Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC020901.1	Gene	0	16.66	16.59	13.32	49.78	17.21	12.44	11.92	12.10	16.84	15.60	18.23	11.64	6.05	17.22	29.53	18.44	25.22	15.17	18.78	7.41	16.14	18.23	14.38	16.57	13.44	15.36	14.27	41.08	16.89
2	502041	Transcript	0	2.74	2.05	1.88	33.72	9.97	5.85	11.21	1.14	7.26	9.71	11.23	2.98	3.46	8.33	21.73	9.37	9.45	6.94	8.09	0.00	10.53	0.00	9.28	1.53	0.97	15.13	2.34	22.88	17.52
3	500148	Transcript	0	2.91	1.41	2.69	9.48	1.74	3.55	3.75	0.93	0.47	2.67	3.78	2.08	1.53	2.80	2.03	1.10	6.19	12.66	0.96	1.03	2.11	1.70	7.65	1.77	2.12	4.76	0.94	14.20	6.37
4	501927	Transcript	0	3.00	2.53	2.11	4.20	0.87	3.09	1.34	1.69	1.57	1.77	3.04	1.20	1.17	2.10	3.31	1.71	4.69	4.17	1.64	1.25	4.98	4.10	2.82	1.70	2.84	4.82	1.26	9.98	1.66
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.41	0.00	6.40	6.23	0.26	0.00	0.00	0.00	2.44	0.15	0.39	1.38	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	4.38	0.17
6	ER1b	ExonRegion	1	3.19	5.59	7.62	64.88	38.90	11.87	5.75	7.44	10.49	25.50	24.56	6.76	5.58	8.22	16.44	21.97	20.99	5.52	7.90	1.32	13.93	9.09	19.78	7.32	6.78	9.30	14.65	47.51	13.31
7	E1_Ac	KnownBoundary	0	12.21	4.75	19.88	185.06	79.29	15.12	21.86	17.62	29.39	47.50	50.20	21.05	9.20	21.25	64.78	56.61	47.27	28.38	32.37	6.78	32.85	18.18	46.00	19.80	18.03	30.38	34.29	105.05	35.39
8	ER1c	ExonRegion	0	29.85	10.90	17.70	105.82	22.39	16.67	20.74	13.67	20.75	24.28	24.03	18.39	8.32	28.09	29.71	26.83	29.66	12.81	14.98	14.71	27.59	12.73	23.28	11.12	14.01	28.72	19.98	48.52	29.82
9	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.55	8.39	0.00	4.52	1.62	3.06	0.00	0.00	2.66	4.62	8.09	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	1.68
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	8.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	0.00	5.31	1.61	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	2.52	4.62	0.00	0.00	5.01	2.19	6.75	0.00	1.74	10.08	0.00	26.15	10.07
11	E1a_E3a	NovelJunction	0	8.49	9.02	1.40	8.41	0.00	7.06	4.63	6.82	0.00	7.31	4.81	1.14	1.50	1.75	9.77	0.00	9.41	4.62	8.09	3.14	4.09	4.42	4.48	5.98	1.78	21.16	7.60	25.39	5.12
12	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E5a	NovelJunction	0	13.09	4.75	7.55	32.35	0.00	9.36	23.86	4.73	20.07	28.60	43.94	16.14	8.12	15.64	23.92	44.98	18.14	4.62	8.09	10.42	29.16	2.24	8.86	2.99	13.68	10.39	27.43	34.46	19.78
14	E1a_E5b	KnownJunction	0	5.49	3.68	3.76	61.04	13.71	11.43	22.43	2.29	14.53	16.98	22.30	5.57	5.54	16.66	43.45	18.74	18.28	13.87	16.18	0.00	21.06	0.00	18.57	3.05	1.93	28.80	4.67	41.38	34.86
15	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.62	0.00	0.00	0.71	0.36	0.00	0.00	0.76	0.50	0.21	0.71	0.56	0.48	0.44	0.00	1.32	2.38	1.38	0.88	2.21	0.00	0.00	0.19	0.00	0.63	0.00	0.23	0.80
16	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.08	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	1.15	0.52	0.00	2.10	1.07	0.29	0.00	0.00	1.88	0.69	0.57	1.21	3.35	0.00	0.00	0.68	0.77	0.28	0.00	0.29	0.24
17	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.29	0.00	2.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.19	0.00	3.47	1.28	0.79	1.85	0.00	7.25	1.46	0.00	0.86	0.70	0.38	0.80	1.02	1.14	0.28	1.47	2.98	0.10
