.41	0.00	3.54	1.78	1.12	5.55	1.60	0.89	0.16	0.00	0.32	1.77	2.73	0.00	0.22	0.43
30	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	1.54	0.00	0.00	7.57	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00
31	E4a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	2.44	1.16	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	3.82	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00
32	Ix	Intron	0	0.33	5.26	0.17	0.75	0.25	2.50	1.26	1.15	1.89	2.03	0.99	4.49	0.20	1.34	6.89	7.49	4.11	0.60	2.99	3.42	2.89	0.00	0.28	2.57	0.74	0.41	0.86	0.85	1.42
33	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.26	4.81	0.20	0.87	0.30	2.83	1.10	1.23	2.00	2.01	1.15	5.15	0.23	1.40	8.02	7.56	4.79	0.58	3.48	3.65	3.02	0.00	0.33	2.61	0.87	0.48	1.00	0.89	1.45
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	8.02	12.31	0.00	25.24	0.00	9.94	5.84	0.00	8.37	5.71	3.70	21.51	1.40	6.03	8.37	55.23	9.57	4.62	8.09	3.56	9.99	0.00	0.00	7.90	5.61	1.59	0.00	5.62	6.21
35	ER5a	ExonRegion	0	1.96	2.49	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.13	1.12	0.60	1.48	0.26	0.00	0.38	0.00	5.93	0.78	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	1.15	3.06	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	13.77	0.00	0.00	0.00	35.61	18.65	0.00	36.06	7.27	4.18	30.66	4.65	10.46	18.34	67.09	25.93	4.62	16.18	10.50	16.65	0.00	1.87	8.67	5.15	1.67	0.00	0.00	6.50
37	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	9.70	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	3.96	2.04	2.91	1.30	0.00	1.13	0.00	7.11	2.32	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	0.00	3.05	7.01	0.00	0.00	0.00	0.00
38	Ix	Intron	0	2.98	3.64	0.61	11.03	2.51	5.95	3.99	1.62	5.25	4.97	2.70	14.07	0.47	3.71	9.51	24.93	14.99	2.28	5.85	5.57	9.41	0.40	0.53	5.36	5.76	1.73	1.34	2.63	4.40
39	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.99	3.65	0.61	11.06	2.51	5.96	4.00	1.62	5.27	4.99	2.71	14.11	0.48	3.72	9.54	25.00	15.03	2.29	5.87	5.59	9.44	0.40	0.53	5.38	5.78	1.73	1.35	2.64	4.41
40	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.09	10.78	0.00	5.56	7.61	0.00	1.34	5.51	0.00	13.76	5.76	3.06	16.14	32.13	17.89	9.25	0.00	10.92	8.82	0.00	0.00	19.32	1.70	1.72	0.00	6.29	12.35
41	ER6a	ExonRegion	0	7.59	11.83	1.41	4.90	0.74	9.31	3.66	7.54	6.25	7.33	2.60	8.91	2.12	8.91	7.91	41.02	19.74	4.71	12.13	9.46	6.49	2.14	0.82	16.62	14.84	3.09	1.34	5.37	6.37
42	ER6b	ExonRegion	0	1.94	0.00	1.19	5.66	0.00	3.28	0.00	1.54	1.16	2.38	2.30	2.07	0.50	2.78	0.36	12.08	5.62	2.73	15.33	4.26	4.33	0.00	0.00	4.79	2.12	0.00	0.47	0.00	1.08