Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC098820.1	Gene	0	3.89	0.97	2.26	5.60	4.34	2.93	4.94	2.42	2.35	2.16	1.02	2.15	1.10	6.23	4.17	9.20	6.15	1.75	3.29	0.56	2.08	4.16	2.63	1.68	3.10	3.02	5.40	6.84	3.66
2	453157	Transcript	0	2.05	0.48	1.24	2.12	0.72	1.37	1.96	2.04	1.89	1.60	0.97	0.91	0.29	2.21	1.49	1.23	2.43	1.14	0.00	0.15	0.74	0.82	0.39	0.16	0.95	0.70	0.68	1.33	0.88
3	431856	Transcript	0	1.20	0.38	0.54	2.31	3.98	2.96	2.00	0.60	2.49	1.65	0.59	0.48	0.35	6.36	3.29	7.28	5.81	0.99	3.64	0.45	2.68	1.24	1.35	2.10	3.73	1.17	6.76	5.56	3.67
4	438978	Transcript	0	1.79	0.60	1.33	8.22	1.63	1.15	3.03	0.92	0.73	0.78	0.05	1.28	0.79	2.82	2.04	4.97	2.55	0.56	1.34	0.35	0.89	1.66	1.44	0.90	1.14	2.23	3.06	4.02	1.32
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.37	0.00	0.00	0.46	1.85	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56
6	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.37	2.02	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	1.34
7	ER1c	ExonRegion	0	5.21	0.00	4.84	14.63	16.09	3.11	5.64	2.03	3.50	0.00	2.18	2.94	1.64	6.08	5.24	13.62	6.70	2.24	4.69	0.00	2.62	12.54	5.97	0.94	2.43	2.88	7.39	9.38	8.55
8	E1_Da	NovelBoundary	0	2.54	7.85	2.42	0.00	0.00	13.28	2.75	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	1.50	6.82	9.97	0.00	0.00	9.25	0.00	6.95	8.94	6.13	0.00	3.05	1.63	0.00	12.18	0.00	0.00
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.54	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	4.78	0.00	0.00	0.00	0.00	4.41	0.00	2.83	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	11.57	0.00	2.45	1.93	0.00	0.00	2.02	1.55
10	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	1.49	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	6.90	1.66	0.00	2.88	1.96	4.68	8.08	3.70	2.82	4.06	1.88	2.56	0.71	10.79	5.56	16.74	10.17	3.22	10.26	1.11	1.40	10.63	4.00	3.29	7.09	2.78	3.19	7.43	6.45
13	E2_Da	KnownBoundary	1	4.95	4.36	0.00	0.00	0.00	5.33	0.00	0.00	1.49	0.00	4.46	1.42	1.56	7.22	0.00	6.20	12.29	0.00	0.00	0.00	3.61	7.54	2.36	0.00	3.37	3.99	35.09	14.83	11.95
14	E2a_E3a	NovelJunction	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.26	2.39	0.00	1.52	1.30	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.23	8.90	3.53
15	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2b	ExonRegion	0	1.20	0.38	0.54	2.31	3.98	2.96	2.00	0.60	2.49	1.65	0.59	0.48	0.35	6.36	3.29	7.28	5.81	0.99	3.64	0.45	2.68	1.24	1.35	2.10	3.73	1.17	6.76	5.56	3.67
17	E2_Db	NovelBoundary	0	2.65	3.68	0.00	0.00	6.78	5.18	5.66	0.00	4.17	5.55	0.00	0.00	0.00	9.44	0.00	10.40	9.79	4.62	0.00	0.00	5.74	0.00	9.85	5.20	0.00	1.97	14.21	6.02	3.47
18	I2	Intron	0	2.29	0.98	0.51	2.19	1.49	3.36	0.00	0.00	0.69	1.54	0.73	1.03	1.19	5.53	2.95	4.17	3.65	1.52	1.95	0.72	3.05	2.20	2.76	1.31	1.97	0.72	5.02	4.98	0.72
19	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.30	0.99	0.51	2.20	1.50	3.37	0.00	0.00	0.69	1.55	0.73	1.04	1.19	5.55	2.96	4.18	3.66	1.52	1.96	0.73	3.06	2.21	2.76	1.32	1.97	0.72	5.03	4.99	0.72
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.13	4.65	2.49	0.00	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	3.22	0.00	5.56	0.00	2.75	3.96	4.62	0.00	0.00	4.09	2.24	6.06	0.00	1.52	0.00	0.00	8.49	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	3.58	1.20	2.66	5.66	3.27	2.30	6.07	1.85	1.45	1.57	0.10	2.57	1.58	5.64	4.09	9.93	5.11	1.13	2.67	0.69	1.79	3.32	2.87	1.80	2.27	4.47	6.13	8.04	2.63
22	E3_Da	NovelBoundary	0	5.31	0.00	1.10	0.00	5.45	1.57	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	5.52	9.97	7.27	5.96	0.00	8.09	4.13	0.00	0.00	2.12	2.81	0.00	3.26	2.44	1.75	3.14
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	1.01	0.00	2.25	0.00	4.23	0.84	0.55	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.61	1.58	4.75	0.00	0.46	0.76
24	Ix	Intron	0	3.00	4.22	1.48	3.70	1.32	3.17	2.38	1.18	3.68	3.26	1.75	2.01	0.68	3.08	4.76	7.66	6.56	1.77	2.98	1.35	3.71	0.31	0.36	3.54	3.69	1.08	1.08	3.00	1.82
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.60	10.91	1.22	3.26	0.00	2.00	0.00	1.59	3.56	4.51	2.95	5.35	1.32	7.38	5.43	6.20	10.26	1.32	2.61	1.30	3.12	0.00	0.00	4.08	4.56	0.86	1.67	7.42	3.93
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.57	3.41	1.51	3.75	1.48	3.32	2.67	1.13	3.69	3.11	1.61	1.61	0.61	2.56	4.69	7.85	6.12	1.82	3.03	1.36	3.79	0.35	0.40	3.48	3.58	1.11	1.01	2.47	1.57
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	5.43	0.00	4.46	17.26	0.00	0.00	10.41	4.58	1.55	1.96	0.00	4.79	3.15	5.74	0.00	3.44	11.73	0.00	0.00	0.00	5.82	0.00	0.00	0.00	1.52	4.25	0.00	0.00	1.88
28	ER4a	ExonRegion	0	6.14	1.43	3.34	6.36	2.17	3.66	4.02	6.12	3.61	4.80	2.90	2.73	0.86	5.50	4.48	3.70	7.28	3.42	0.00	0.44	2.21	2.00	1.17	0.48	2.85	2.09	2.03	3.98	2.07