Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-379B18.4	Gene	0	0.70	0.00	1.88	2.02	0.23	0.45	0.38	1.12	1.03	0.68	0.06	0.17	0.00	0.66	1.77	0.82	2.03	1.09	1.35	0.35	1.47	0.51	0.34	1.31	0.47	0.44	0.52	1.45	1.39
2	487446	Transcript	0	0.31	0.00	0.68	0.50	0.06	0.49	0.35	0.57	0.57	0.42	0.01	0.08	0.00	0.69	1.24	0.91	1.72	0.52	1.30	0.33	0.87	0.42	0.20	1.14	0.60	0.50	0.13	0.63	0.75
3	ER1a	ExonRegion	0	1.32	0.00	1.54	0.00	0.00	1.27	1.24	2.26	1.04	0.89	0.00	0.00	0.00	0.97	5.74	0.76	1.38	2.37	7.85	2.30	4.38	2.77	1.11	3.30	1.32	0.48	0.00	2.50	2.89
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.67	2.09	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	4.09	3.04
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	1.43	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00
7	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.23	0.00	3.20	0.00	0.00	0.09	3.24	0.88	0.66	0.44	1.14	1.40	0.00	1.18	2.56	0.00	4.07	1.48	15.05	9.59	3.41	0.00	0.00	25.44	1.21	0.00	12.82	5.10	2.16
8	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.98	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.69	0.42	2.46	1.53	0.84	0.68	0.00	0.79	0.50	0.56	1.12	1.32	4.36	0.93	0.39	0.41	0.00	0.72	0.98	0.00	0.20	2.25	1.29
9	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.95	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	1.84	1.68	1.35	3.24	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.34	2.14	0.00	13.09	0.00	0.00	0.00	0.73	8.53	0.00	0.00	0.83	16.02	2.67
10	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.37	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.70	1.27	2.40	1.52	0.00	1.38	0.00	0.70	0.80	0.30	0.74	0.00	7.73	0.95	0.99	0.00	0.35	2.34	0.25	0.54	0.32	8.86	2.70
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.23	0.00	0.30	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.54
12	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.60	0.00	3.26	2.02	0.00	0.39	0.57	1.04	2.45	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.70	0.42	0.00	0.00	0.78	0.73	0.85	0.00	0.00	1.21	0.32	0.00	1.66	1.08
13	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	1.37	0.00	0.17	0.22	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.24	0.63	0.00	0.00	0.59	1.35
14	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.97	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	2.09	0.51	0.00	0.42	0.63	0.83	5.05	3.42	0.44	0.00	0.00	0.00	0.35	0.71	0.00	0.70	0.57	0.00	0.00	1.91	0.71
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	2.05
16	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.36	1.75	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.96	0.00	1.05	0.00	0.44	1.24	1.09	0.17	4.87	2.21	0.21	3.03	0.70	0.77	2.96	0.89	1.83	1.56	0.86	0.67	1.75	0.00	0.00	1.74	0.81	0.42	0.00	1.61	1.02
19	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	4.31	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.18	0.00	8.89	0.00	0.00	5.49	0.00	2.54	1.46	3.64	0.00	0.00	3.47	1.37	9.57	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	5.58	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	1.71	6.70
21	ER3a	ExonRegion	0	0.88	0.00	2.74	3.53	0.40	0.35	0.00	1.21	0.97	0.59	0.10	0.20	0.00	0.56	1.21	0.95	2.56	1.26	0.00	0.00	1.29	0.15	0.30	1.09	0.29	0.41	0.90	1.87	1.37
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.75	0.00	0.00	3.84	0.00	0.00	0.00	7.35	0.00	1.27	5.16	2.86	8.77	0.00	10.11	0.00	0.00	3.47	5.78	2.09	2.31	8.61	0.00	0.00	0.00	2.29	7.40
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	3.67	5.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	1.93	1.80	0.00	0.00	0.00
24	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.91	2.53	2.55	0.00	2.30	2.19	0.00	0.00	1.81	1.80	0.48	2.57	0.80	0.85	0.00	0.92	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53
25	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.54	4.89	0.75	0.00	3.19	4.12	0.00	0.00	1.90	3.15	0.88	1.90	0.60	0.00	0.00	1.95	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.07	0.00
27	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.36	1.21	0.55	2.02	0.87	0.00	0.37	0.00	0.94	0.00	1.00	2.28	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	1.18	0.65	0.84	0.00	0.00	1.00