18	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	1.93	0.00	1.67	2.32	0.00	2.97	0.00	12.61	0.16	0.00	0.99	1.17	0.81	2.27	0.04	0.00	1.57	0.00	2.08	3.13
19	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	1.63	0.00
20	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.75	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	0.21	0.00
21	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.31	0.55	1.02	0.70	0.00	0.00	0.00	0.92	0.44	0.00	0.00	3.31	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	1.19	0.00
22	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I1_SR6	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.72	0.00	1.37	0.00	0.51	0.00	0.27	0.00	0.62	0.00	0.54	0.05	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00
25	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.22	0.00	0.00	4.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	2.57	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00
26	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.76	0.59	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.43	0.00	0.00	1.98	0.00	0.00	0.00	2.51	0.87	1.93	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00
27	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.44	0.57	0.00	1.98	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.97	0.11	0.08	0.00	0.17	0.85	0.23	0.27	0.35	0.59	0.00	1.98	0.33	0.00	1.67	0.00	0.00	0.09	0.41	0.00
28	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.49	0.00	0.36	0.00	0.98	2.32	0.42	1.26	1.48	4.08	0.00	0.00	0.78	1.13	0.62	0.72	0.76	1.59
29	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.31	1.31	0.17	2.19	0.50	0.42	0.00	0.19	0.00	0.73	0.12	0.50	0.00	0.09	0.94	0.50	0.91	0.20	0.32	0.00	1.59	0.00	0.37	0.21	0.73	0.64	0.19	0.82	0.41
30	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.25	1.80	0.20	1.70	0.58	0.00	0.38	1.25	1.17	0.68	0.42	0.73	0.00	0.00	0.00	0.88	0.47	2.28	0.00	0.00	1.25	0.43	0.00	0.00	0.34	0.56	0.00	2.80	0.00
31	Ix	Intron	0	1.75	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.80	1.03	0.00	1.57	0.26	0.00	0.00	0.00	0.76	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	4.48	0.00
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.20	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	0.99	1.30	0.00	1.80	0.21	0.00	0.00	0.00	0.96	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	4.93	0.00
33	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	1.26	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.83	0.00
34	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.57	1.09	0.00	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	1.56	0.00	0.31	1.85	0.84	0.01	1.95	0.00	0.00	0.96	1.22	0.61	0.38	0.24	0.00	0.00	0.55	0.06
35	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	1.43	0.00	0.00	0.00	1.34
36	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.51	0.69	0.36	0.00	0.00	2.51	0.00	0.08	0.26	0.53	0.00	2.15	0.00	0.78	2.36	1.07	1.58	1.83	0.69	0.00	2.35	0.00	0.39	0.16	0.12	0.00	0.00	0.95	0.50
37	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.18	0.00	0.31	1.32	0.00	0.51	0.00	1.29	0.00	0.88	0.00	0.79	1.43	0.50	2.02	0.91	2.77	1.98	1.18	0.00	1.93	0.00	0.33	0.00	0.00	0.29	0.67	1.89	0.00
