Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	CDX1	Gene	0	31.79	3.62	7.23	1.04	0.43	6.74	7.55	1.28	3.73	4.44	0.79	6.36	1.77	2.87	0.80	1.54	6.02	11.44	5.19	6.52	0.41	6.33	1.84	0.87	6.47	7.94	6.49	0.24	16.33
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3	377812	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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10	E1a_E1d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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15	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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17	E1c_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER2a	ExonRegion	0	31.08	1.30	5.94	0.55	0.00	15.13	13.78	1.29	2.81	5.42	1.66	10.53	1.81	2.41	0.00	0.09	9.36	23.72	6.85	12.98	1.96	5.38	1.08	0.65	9.60	11.21	3.84	0.13	27.80
20	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	35.04	7.08	24.47	9.06	0.00	10.82	19.91	0.00	0.00	3.87	0.00	5.45	0.00	1.09	0.00	0.00	6.80	23.89	0.00	6.62	0.00	2.48	2.27	2.27	10.80	8.33	0.00	1.93	22.88
22	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58
23	ER3a	ExonRegion	0	34.74	0.66	13.44	2.05	0.00	7.21	6.73	0.00	1.78	2.40	0.00	7.81	0.76	2.12	0.00	1.35	5.69	15.90	4.04	10.23	0.33	3.63	1.52	0.97	6.27	6.44	1.79	0.46	24.46
24	E3_Ab	KnownBoundary	0	59.46	0.00	9.37	0.00	0.00	5.26	2.35	0.00	0.00	1.60	1.27	8.40	0.00	0.00	0.00	3.82	8.24	32.36	16.18	0.00	3.85	4.38	0.00	4.96	8.68	5.88	9.99	0.00	20.01
25	ER3b	ExonRegion	0	47.25	7.25	3.23	0.00	3.44	11.02	8.92	0.00	1.07	8.58	1.68	11.70	0.88	2.41	0.00	3.35	7.54	22.64	7.99	9.30	0.46	6.76	2.39	3.07	9.23	8.83	1.89	0.00	18.99
26	E3_Da	KnownBoundary	0	48.72	17.84	4.58	0.00	0.00	7.37	21.80	0.00	1.52	5.19	0.00	6.72	0.00	4.59	0.00	3.82	4.05	24.66	0.00	21.67	0.00	11.52	7.14	0.00	10.65	11.46	2.34	0.00	14.76
27	ER3c	ExonRegion	0	55.56	7.23	12.13	1.59	0.68	10.15	12.77	2.75	7.19	7.93	1.38	9.77	3.56	5.60	1.88	2.94	10.24	16.02	9.34	9.70	0.48	11.68	3.58	1.46	11.02	13.97	13.69	0.33	25.94
28	E3_Db	KnownBoundary	0	22.89	0.00	8.87	9.49	0.00	0.00	7.72	1.89	1.34	3.83	0.00	4.31	0.00	2.08	0.00	3.82	0.88	0.00	0.00	7.36	0.00	6.32	4.24	0.00	1.63	1.97	10.24	0.00	8.29
29	ER3d	ExonRegion	0	11.34	1.29	5.04	2.13	0.00	2.11	0.84	0.00	3.29	1.09	0.00	3.19	0.00	0.24	0.00	0.62	1.74	6.70	0.04	1.73	0.00	4.74	0.07	0.00	1.53	2.52	1.37	0.65	3.61