Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-723O4.1	Gene	0	4.20	3.34	9.55	0.50	12.15	2.41	2.54	4.00	6.15	4.35	1.71	3.43	0.20	3.44	6.32	3.74	6.33	1.70	2.13	2.69	2.05	1.26	0.25	1.05	8.16	2.86	0.90	4.51	1.22
2	498297	Transcript	0	4.79	5.88	6.96	0.55	15.23	2.45	2.52	3.11	6.02	4.25	3.71	3.73	0.09	3.41	7.22	3.31	6.68	1.62	2.02	3.41	0.56	0.64	0.21	1.11	7.49	2.71	3.43	3.61	1.14
3	480931	Transcript	0	1.77	0.00	0.49	0.00	0.44	0.28	0.00	0.00	0.81	1.99	1.02	0.85	0.70	1.10	0.00	3.18	0.48	0.24	0.00	0.64	0.66	0.59	0.40	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	1.31
4	448668	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	IG33	Intergenic	0	2.55	2.39	3.07	1.93	4.80	1.79	2.11	1.63	2.72	3.93	1.13	2.06	0.42	2.72	2.74	2.63	3.26	1.19	3.90	2.28	0.70	0.51	0.20	0.89	3.87	0.90	0.70	2.71	0.51
6	IG33_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.13	0.00	0.23	3.40	6.01	1.40	4.43	1.89	1.27	2.54	0.63	0.22	0.00	0.64	2.30	3.37	2.19	0.68	3.87	4.85	0.81	0.00	0.32	0.31	1.68	0.74	0.00	1.80	0.00
7	IG33_SR4	SilentIntergenicRegion	0	3.12	0.85	2.05	1.90	0.65	0.18	0.53	0.53	1.27	1.91	0.00	0.33	0.00	0.42	1.34	0.57	1.91	0.51	2.16	3.91	0.34	0.24	0.00	0.34	2.27	0.21	0.24	1.67	0.00
8	IG33_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	3.12	4.93	2.29	0.00	5.11	2.55	0.59	0.27	1.09	3.75	0.14	1.35	0.00	3.03	2.14	2.72	2.97	1.12	4.29	0.80	0.00	0.53	0.00	0.63	6.37	0.00	1.07	0.76	0.49
9	IG33_SR3	SilentIntergenicRegion	0	2.07	1.68	2.04	1.66	4.31	2.03	1.48	1.49	1.96	2.80	0.75	1.83	0.20	2.88	1.28	1.81	3.02	1.04	4.42	1.92	0.55	0.35	0.07	0.08	2.67	1.40	0.07	3.39	0.10
10	IG33_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	IG33_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	5.28	6.37	9.51	4.08	10.65	3.13	5.73	4.19	8.65	10.68	4.51	6.31	2.03	5.79	9.58	7.33	7.22	3.10	6.06	2.47	2.16	1.71	0.86	4.08	9.76	1.34	2.78	5.25	2.47
12	ER1a	ExonRegion	0	7.83	7.57	9.40	3.32	8.54	3.76	1.90	2.20	8.07	7.68	1.43	2.73	0.00	4.02	8.30	2.01	3.50	4.02	6.67	4.11	1.32	1.27	1.26	2.99	11.77	0.73	0.42	3.77	1.55
13	E1_Da	NovelBoundary	0	2.89	13.28	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	5.91	0.00	9.40	0.00	2.10	0.00	0.00	1.04	4.62	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	1.82	1.89	0.00	1.84	0.00
14	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.01	4.85	6.90	0.00	11.79	3.91	0.00	1.94	2.62	0.00	7.69	1.54	0.00	3.32	0.00	3.82	3.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.34	0.00	2.24	0.00	0.00
15	I1	Intron	0	2.05	0.91	2.86	1.44	3.93	1.73	1.32	0.83	2.28	3.26	1.55	3.65	0.65	1.96	1.80	1.12	2.10	1.74	2.57	0.61	1.22	0.54	0.64	3.57	3.09	0.47	1.10	2.05	1.55
16	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.67	0.72	3.64	0.74	6.08	2.42	1.46	0.76	2.62	5.09	1.23	4.34	0.87	2.58	2.09	1.80	2.17	1.60	2.98	0.98	2.37	0.56	1.31	4.68	4.00	0.65	0.57	3.21	2.01
17	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.79	1.32	2.51	2.56	2.33	1.31	1.44	1.10	2.38	1.77	2.27	3.53	0.41	1.51	1.86	0.59	2.47	2.07	2.28	0.33	0.17	0.64	0.00	2.95	2.73	0.37	1.67	1.17	1.36
18	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	2.36	0.00	0.00	2.48	1.73	0.00	0.00	0.41	1.98	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	0.00	5.49	0.00	0.00
19	ER2a	ExonRegion	0	3.98	4.44	8.19	0.00	9.02	4.45	2.21	2.38	6.33	5.14	4.00	3.57	0.52	3.49	7.84	3.82	7.70	2.07	2.57	2.31	0.77	2.40	0.00	1.73	7.89	5.71	0.46	3.95	0.36
20	E2_Da	NovelBoundary	0	2.71	0.00	1.47	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	1.16	4.03	0.00	2.92	1.78	1.37	8.37	0.00	0.00	4.62	0.00	7.11	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	9.94	0.00	0.00
