Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-166O4.2	Gene	0	1.61	1.13	0.84	0.00	3.67	1.10	0.61	1.29	1.85	2.10	0.60	3.80	0.78	1.45	4.47	3.41	4.71	1.54	0.96	0.41	2.00	0.90	1.27	2.48	1.86	2.44	2.48	3.67	2.95
2	413323	Transcript	0	1.25	0.65	0.16	0.00	0.44	0.60	0.10	0.49	0.85	0.84	0.36	1.46	0.35	0.56	1.51	1.73	1.43	0.51	0.85	0.00	0.82	0.45	0.38	0.95	1.66	1.34	2.16	1.16	1.73
3	442619	Transcript	0	0.43	1.13	1.18	1.20	0.89	1.07	0.65	0.60	1.63	1.27	0.40	3.63	0.18	0.78	1.53	2.31	4.23	0.70	0.14	0.46	1.40	0.75	0.60	2.23	1.06	4.17	0.86	1.79	2.21
4	IG13_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.74	0.56	0.00	0.00	1.71	0.00	0.70	0.32	0.00	0.25	0.00	1.91	0.00	0.32	0.81	0.37	0.52	0.34	0.00	0.96	3.68	0.00	0.32	1.86	2.17	0.55	0.00	1.42	1.40
5	IG13_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.93	1.46	0.66	1.13	9.27	0.71	0.48	1.24	4.81	1.94	0.24	2.29	0.56	1.70	12.20	3.90	3.13	2.48	2.40	1.28	5.75	0.64	0.36	1.19	2.66	1.74	0.80	5.28	2.30
6	IG13_SR5	SilentIntergenicRegion	0	2.17	2.67	1.01	0.66	7.18	1.14	1.19	2.36	4.87	4.14	0.94	4.37	0.98	2.52	12.09	2.51	6.69	1.66	3.23	0.76	5.15	0.70	0.50	2.21	6.23	2.40	1.70	8.27	4.63
7	IG13_AR13	ActiveIntergenicRegion	0	1.07	0.54	1.11	1.19	4.12	0.41	0.67	2.22	3.47	5.04	0.00	2.44	0.65	2.53	15.87	2.76	4.80	3.95	1.59	2.19	9.44	0.00	1.50	3.25	3.53	2.87	1.36	4.91	3.10
8	IG13_SR6	SilentIntergenicRegion	0	1.65	0.47	0.65	0.00	5.96	1.43	1.01	0.86	4.61	3.03	0.35	2.80	0.76	2.33	6.28	1.29	3.89	1.59	3.18	1.07	6.67	0.84	0.37	3.66	2.74	1.95	1.62	5.18	3.87
9	IG13_AR14	ActiveIntergenicRegion	0	0.60	2.58	0.45	0.00	6.39	1.57	1.79	0.57	5.18	4.77	0.78	3.32	0.05	2.03	1.35	3.80	3.61	0.00	1.90	0.00	9.03	0.58	0.44	1.39	0.64	0.49	2.87	3.56	2.81
10	IG13_AR15	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.23	2.02	0.00	0.00	14.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49
11	IG13_AR19	ActiveIntergenicRegion	0	0.55	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.53	0.43	0.57	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.69	1.12	0.89	2.64	0.00
12	ER1a	ExonRegion	0	1.65	0.60	0.97	0.00	2.89	0.79	0.40	2.89	3.50	3.37	0.68	3.83	0.00	1.84	5.90	6.27	3.76	1.88	0.00	0.00	0.27	0.33	1.72	2.52	1.67	0.01	0.72	2.56	3.39
13	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.50	3.60	0.00	4.52	0.00	0.86	15.95	3.75	7.45	0.00	0.00	0.00	3.65	2.19	0.00	7.96	3.03	0.00	2.34	7.86	9.47
15	ER2a	ExonRegion	0	0.83	0.07	0.02	0.00	0.65	1.00	0.14	0.10	0.24	0.29	0.04	1.12	0.68	0.45	1.74	1.08	1.56	0.04	0.00	0.00	0.66	0.14	0.96	1.54	0.26	1.27	0.10	0.26	0.27
16	E2_Ab	KnownBoundary	0	30.61	14.45	12.48	0.00	5.60	18.53	13.22	19.96	81.31	27.32	10.41	90.45	15.83	33.37	68.37	28.84	124.36	0.00	0.00	14.14	55.23	18.28	4.78	23.45	31.56	22.32	5.91	32.49	151.93
17	ER2b	ExonRegion	0	1.27	1.91	0.00	0.00	10.48	3.26	2.16	0.96	2.33	4.75	2.12	7.94	3.78	3.82	2.74	2.83	13.35	1.14	0.00	3.27	9.04	1.97	3.87	6.38	3.02	2.50	5.26	4.44	7.97