38	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.36	4.85	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.04	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER2a	ExonRegion	0	2.41	0.08	2.09	7.40	2.35	3.52	3.27	1.08	0.01	2.46	2.11	1.45	3.12	2.15	0.39	0.00	3.70	8.97	0.00	2.84	2.98	1.76	3.03	3.78	2.51	4.73	0.00	17.31	3.76
40	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	3.04	0.00	2.22	0.00	7.50	5.00	4.62	0.00	0.00	3.53	2.48	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	4.13	0.00
41	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.65	0.00	2.79	21.57	5.89	3.41	0.00	0.00	0.00	1.96	4.84	0.00	1.40	2.22	0.00	0.00	5.99	9.25	0.00	0.00	0.00	2.48	9.41	0.00	3.64	1.72	0.00	8.00	0.00
42	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	Ix	Intron	0	1.81	2.42	0.48	1.92	1.51	0.76	0.17	0.61	1.20	1.70	0.49	1.60	0.56	1.04	1.19	1.20	3.63	1.36	0.46	0.17	2.12	0.48	0.41	0.49	0.71	0.71	0.23	2.96	0.69
44	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.28	1.22	0.39	0.86	0.88	0.49	0.36	0.42	0.91	1.96	0.18	0.76	0.37	0.98	1.66	1.33	2.21	0.90	0.38	0.42	1.79	0.32	0.43	0.39	0.43	1.13	0.55	2.48	1.04
45	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.84	1.55	0.36	2.25	2.30	0.91	0.11	0.70	0.86	1.45	0.66	1.96	0.22	0.78	0.24	1.44	3.68	0.85	0.50	0.07	2.50	0.64	0.47	0.68	0.90	0.66	0.00	2.58	0.61
46	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.48	5.30	0.79	2.81	1.15	0.91	0.00	0.72	2.10	1.71	0.65	2.17	1.32	1.52	2.02	0.67	5.42	2.72	0.50	0.00	1.97	0.46	0.28	0.34	0.79	0.25	0.14	4.16	0.35
47	E3_Aa	NovelBoundary	0	14.45	4.85	0.00	0.00	7.37	1.96	0.00	0.00	2.77	4.07	0.00	0.00	0.00	3.50	8.37	0.00	6.17	0.00	0.00	3.97	1.80	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	2.53	6.69	0.00
48	ER3a	ExonRegion	0	3.59	7.84	3.37	5.99	0.54	2.55	2.96	2.37	0.00	1.46	4.82	1.74	1.83	1.79	6.21	1.56	7.92	13.71	1.96	3.35	1.80	2.89	9.43	3.97	1.76	4.18	1.35	16.34	5.60
49	E3_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	8.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	E3a_E4a	NovelJunction	0	11.09	0.00	3.49	0.00	6.93	6.91	0.00	0.00	1.25	3.64	1.61	0.00	0.00	3.61	0.00	3.82	9.18	0.00	8.09	0.00	7.14	12.06	4.73	2.81	3.49	10.34	4.08	7.95	4.52
51	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	1.96	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	3.10	0.00	3.39	0.00	0.00	3.85	18.49	0.00	0.00	0.00	0.00	4.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.95
52	E4_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	1.56	0.00	1.20	0.00	3.35	0.00	0.00	7.47	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	4.90	0.00	0.00	0.00	5.84	0.00
53	ER4a	ExonRegion	0	9.01	7.58	5.22	12.59	2.62	7.30	4.02	5.08	4.72	5.31	9.12	3.59	3.52	5.38	9.94	5.13	14.06	12.51	4.92	3.74	8.89	12.29	8.46	5.10	8.52	12.66	3.79	29.94	4.97
54	E4_Da	NovelBoundary	1	0.00	0.00	1.22	0.00	6.34	3.41	0.00	0.00	8.50	8.71	8.45	1.23	1.27	1.91	0.00	3.37	11.64	9.25	0.00	0.00	2.05	16.48	13.45	0.00	7.39	0.00	0.00	30.91	3.10
55	E4a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	1.52	5.79	0.00	0.00	0.00
56	E4a_E5b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	Ix	Intron	0	7.92	6.02	4.44	12.91	2.31	3.91	3.63	3.67	2.71	2.33	4.29	2.23	3.93	3.13	9.41	3.76	11.46	12.17	1.82	0.78	6.22	14.87	8.74	2.85	9.35	8.64	3.13	26.73	4.32
