Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	DIRC3	Gene	0	3.49	0.99	0.09	0.94	0.11	0.60	0.40	0.24	0.94	1.64	0.25	0.48	0.35	0.47	1.12	1.30	2.19	0.74	0.35	0.37	1.17	0.89	0.73	3.01	0.70	0.69	0.02	0.55	1.48
2	486365	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.15	0.50	0.16	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.14	0.07	0.12	0.00	0.05	0.13	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.00	0.20
3	423123	Transcript	0	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.43	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00
4	474063	Transcript	0	2.32	0.96	0.17	0.82	0.15	0.67	0.70	0.04	1.02	1.98	0.07	0.53	0.58	0.98	1.58	0.56	2.83	0.51	0.06	0.07	0.86	0.61	1.43	7.03	0.43	1.16	0.00	1.45	2.19
5	484635	Transcript	0	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.00	0.03	0.89	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.26	0.00	0.00	0.84	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	2.32	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	2.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I5_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	I5_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	2.28	0.00
22	I5_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	3.26	0.00
23	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.44	0.57	0.49	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.14	0.41	0.22	0.36	0.00	0.16	0.39	0.00	0.00	0.16	0.18	0.00	0.00	0.61
24	E6_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER6b	ExonRegion	0	1.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.02
26	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER7a	ExonRegion	0	10.80	0.00	0.25	0.00	0.00	0.39	0.00	1.15	2.09	1.35	0.34	0.00	0.00	0.26	2.64	3.70	6.21	3.31	0.00	2.02	2.58	3.26	0.00	0.65	1.37	0.45	0.00	1.58	1.68
28	E7a_E8b	KnownJunction	0	2.77	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	5.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	7.90	0.00	0.00	3.23	5.29	2.29	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	2.29	1.68
29	ER8a	ExonRegion	0	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.00	0.03	0.89	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01
30	E8_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER8b	ExonRegion	0	6.72	1.62	0.23	0.00	0.00	1.15	0.00	1.40	1.76	2.95	0.36	0.00	0.00	0.29	2.80	5.05	5.86	1.17	0.97	2.61	4.65	1.46	0.55	1.61	2.88	2.00	0.56	0.54	0.37
32	E8_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
33	E8a_E9a	KnownJunction	0	5.84	4.65	0.00	0.00	0.00	7.17	0.00	2.29	1.46	1.88	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	3.64	3.93	0.00	0.00	2.99	3.37	3.69	0.00	2.29	0.00
34	ER8c	ExonRegion	0	0.57	0.00	0.00	1.91	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.24	0.62	0.00	0.73	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22
35	E8b_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER9a	ExonRegion	0	7.25	2.42	0.00	3.69	0.00	2.29	1.24	1.23	0.47	2.04	0.61	0.20	1.00	0.35	1.19	3.07	3.59	2.23	1.65	1.05	3.73	1.86	0.93	1.30	4.59	1.46	0.00	2.91	1.74
37	E9a_E10a	KnownJunction	0	23.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	1.67	5.39	0.00	1.42	0.00	0.95	0.00	6.12	4.97	4.62	0.00	0.00	5.05	0.00	0.00	2.69	1.63	0.00	0.00	0.00	4.72
38	ER10a	ExonRegion	0	7.18	1.74	0.00	0.00	0.00	1.23	1.00	0.00	0.70	6.38	0.00	0.52	0.63	2.46	1.35	2.20	3.36	0.89	0.00	0.00	2.06	0.93	0.00	0.44	1.26	1.70	0.00	0.00	1.21
39	E10a_E11a	KnownJunction	0	5.96	0.00	0.00	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	1.85	0.89	8.37	3.82	1.26	0.00	0.00	0.00	3.69	1.90	0.00	0.00	3.64	1.76	0.00	0.00	1.85
40	ER11a	ExonRegion	0	9.98	3.75	0.00	3.73	0.00	1.27	1.57	0.00	0.73	4.97	1.55	1.22	0.58	1.23	2.06	3.83	6.30	1.00	0.48	1.43	4.73	1.01	1.12	2.91	1.80	1.76	0.00	1.70	4.55
41	E11a_E12a	KnownJunction	0	11.62	4.85	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.48	0.00	1.20	0.00	1.13	0.00	7.11	5.90	0.00	8.09	0.00	3.45	0.00	2.46	8.55	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER12a	ExonRegion	0	6.43	3.28	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.86	0.00	1.81	3.88	7.01	4.55	0.00	4.53	0.00	2.85	0.00	1.81	6.45	1.43	1.57	0.00	0.00	2.68
43	ER12b	ExonRegion	0	10.68	0.99	0.41	4.50	1.17	0.93	0.00	0.00	0.00	3.55	1.46	3.25	0.32	1.31	4.90	2.43	2.30	0.00	0.83	0.68	2.46	0.44	1.05	2.63	0.85	1.81	0.00	1.20	3.41
44	E12_Db	NovelBoundary	0	13.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00
45	E12b_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	19.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	0.00	1.09	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER13a	ExonRegion	0	6.31	1.05	0.55	3.38	0.03	0.00	0.52	0.00	0.00	2.21	0.00	2.24	0.42	0.62	3.34	2.47	1.13	1.36	1.04	0.00	0.32	0.59	0.95	2.11	1.41	1.54	0.00	0.53	3.44
47	E13_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.78	0.00	0.00	1.88	0.00	1.14	0.00	0.84	0.00	3.82	1.13	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	2.51	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00	9.61
49	E14_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER14a	ExonRegion	0	3.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.64	0.03	0.00	1.95	1.94	1.33	0.00	0.39	2.87	4.66	4.37	1.70	1.30	0.00	1.32	0.74	0.82	1.76	1.04	0.00	0.00	0.05	4.60
51	E14a_E15a	KnownJunction	0	5.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	9.97	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.53
52	E15_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	17.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER15a	ExonRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	2.53	1.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	1.81	3.32	0.00	0.00	0.00	2.96	10.74
54	ER15b	ExonRegion	0	5.35	2.67	0.00	2.96	0.00	0.55	1.13	0.28	0.60	2.57	0.49	0.64	0.00	1.55	0.39	0.90	3.57	1.99	0.00	0.00	0.92	0.37	3.37	27.62	0.54	0.82	0.00	1.68	3.79
55	E15_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	27.63	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
56	E15b_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	3.05	3.75	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	4.10	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	3.05	1.44	5.11	0.00	6.83	6.40
57	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	15.76	0.39	0.00	0.00	0.22	0.00
58	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	15.80	0.39	0.00	0.00	0.22	0.00
59	E16_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	20.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
60	ER16a	ExonRegion	0	3.83	2.07	0.04	0.00	1.06	0.71	0.56	0.00	0.71	3.34	0.00	0.84	0.79	1.41	0.00	2.14	2.96	0.83	0.00	0.00	0.51	1.95	3.28	13.46	0.37	1.18	0.00	1.24	3.68
61	E16_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.16	1.70	2.02	0.00	2.29	0.00
62	E16a_E17a	KnownJunction	0	2.54	0.00	0.97	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	1.78	1.97	2.15	0.00	0.00	3.74	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	2.41	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
64	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71
67	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
68	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.23	0.05	0.00	0.00	0.22	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.12	0.00	3.65	0.00	0.00	0.00	0.17	0.18
69	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
70	ER17a	ExonRegion	0	3.98	1.94	0.19	0.87	0.00	1.30	0.61	0.00	2.77	2.15	0.00	0.47	1.26	0.44	1.67	0.90	3.30	0.23	0.39	0.50	1.40	1.96	0.94	2.02	0.69	1.04	0.00	0.39	1.21