Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC112484.1	Gene	0	2.95	0.89	1.27	14.95	1.39	0.91	1.62	1.05	3.04	2.33	0.93	2.79	0.43	1.39	0.55	1.28	3.57	7.50	1.21	0.55	0.95	0.38	1.50	2.24	1.29	1.01	0.26	1.85	2.43
2	344062	Transcript	0	2.09	0.56	0.87	12.98	1.21	0.88	1.15	0.50	1.85	1.66	0.75	1.61	0.42	0.80	0.40	0.81	2.46	7.92	0.79	0.26	0.72	0.25	1.71	1.27	0.91	0.81	0.15	1.19	1.90
3	ER1a	ExonRegion	0	0.37	0.00	0.00	13.77	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.49	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	5.63	0.00	0.00	0.00	0.21	0.92	0.49	0.08	0.09	0.34	0.00	1.48
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	27.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	14.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.26
5	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.40	11.74	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.48	0.73	0.00	0.00	0.00	0.59	10.82	0.00	0.00	0.00	0.00	2.16	1.13	0.37	0.41	1.32	0.00	2.11
6	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	18.49	0.00	0.00	0.00	0.00	4.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49
7	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.06	0.03	17.56	3.13	0.00	0.04	0.00	0.75	0.64	0.53	0.41	0.82	0.00	0.00	0.00	1.01	9.86	0.00	0.00	0.00	0.00	3.42	0.49	0.94	0.35	0.00	0.00	4.94
8	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	8.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	7.73
9	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.55	4.82	1.33	1.19	4.19	1.66	0.54	0.00	2.88	4.39	0.40	1.55	1.39	0.18	0.00	3.03	4.27	2.92	2.21	0.02	3.65	0.00	0.60	0.00	2.02	0.00	3.74	2.46	1.00
11	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	6.55	5.52	1.10	16.31	8.33	2.87	0.54	1.90	3.17	10.91	1.22	2.92	0.38	2.34	0.00	2.18	4.92	1.66	4.14	1.04	5.36	0.88	3.92	1.22	0.81	0.30	2.43	4.05	2.53
12	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	9.94	3.93	1.46	3.53	4.33	3.38	7.66	0.83	10.45	7.66	3.12	5.00	1.91	4.44	2.72	6.88	11.22	3.73	7.55	1.36	4.38	1.67	2.23	3.60	2.96	1.70	0.00	2.87	0.33
13	E4_Aa	NovelBoundary	0	5.78	22.88	3.79	0.00	0.00	5.76	0.00	0.00	8.68	7.31	1.27	2.77	4.84	4.01	0.00	9.94	6.55	4.62	0.00	0.00	2.05	2.19	2.51	3.05	1.63	3.78	0.00	1.75	0.00
14	ER4a	ExonRegion	0	7.08	2.32	2.06	31.79	4.81	4.05	5.41	0.96	5.18	7.47	3.15	4.28	0.48	1.79	3.41	1.66	6.60	9.60	3.15	0.68	3.16	0.00	3.38	3.21	2.86	1.55	0.00	4.46	1.47
15	E4_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	5.60	7.29	2.40	5.08	1.49	10.47	1.23	2.89	0.00	2.15	7.77	3.52	11.23	9.25	8.09	0.00	1.85	2.29	8.96	0.00	0.00	10.73	0.00	4.54	1.75
16	E4a_E5a	KnownJunction	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I4	Intron	0	4.05	0.00	0.00	9.03	9.23	0.87	1.27	0.00	3.18	1.82	0.00	0.78	0.00	0.57	0.00	0.00	1.88	12.13	2.01	0.00	2.69	1.14	2.28	1.35	0.90	0.00	0.00	1.03	0.00
18	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.15	0.00	0.00	9.26	9.27	0.89	1.30	0.00	3.24	1.86	0.00	0.80	0.00	0.59	0.00	0.00	1.91	12.44	2.06	0.00	2.76	1.16	2.33	1.39	0.92	0.00	0.00	1.05	0.00
19	E5_Aa	NovelBoundary	0	10.56	0.00	1.37	29.12	0.00	1.76	0.00	4.78	6.12	5.63	1.46	5.84	0.00	0.00	0.00	0.00	14.92	4.62	0.00	0.00	3.93	0.00	4.38	0.00	12.43	2.19	2.04	5.39	2.05
20	ER5a	ExonRegion	0	4.59	1.05	2.17	5.59	1.59	4.93	3.27	0.53	4.64	4.69	0.87	3.37	0.00	2.21	0.00	3.22	7.27	11.87	2.08	0.00	2.78	1.76	1.42	2.04	2.76	4.59	0.00	3.11	1.12
21	E5_Da	NovelBoundary	0	16.34	4.46	5.18	10.78	0.00	3.72	6.75	1.89	2.86	3.71	3.07	5.12	0.00	3.83	0.00	0.00	12.63	4.62	16.18	2.98	1.89	7.05	4.38	2.57	0.00	0.00	0.00	6.11	3.66
22	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	21.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I5	Intron	0	6.81	4.17	2.40	10.69	3.58	2.82	4.42	2.43	3.90	5.85	2.18	3.30	0.96	2.72	2.25	4.47	7.26	6.78	6.11	1.32	2.29	1.22	1.93	1.75	1.81	1.55	0.77	3.03	1.81
24	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.64	3.69	2.09	12.46	2.84	2.86	4.75	2.76	3.70	5.36	2.19	2.92	0.83	2.66	1.82	4.44	7.47	6.86	6.49	1.22	2.32	1.28	1.72	1.98	1.75	1.61	0.94	3.26	1.99
25	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	7.67	6.47	3.88	2.33	7.11	2.65	2.88	0.90	4.84	8.22	2.12	5.10	1.59	3.04	4.32	4.62	6.35	6.46	4.35	1.79	2.15	0.91	2.96	0.70	2.09	1.28	0.00	1.94	0.93
26	Ix	Intron	0	3.85	1.93	1.30	0.86	0.29	0.74	1.33	1.32	2.15	1.99	0.28	3.32	0.66	1.84	4.13	1.89	3.22	5.50	1.53	1.65	2.13	0.22	0.54	1.16	1.28	0.94	0.22	1.17	1.32
27	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.86	1.93	1.30	0.86	0.29	0.74	1.33	1.33	2.15	1.99	0.29	3.33	0.66	1.85	4.14	1.89	3.22	5.51	1.53	1.65	2.14	0.22	0.54	1.16	1.29	0.94	0.22	1.17	1.32
28	Ix	Intron	0	1.95	0.58	2.43	2.60	0.89	0.75	2.56	1.00	3.05	1.31	2.59	4.82	0.24	0.74	1.83	0.90	3.52	5.01	0.00	1.86	1.55	0.98	0.00	1.17	0.52	1.14	0.00	2.37	1.21
29	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.96	0.59	2.45	2.62	0.89	0.75	2.57	1.01	3.07	1.32	2.61	4.85	0.24	0.74	1.85	0.91	3.55	5.05	0.00	1.87	1.56	0.99	0.00	1.18	0.52	1.15	0.00	2.38	1.22
30	E6_Aa	NovelBoundary	0	8.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	4.25	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	9.89	0.00	0.00	3.29	4.96	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55
31	ER6a	ExonRegion	0	8.18	2.71	4.01	12.97	1.06	0.75	3.95	3.81	9.78	4.25	2.33	9.00	1.06	4.84	1.01	4.06	10.09	6.16	3.48	2.23	2.02	0.79	0.59	6.56	2.96	1.88	0.00	5.51	4.01