Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	KLHL3	Gene	0	2.50	10.38	12.73	12.60	7.60	10.63	4.52	6.61	6.57	21.61	10.68	16.04	4.12	8.44	7.44	11.53	34.11	3.91	4.01	7.04	11.49	4.00	8.10	12.64	12.70	4.16	7.96	8.24	7.07
2	309755	Transcript	0	0.36	2.86	4.74	0.40	2.18	1.22	3.08	5.37	0.00	9.81	7.66	8.47	1.05	1.74	4.36	4.48	7.31	0.55	0.53	0.00	2.49	1.38	2.17	1.83	1.98	0.09	0.41	1.11	0.60
3	394937	Transcript	0	0.13	0.21	0.42	0.00	0.00	0.34	0.25	0.58	0.00	0.99	0.60	0.77	0.08	0.34	0.35	0.32	0.63	0.00	0.00	0.00	0.09	0.11	0.34	0.13	0.18	0.00	0.00	0.20	0.00
4	IG29_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	2.78	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	1.86	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	0.72	0.88	5.29	0.80	4.35	2.44	1.13	1.78	0.00	5.04	2.85	4.68	0.12	2.11	0.34	1.92	5.80	1.11	1.07	0.00	2.92	0.33	2.27	0.80	1.00	0.18	0.82	0.42	1.19
6	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	4.85	4.19	0.00	0.00	0.00	5.03	8.96	0.00	14.58	12.46	12.26	1.97	1.37	8.37	7.04	8.82	0.00	0.00	0.00	2.05	2.43	2.07	2.87	2.96	0.00	0.00	1.80	0.00
7	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER3a	ExonRegion	0	0.27	0.41	0.84	0.00	0.00	0.69	0.50	1.15	0.00	1.99	1.19	1.55	0.16	0.68	0.70	0.63	1.25	0.00	0.00	0.00	0.18	0.23	0.68	0.27	0.36	0.00	0.00	0.41	0.00
10	ER3b	ExonRegion	0	2.74	1.71	11.83	6.15	6.15	5.18	5.22	3.57	0.00	15.55	14.93	12.40	0.36	5.59	2.21	7.38	19.84	1.65	1.03	2.48	7.49	1.67	3.83	3.36	5.81	5.39	2.15	3.90	0.00
11	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	17.34	0.00	0.00	7.06	8.12	4.83	0.00	10.43	9.08	10.90	0.00	5.12	9.37	5.89	24.72	0.00	7.87	0.00	7.82	1.99	2.31	0.00	3.60	0.00	2.14	0.00	0.00
12	ER4a	ExonRegion	0	2.78	1.54	20.01	9.91	14.01	7.04	2.92	4.59	1.07	17.51	10.68	13.05	5.24	7.36	6.96	5.75	25.13	1.58	0.38	2.76	5.71	1.65	6.81	6.15	2.58	0.75	3.71	11.90	2.50
13	E4a_E5a	KnownJunction	0	5.25	0.00	10.04	8.20	6.78	3.34	2.23	2.54	0.00	27.00	8.86	9.94	1.59	6.38	7.97	3.82	18.75	9.25	0.00	3.39	4.09	1.99	6.60	0.00	7.88	0.00	0.00	8.58	2.01
14	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.84	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.80	1.95	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	1.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.59	2.52	2.29	1.61	1.41	0.65	1.57	2.87	1.39	1.06	0.00	1.84	1.08	2.66	10.46	1.58	0.00	2.58	2.00	0.21	0.63	1.34	1.17	0.00	1.50	1.53	0.00
16	ER5a	ExonRegion	0	2.04	2.69	10.80	9.29	0.08	6.69	2.02	6.52	3.04	20.45	12.15	18.54	1.94	8.47	0.41	5.56	33.09	1.97	6.68	8.20	8.39	5.51	8.09	6.08	7.06	3.45	4.59	16.27	0.70
17	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	6.80	0.00	0.00	6.68	2.92	0.00	1.71	14.94	7.43	18.95	7.23	7.93	0.00	16.75	30.07	0.00	0.00	3.72	5.78	9.33	2.12	4.43	3.64	1.89	2.53	7.50	3.17
18	ER6a	ExonRegion	0	0.00	3.89	15.66	2.24	9.75	9.20	2.98	5.74	1.93	19.07	8.92	17.33	1.80	9.89	5.77	6.89	38.02	4.77	3.00	7.59	6.83	5.30	8.92	2.85	11.09	3.32	4.79	6.42	1.37
19	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	14.54	4.76	0.00	44.06	7.33	2.46	6.72	0.00	7.23	5.63	18.40	1.72	9.00	0.00	10.79	37.43	9.89	0.00	8.02	6.98	2.48	9.26	0.00	12.09	0.00	2.44	9.48	3.50
20	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER7a	ExonRegion	0	5.96	7.20	5.51	23.27	9.51	8.96	5.04	3.00	1.98	19.71	8.21	18.58	1.13	7.50	1.12	9.75	30.42	3.00	3.70	7.56	7.64	4.00	9.98	2.09	8.26	5.70	5.64	5.65	1.85
22	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00
23	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	19.00	9.49	29.55	13.85	10.51	2.92	4.13	6.09	26.92	5.73	15.27	2.67	8.09	8.17	6.73	45.24	0.00	8.09	7.53	14.36	0.00	10.34	0.00	18.75	5.79	0.00	1.71	4.65
24	E7a_E9a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER8a	ExonRegion	0	3.63	20.07	10.06	13.56	3.02	11.55	3.86	5.81	2.37	19.08	12.36	15.40	3.80	9.92	0.96	10.27	37.02	9.28	0.70	8.72	10.78	4.31	6.10	1.78	10.92	3.92	3.99	7.89	2.94
26	E8a_E9a	KnownJunction	0	8.79	4.56	15.42	10.35	0.00	14.20	4.41	2.29	4.57	22.61	20.53	12.41	5.35	8.42	0.00	17.06	39.35	0.00	0.00	20.43	7.98	2.24	13.59	0.00	1.89	3.86	0.00	8.45	0.00
