Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC000120.1	Gene	0	1.44	2.42	0.91	2.07	0.94	1.59	1.04	0.83	3.27	3.34	0.11	5.24	0.75	2.05	3.45	4.67	4.98	1.78	3.18	0.99	2.75	0.12	0.52	1.66	1.51	1.16	1.41	3.82	3.79
2	414227	Transcript	0	0.66	1.11	0.42	0.95	0.43	0.73	0.47	0.38	1.49	1.53	0.05	2.44	0.34	0.93	1.58	2.13	2.31	0.81	1.45	0.45	1.26	0.05	0.24	0.76	0.69	0.53	0.64	1.74	1.73
3	ER1a	ExonRegion	0	1.98	3.32	1.25	2.84	1.29	2.18	1.42	1.13	4.48	4.57	0.16	7.10	1.02	2.80	4.73	6.40	6.76	2.44	4.35	1.35	3.75	0.16	0.72	2.27	2.07	1.59	1.93	5.23	5.20
4	E1_Da	NovelBoundary	0	16.99	9.31	10.29	10.35	0.00	5.41	5.49	4.98	19.22	11.54	14.01	14.61	13.41	2.44	29.30	7.27	30.43	9.25	0.00	0.00	15.76	4.86	7.39	0.00	1.89	6.35	0.00	4.22	5.25
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	2.51	1.89	0.33	1.40	0.00	3.22	0.39	1.44	3.94	4.80	3.26	6.63	0.51	1.06	3.60	5.55	3.50	2.26	3.75	1.46	5.02	0.70	0.35	2.94	2.51	0.00	0.00	6.69	1.96
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.51	1.89	0.33	1.40	0.00	3.22	0.39	1.44	3.94	4.80	3.26	6.63	0.51	1.06	3.60	5.55	3.50	2.26	3.75	1.46	5.02	0.70	0.35	2.94	2.51	0.00	0.00	6.69	1.96
8	Ix	Intron	0	2.26	3.52	0.93	2.52	0.74	2.07	2.94	1.11	11.76	5.08	1.44	7.69	0.88	1.68	7.81	8.15	7.36	2.16	8.36	2.66	4.09	0.27	0.18	3.46	1.37	0.32	1.93	1.39	3.49
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.66	2.57	1.24	4.13	1.21	2.26	2.49	1.07	11.37	5.40	1.31	8.11	0.64	1.64	5.16	7.73	5.85	2.03	7.79	1.91	4.35	0.15	0.30	3.55	1.51	0.26	1.36	1.53	3.28
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.64	5.00	0.43	0.00	0.00	1.78	3.64	1.17	12.37	4.59	1.64	7.03	1.25	1.75	11.98	8.81	9.73	2.37	9.22	3.82	3.68	0.46	0.00	3.33	1.14	0.41	2.84	1.17	3.83
11	Ix	Intron	0	4.02	3.51	1.05	0.90	0.61	2.75	1.51	1.61	17.65	3.79	0.30	7.31	1.37	0.68	10.32	8.65	8.40	2.97	5.59	1.03	5.35	0.00	0.45	3.50	1.97	0.39	0.00	1.43	5.10
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.10	3.96	1.18	1.01	0.69	2.98	1.70	1.82	19.23	4.16	0.34	7.71	1.50	0.74	11.63	8.93	9.29	3.35	6.30	1.16	5.92	0.00	0.51	3.94	2.21	0.44	0.00	1.61	5.52
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	5.27	0.93	0.00	4.29	0.38	0.18	0.00	6.58	1.40	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	1.79
14	Ix	Intron	0	3.70	8.00	0.00	2.91	1.98	2.37	2.05	0.56	8.53	5.72	1.33	7.45	2.04	2.75	6.27	7.74	8.34	2.61	8.11	1.12	5.22	0.37	0.37	5.25	2.61	0.80	0.00	2.98	4.88
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.72	8.03	0.00	2.93	1.99	2.38	2.06	0.56	8.57	5.74	1.33	7.48	2.05	2.76	6.30	7.77	8.37	2.62	8.15	1.12	5.24	0.37	0.37	5.27	2.62	0.80	0.00	2.99	4.90
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	94.79	92.20	52.45	198.01	41.12	91.24	61.22	120.33	156.43	90.12	55.27	205.06	51.30	68.24	223.44	162.33	83.22	32.36	40.24	38.37	82.91	55.38	27.43	106.89	83.57	66.04	98.50	61.24	192.96
17	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00