Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-280F2.1	Gene	0	0.69	0.46	0.07	13.68	1.57	0.52	0.56	0.30	0.48	0.74	0.14	0.34	0.24	0.52	3.63	1.11	0.72	3.06	2.47	8.86	2.18	4.65	1.55	1.32	1.52	1.90	1.52	1.76	1.74
2	473636	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.33	2.40	0.87	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.34
3	477210	Transcript	0	0.85	0.00	0.00	12.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	1.03	0.77	1.27	16.19	2.60	0.00	0.00	0.86	0.06	0.00	0.73	0.05	0.65
4	484698	Transcript	0	0.10	0.07	0.05	5.13	0.06	0.29	0.06	0.04	0.06	0.17	0.02	0.24	0.09	0.20	0.36	0.16	0.32	0.66	0.53	0.34	0.19	1.78	1.02	0.21	0.70	0.75	0.69	0.88	1.08
5	479612	Transcript	0	0.42	0.00	0.00	18.16	2.02	0.23	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.97	0.91	5.08	1.66	0.26	6.21	2.14	29.19	4.36	5.79	2.31	1.39	1.01	1.43	1.23	0.27	1.27
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
8	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68
9	ER1d	ExonRegion	0	1.19	0.00	0.00	3.97	5.41	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.34	0.37	0.18	4.57	0.23	1.75	0.53	1.77	19.05	4.98	17.58	4.79	1.79	1.40	3.98	8.53	4.46	8.45
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	3.67	3.42	0.00	0.00	22.08	2.05	26.59	6.70	0.00	4.43	5.41	0.00	1.66	18.09
11	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
12	E1a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.58	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	2.08	0.00	0.00	158.23	11.96	0.92	0.00	0.89	0.15	0.00	0.00	0.00	0.72	1.89	2.24	0.80	4.53	6.55	1.94	40.18	9.63	27.40	6.01	6.06	2.64	10.73	7.36	5.64	11.27
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.05	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	183.77	18.42	1.92	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	2.30	0.00	7.87	29.77	0.00	25.14	2.31	2.27	4.89	9.70	13.12	0.00	0.00
17	E2a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	2.50	2.00	2.78	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	9.25	0.00	20.18	0.00	4.23	2.31	9.15	0.00	1.80	0.00	0.00	5.12
18	E2a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	1.68
19	E2a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98
20	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	1.30	2.09	1.43	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	1.36
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER4a	ExonRegion	0	1.26	0.00	0.00	43.29	2.75	2.12	0.39	0.00	1.78	0.80	0.00	0.94	0.63	0.68	9.14	0.47	1.54	2.48	5.15	34.12	6.46	21.74	3.99	1.80	6.05	6.88	8.72	1.93	1.08
23	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	18.98	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	1.99	0.00	2.98	0.00	9.25	0.00	34.07	11.75	28.68	2.41	5.38	1.82	6.14	3.93	0.00	2.77
24	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	1.26	0.00	0.00	12.40	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4b	ExonRegion	0	2.17	0.00	0.00	51.98	4.55	1.45	1.94	0.00	0.74	0.38	0.00	0.41	0.17	0.41	3.87	3.81	1.20	7.81	0.84	44.26	7.54	21.57	5.24	2.77	5.70	5.75	5.29	1.24	6.95
26	E4_Db	KnownBoundary	0	5.19	0.00	0.00	67.30	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	2.80	0.00	7.77	0.00	0.00	4.62	0.00	32.75	6.74	13.71	4.24	5.92	5.61	12.70	0.00	0.00	6.04
27	ER4c	ExonRegion	0	0.42	0.00	0.00	18.16	2.02	0.23	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.97	0.91	5.08	1.66	0.26	6.21	2.14	29.19	4.36	5.79	2.31	1.39	1.01	1.43	1.23	0.27	1.27
28	E4_Dc	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	20.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00
29	ER5a	ExonRegion	0	1.71	0.00	0.00	13.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.80	1.54	2.55	19.98	1.11	0.00	0.00	1.71	0.11	0.00	1.46	0.10	1.30
30	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	25.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	4.62	0.00	48.21	0.00	7.05	0.00	0.00	3.64	3.69	0.00	0.00	6.34
31	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.73	0.00	0.00	17.06	0.00	0.47	0.69	0.00	0.00	0.00	0.40	0.42	0.00	1.23	0.00	0.84	0.51	1.31	0.00	15.40	0.48	2.45	0.61	1.46	1.46	1.07	0.00	0.55	5.47
32	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E6_Aa	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	3.08	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.87	0.00	1.72
34	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	10.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	2.10	0.86	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	1.57
35	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	6.85	0.00	0.00	1.66	1.91	1.37	0.00	0.00	5.18	0.00	0.00	0.00	2.05	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00
36	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.42	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
37	E7_Aa	NovelBoundary	0	19.82	27.73	12.86	20.71	6.34	16.88	12.36	6.97	63.65	27.20	16.07	47.23	47.00	18.43	17.74	10.56	45.00	0.00	0.00	3.64	12.88	4.62	22.80	33.86	28.49	8.50	2.53	49.60	8.15
38	ER7a	ExonRegion	0	0.68	0.00	0.53	13.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	2.56	1.03	0.86	0.00	0.79	2.85	1.84	2.97	0.63	1.36	5.94	3.23	1.37	0.91	0.02	0.05	6.21	3.05
39	E7_Da	NovelBoundary	0	2.65	4.56	0.00	0.00	0.00	5.10	2.57	0.00	2.83	3.67	4.37	4.22	1.50	3.94	16.14	9.87	1.06	4.62	0.00	0.00	1.89	0.00	2.31	2.33	6.86	1.76	2.34	26.96	1.35
40	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	18.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82
41	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	2.15	1.36	0.00	0.20	1.57	1.83	0.09	0.89
42	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.31	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	2.51	0.00	0.00	1.89	2.09	0.00	0.00
44	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	3.85	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	2.93	0.00	0.15	0.46	0.00	0.69	4.43	0.21	0.00	0.00
45	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.64	0.83	0.00	0.02	0.00	0.00	0.78	0.00	0.46	0.00	0.00	0.40	0.68
47	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.96	0.00	0.00	2.29	1.32
48	ER11a	ExonRegion	0	0.55	0.81	0.09	3.71	0.76	0.57	0.68	0.43	0.70	1.16	0.25	0.27	0.07	0.52	4.33	1.16	0.35	2.86	3.06	0.48	0.96	0.61	0.56	1.11	1.23	1.10	0.28	1.62	0.31