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	5.37	3.78	5.11	0.00	12.23	0.00	2.17	5.08	3.47	1.68	7.37	3.07	0.00	2.28	17.14	5.97	6.62	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	9.69	0.00	0.00
22	I2	Intron	0	2.05	0.00	1.60	0.00	0.00	0.66	0.00	0.44	1.34	1.38	1.71	0.89	0.46	0.98	0.00	1.78	2.14	0.92	0.00	1.79	0.34	1.29	0.43	0.00	2.05	0.00	1.32	0.00	0.00
23	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.21	0.00	1.72	0.00	0.00	0.68	0.00	0.46	1.42	1.49	1.84	0.96	0.50	1.05	0.00	1.92	2.29	0.99	0.00	1.85	0.37	1.39	0.47	0.00	2.21	0.00	1.42	0.00	0.00
24	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	3.41	1.52	1.42	3.31	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER3a	ExonRegion	0	4.31	3.20	7.85	0.00	14.28	2.58	6.01	4.51	6.18	5.90	1.77	5.28	0.00	5.14	10.01	4.21	8.70	3.62	2.88	6.67	1.29	0.16	0.00	1.94	8.37	5.42	5.66	7.24	3.36
26	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	1.30	3.07	0.00	2.75	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.00	1.58
27	E3a_E4c	KnownJunction	0	2.24	11.44	4.29	0.00	35.52	0.00	2.80	2.54	9.41	5.11	0.00	6.20	0.00	2.19	0.00	0.00	10.06	0.00	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	0.00	10.12	4.38	2.09	6.69	1.58
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	1.49	1.39	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER4a	ExonRegion	0	1.77	0.00	0.49	0.00	0.44	0.28	0.00	0.00	0.81	1.99	1.02	0.85	0.70	1.10	0.00	3.18	0.48	0.24	0.00	0.64	0.66	0.59	0.40	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	1.31
30	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	2.59	0.00	1.56	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E4_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4b	ExonRegion	0	3.22	6.57	8.98	0.00	17.44	1.37	2.02	0.92	3.93	4.33	2.38	4.95	1.30	3.17	0.00	2.53	3.51	2.73	2.26	1.41	1.43	0.90	1.81	0.00	5.00	3.14	0.92	2.45	0.67
33	ER4c	ExonRegion	0	4.84	2.04	10.47	0.00	20.78	0.45	1.47	6.37	7.25	5.04	1.79	7.67	0.12	3.04	4.71	3.87	8.81	0.93	1.96	4.47	1.10	2.12	0.15	0.67	10.28	6.73	1.08	5.75	1.84
34	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	3.07	0.00	2.46	0.00	0.00	1.04	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
35	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.81	0.00	0.00	0.00	4.98	4.48	7.16	0.00	1.61	6.36	0.00	3.26	0.00	0.00	6.28	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	3.56	5.88	0.00	11.28	0.00
36	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER5a	ExonRegion	0	3.54	1.74	11.99	0.00	16.52	1.72	3.06	6.05	6.52	3.17	0.72	3.41	0.00	3.42	6.63	4.48	8.07	1.04	0.86	1.86	3.80	1.22	0.00	0.43	8.84	2.05	0.71	5.84	1.09
38	E5_Da	KnownBoundary	0	2.77	0.00	20.23	0.00	0.00	0.00	4.63	0.00	3.01	5.55	0.00	3.55	0.00	0.97	7.97	7.19	3.71	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	3.05	10.42	2.10	4.12	4.49	0.00
39	ER5b	ExonRegion	0	3.18	4.23	13.11	0.00	11.76	3.31	3.37	4.50	6.40	2.81	2.08	1.88	0.28	3.92	6.35	4.17	6.13	0.84	0.70	1.21	2.91	0.79	0.00	0.24	7.80	1.50	0.17	4.37	0.29
40	IG32_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.48	2.89	9.15	1.28	16.35	3.33	9.45	3.96	10.89	5.34	1.59	6.93	1.41	3.66	8.12	4.20	11.95	1.72	1.25	3.01	2.36	0.27	0.13	0.88	10.10	1.06	0.54	6.77	0.59
41	IG32_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	4.84	7.04	11.26	1.88	33.08	3.55	7.78	3.36	14.24	8.25	0.00	7.79	0.70	5.51	4.37	5.60	12.32	0.84	4.82	3.14	1.63	0.79	1.46	2.27	17.39	1.25	1.07	3.34	1.27