27	ER9a	ExonRegion	0	2.43	10.56	6.44	2.83	1.66	7.37	2.34	4.57	2.79	20.39	9.35	12.83	4.08	8.57	0.00	15.56	32.58	3.71	1.09	4.40	12.53	2.02	8.35	3.80	5.07	3.57	0.45	5.88	2.50
28	E9_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E9a_E10a	KnownJunction	0	2.48	8.05	3.46	10.78	0.00	3.57	2.92	0.00	0.00	11.02	10.66	6.11	5.16	5.52	0.00	6.43	21.65	4.62	0.00	15.71	9.35	0.00	2.07	2.45	7.20	0.00	2.24	6.25	1.75
30	E9a_E13a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	1.06	0.00	3.14	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E9a_E14a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	4.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	6.07	0.00
32	E10_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER10a	ExonRegion	0	0.73	9.35	8.49	4.65	3.00	5.09	2.20	3.53	2.50	10.44	4.80	11.11	3.13	5.45	0.00	9.42	23.15	3.47	1.19	4.41	7.28	0.02	4.81	1.68	4.05	2.04	0.22	5.04	0.63
34	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	23.17	9.52	0.00	13.26	3.41	0.00	12.29	1.46	7.71	1.52	2.59	3.18	5.03	0.00	20.73	23.90	4.62	0.00	7.03	0.00	0.00	10.79	0.00	6.93	1.76	0.00	4.58	1.72
35	ER11a	ExonRegion	0	1.66	9.57	6.71	0.63	5.76	4.51	1.56	3.11	0.51	9.48	4.80	6.30	1.98	4.77	1.19	7.09	22.24	1.16	0.11	3.48	4.18	2.31	9.01	2.26	4.07	2.52	1.09	3.56	0.98
36	E11_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
37	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.27	10.35	0.00	6.60	0.00	0.00	1.55	5.55	1.55	4.34	1.62	0.89	0.00	6.43	12.79	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	2.51	2.27	1.48	5.15	2.34	2.29	1.98
38	E11a_E13a	NovelJunction	0	0.00	9.11	0.00	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	0.00	1.92	3.16	4.28	1.21	0.00	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	3.26	0.00	0.00	6.02	0.00
39	E12_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER12a	ExonRegion	0	1.07	3.22	8.02	2.51	5.13	4.07	0.28	0.00	0.33	8.29	1.84	5.84	0.36	2.36	0.00	5.63	19.12	0.00	0.00	2.89	3.48	0.90	6.40	2.74	2.65	1.12	4.22	0.37	1.59
41	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.37	0.00	14.74	2.95	2.57	0.00	0.00	7.95	7.43	2.83	0.00	2.48	0.00	7.57	20.46	0.00	0.00	6.78	9.47	0.00	4.43	7.90	3.33	0.00	8.95	0.00	2.05
42	E13_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
43	ER13a	ExonRegion	0	0.32	7.74	7.03	13.09	3.67	5.49	1.38	0.73	1.22	5.08	5.66	4.90	2.04	3.12	0.82	6.24	21.96	2.24	0.00	8.48	4.10	1.57	3.20	3.13	5.52	2.70	1.63	3.35	0.60
44	E13_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E13a_E14a	KnownJunction	0	2.89	9.31	5.56	9.27	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	5.71	5.66	5.99	5.13	8.91	8.37	3.37	28.95	0.00	0.00	8.27	1.89	1.99	11.13	2.81	1.55	0.00	1.99	1.84	3.00
46	I13_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.02	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	0.40	2.19	0.73	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.48	0.00
47	E14_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.00	1.24	0.00	0.00	5.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00
48	ER14a	ExonRegion	0	1.26	7.73	11.19	9.49	5.23	6.94	3.33	5.29	1.69	9.42	6.98	12.30	3.12	7.76	2.58	10.19	24.96	2.81	0.00	9.65	8.62	3.99	4.33	3.65	9.78	5.53	5.30	4.14	2.67
49	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	4.85	21.48	40.77	0.00	0.00	5.84	5.97	1.61	9.51	1.52	9.25	3.57	2.19	0.00	9.10	24.13	9.12	0.00	6.62	12.59	2.29	2.46	0.00	3.45	4.38	5.07	1.89	5.18
50	ER15a	ExonRegion	0	0.76	13.19	11.96	13.86	8.72	7.08	1.72	5.92	0.91	14.55	4.60	16.31	2.48	8.48	3.77	8.61	38.18	5.02	0.00	5.74	8.15	4.58	1.92	1.42	9.03	6.88	1.69	3.88	2.61
51	E15_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	8.43	5.13	26.75	0.00	3.45	0.00	14.08	2.68	21.93	4.24	18.76	1.62	5.52	8.77	15.45	45.06	4.62	0.00	14.56	11.07	4.23	2.46	2.27	5.08	20.64	2.09	7.82	1.85
53	ER16a	ExonRegion	0	2.93	12.32	14.45	15.51	8.61	12.89	5.58	8.04	9.11	25.98	12.50	18.51	5.16	9.65	10.18	13.68	39.15	4.48	5.32	8.19	13.92	4.76	9.34	17.41	16.12	4.76	10.56	9.92	9.70