58	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.95	6.04	4.45	12.96	2.32	3.92	3.64	3.68	2.72	2.34	4.30	2.23	3.94	3.15	9.45	3.78	11.50	12.22	1.82	0.79	6.24	14.92	8.77	2.87	9.38	8.67	3.14	26.83	4.33
59	Ix	Intron	0	3.82	3.64	1.64	4.30	2.84	3.65	1.21	1.44	2.76	3.28	2.19	2.20	0.75	2.04	6.18	2.08	8.79	3.68	2.44	1.21	4.07	4.46	2.50	2.11	3.82	2.40	1.00	11.29	1.63
60	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	12.16	2.67	2.70	18.21	3.68	7.61	1.14	2.95	6.34	8.39	5.61	2.93	1.31	2.97	10.93	7.41	12.66	8.21	4.81	2.82	7.61	14.11	4.79	6.04	5.03	4.44	1.87	21.20	2.78
61	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	8.78	10.22	4.88	11.92	5.41	9.49	3.83	2.48	5.40	8.72	5.08	6.99	2.28	5.96	7.84	4.42	18.42	10.59	4.55	2.18	10.09	13.82	8.00	2.07	8.22	5.97	3.36	26.83	7.08
62	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	3.22	2.42	0.21	3.01	1.83	3.19	1.61	1.61	3.18	2.29	3.64	0.75	1.03	1.55	4.31	1.59	3.82	4.80	3.05	1.38	3.34	5.09	2.08	2.61	4.38	2.55	0.82	11.90	2.01
63	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.66	3.31	0.51	0.70	1.50	1.14	1.74	0.28	1.18	2.06	0.46	0.88	0.42	2.54	4.27	0.50	3.32	1.25	1.16	0.42	2.90	1.21	2.16	0.76	1.86	0.24	0.96	7.64	0.41
64	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.20	3.02	1.21	1.85	3.52	1.40	0.52	1.19	1.60	2.34	0.79	1.94	0.41	0.71	6.38	0.95	8.43	2.18	2.75	1.12	3.56	0.66	1.24	2.27	3.00	1.35	0.11	6.27	0.00
65	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.03	4.83	3.62	0.00	4.98	1.53	0.08	1.29	2.20	0.38	0.36	1.70	0.44	1.61	0.32	1.86	11.23	0.00	0.00	0.80	0.00	1.29	1.19	1.95	2.21	0.00	0.55	7.44	0.00
66	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.73	3.40	1.69	0.12	1.76	2.98	0.40	0.78	1.77	1.40	0.48	1.67	0.26	0.96	5.00	1.04	7.37	1.23	0.97	0.47	1.00	1.20	1.52	0.96	2.50	1.07	0.93	5.67	0.68
67	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.55	1.03	0.91	2.12	2.35	3.21	0.32	1.64	2.03	1.24	1.91	1.36	0.21	1.68	7.40	1.23	10.46	1.24	1.02	0.88	3.67	2.14	0.00	1.16	3.60	3.60	0.00	9.19	0.75
68	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.41	0.00	4.38	0.00	1.52	0.00	1.36	0.00	2.44	0.00	0.00	2.12	4.62	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	2.45	0.00	2.02	0.00	0.00	1.78
69	E5_Ab	NovelBoundary	0	2.42	0.00	0.00	16.39	5.60	3.91	4.35	6.52	0.00	2.04	2.40	2.29	0.00	3.79	0.00	6.43	12.61	9.12	0.00	0.00	0.00	2.48	1.87	0.00	0.00	3.43	3.78	5.12	3.76
70	ER5a	ExonRegion	0	0.71	0.55	5.61	21.94	1.66	9.85	11.42	2.15	2.81	4.81	9.32	6.18	0.87	7.26	5.60	5.06	13.19	20.92	3.77	0.00	2.85	0.90	12.66	2.87	3.10	7.86	4.27	17.39	13.87
71	ER5b	ExonRegion	0	21.15	21.29	19.53	66.96	24.90	15.12	16.06	17.82	23.07	21.07	23.89	16.27	7.92	23.77	40.67	25.71	33.07	18.64	28.07	8.98	20.40	25.67	18.11	23.90	18.56	18.22	19.42	51.82	23.13
72	E5_Da	KnownBoundary	0	8.67	63.02	14.63	40.77	35.66	21.68	14.88	2.44	28.47	10.71	32.11	22.95	6.46	29.53	26.31	23.26	30.59	10.02	8.09	8.27	13.52	14.05	15.61	39.00	8.45	4.29	9.69	23.86	22.35
73	ER5c	ExonRegion	0	11.63	29.40	2.16	25.56	12.22	13.62	7.99	3.02	22.05	10.57	13.11	7.48	2.16	12.75	36.66	15.16	18.82	7.97	17.88	6.13	10.63	6.78	4.92	18.81	4.35	2.94	16.36	15.92	9.47