18	E2_Da	NovelBoundary	0	27.07	8.34	15.77	47.88	13.56	4.72	2.69	23.59	30.85	23.29	8.38	71.38	4.65	23.71	43.05	44.06	57.62	14.90	0.00	0.00	18.77	12.69	7.04	16.39	42.47	19.10	13.62	62.05	48.00
19	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E2b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
22	ER3a	ExonRegion	0	8.46	2.51	0.02	0.00	0.00	3.36	0.00	0.00	1.68	2.25	1.82	3.21	1.14	3.01	0.00	1.93	0.20	0.00	0.00	0.00	5.61	1.41	0.09	3.43	6.57	3.52	12.36	7.98	6.12
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3_Db	NovelBoundary	0	19.29	8.34	18.99	31.92	46.27	18.92	17.97	21.25	25.12	20.05	12.08	67.38	7.42	29.71	96.27	62.73	60.46	19.26	0.00	10.50	20.38	11.67	13.45	10.83	38.23	36.82	9.29	75.40	107.92
25	E3b_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER3b	ExonRegion	0	7.50	2.74	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	2.25	2.65	2.18	2.89	0.65	1.81	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	0.00	5.23	1.50	0.00	2.87	7.62	4.71	16.48	4.62	7.61
27	ER4a	ExonRegion	0	0.02	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.01	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.05	1.92	0.15	0.00	1.23
28	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E4a_E5b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.65	0.00	0.00	0.00	35.22	1.42	2.29	2.14	0.00	2.00	0.00	4.01	1.37	2.35	0.00	3.82	1.19	5.39	0.00	0.00	1.52	1.85	0.00	2.51	3.33	0.00	0.00	2.11	4.19
31	E5_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	7.00	0.00	0.00	1.61	0.00	8.61	2.44	0.00	0.00	4.16	1.62	0.00	0.00	3.06	1.96	0.00	0.00	0.00	1.80	2.14	0.00	0.00	1.52	10.13	0.00	3.95	3.37
32	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER5b	ExonRegion	0	2.90	3.23	3.61	0.00	11.02	0.64	2.57	2.72	3.42	2.33	0.54	8.76	1.70	2.39	9.02	4.75	11.36	2.10	2.88	1.24	3.58	3.22	0.58	4.63	2.99	5.03	7.39	11.29	4.09
34	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E5a_E6a	KnownJunction	0	3.01	8.92	9.99	10.78	0.00	8.56	5.84	4.68	12.61	7.15	3.13	29.58	1.59	6.07	0.00	14.84	32.05	0.00	0.00	4.13	9.19	6.17	2.41	15.73	8.64	31.50	6.26	10.24	16.74
36	ER5c	ExonRegion	0	0.00	1.78	0.25	0.00	0.00	0.94	0.25	0.95	0.78	0.44	0.00	3.87	1.44	0.35	4.43	4.36	6.12	2.16	6.79	0.00	0.44	1.63	0.38	0.66	3.75	4.74	0.00	1.81	2.57
37	E5_Db	NovelBoundary	0	2.89	0.00	1.37	0.00	0.00	7.44	8.07	12.34	12.33	7.71	0.00	26.96	8.34	8.40	19.73	18.13	15.58	9.25	0.00	4.05	16.85	4.76	0.00	11.13	1.55	3.43	14.61	16.53	16.04
38	E6_Aa	NovelBoundary	0	3.01	8.92	7.47	10.78	13.41	8.79	5.84	4.68	9.59	9.31	3.16	28.73	3.28	6.07	7.57	22.18	28.25	9.12	0.00	4.13	9.39	6.51	2.41	19.02	13.90	36.05	4.37	13.21	16.84
39	ER6a	ExonRegion	0	0.85	1.27	0.66	0.00	3.86	1.09	0.00	0.73	0.98	2.85	0.47	3.05	0.00	0.92	5.34	1.69	5.10	3.05	1.26	0.00	0.56	0.55	1.43	0.68	0.94	5.99	1.49	5.85	1.85
40	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	8.40	4.22	0.90	3.27	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	3.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00