Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 AC016757.2 Gene 0 2.60 4.13 0.67 0.25 5.31 0.65 0.71 0.13 1.38 0.79 0.04 0.42 0.18 0.63 1.58 4.20 4.72 2.31 1.18 1.37 0.53 3.23 1.02 5.78 0.43 0.97 0.45 0.20 1.51 2 466075 Transcript 0 2.30 2.46 0.82 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.33 0.53 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 2.22 3.29 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.39 0.00 0.00 0.00 1.47 3 334973 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 470346 Transcript 0 0.84 2.14 0.28 0.00 1.95 0.57 0.46 0.07 1.46 0.36 0.00 0.20 0.00 0.33 1.13 4.35 3.57 1.72 0.22 0.38 0.30 1.26 0.41 3.97 0.33 1.40 0.13 0.11 0.69 5 475669 Transcript 0 0.00 0.26 0.26 0.00 4.42 0.11 0.00 0.00 0.40 0.34 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.20 0.24 0.15 0.25 0.53 0.00 0.71 0.57 0.68 0.11 2.68 0.00 0.00 0.26 6 409942 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 409070 Transcript 0 4.04 0.05 0.00 0.00 5.06 0.00 0.35 0.00 0.22 0.01 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.44 2.51 0.00 0.00 0.33 0.27 4.62 0.34 0.53 0.27 3.51 0.00 0.00 0.15 8 409376 Transcript 0 0.74 0.08 0.31 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.32 0.40 0.09 0.16 0.19 0.26 0.00 0.64 0.38 0.42 0.23 0.23 0.05 0.26 0.20 1.42 0.00 0.00 0.62 0.00 0.31 9 ER1a ExonRegion 0 4.25 2.38 0.74 3.83 24.98 0.00 0.00 1.08 0.59 1.40 0.00 0.97 0.68 0.00 0.00 1.95 3.73 2.23 2.51 4.76 2.24 0.25 1.42 3.38 0.95 3.94 2.14 0.00 2.58 10 E1_Ab KnownBoundary 0 5.19 0.00 1.54 10.35 12.97 0.00 2.86 2.24 1.49 0.00 0.00 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 6.42 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.47 0.00 3.57 11 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.54 0.00 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.09 4.05 0.00 4.52 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 1.55 12 ER1b ExonRegion 0 1.84 0.35 2.24 4.18 8.36 0.00 0.00 0.85 0.68 1.44 0.00 0.00 0.79 0.00 0.00 0.00 4.44 1.85 2.59 5.62 0.00 2.90 0.00 0.00 0.41 1.57 1.70 0.00 4.17 13 ER1c ExonRegion 0 2.00 0.00 0.99 0.00 2.24 0.00 0.00 0.34 0.00 0.51 0.00 0.87 0.00 0.23 0.65 0.76 0.23 0.00 1.51 1.08 0.57 4.75 1.02 0.39 0.00 0.34 0.00 0.00 2.98 14 E1_Ad KnownBoundary 0 5.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 1.60 0.00 1.23 0.00 1.00 0.00 3.21 0.00 0.00 0.00 0.00 3.97 7.24 2.41 4.79 0.00 0.00 0.00 0.00 3.43 15 ER1d ExonRegion 0 6.29 1.78 0.00 0.00 0.00 1.49 0.00 0.78 0.50 1.60 0.00 1.07 0.22 0.35 2.56 14.13 3.61 2.70 6.45 5.32 3.19 6.56 3.27 7.64 0.00 1.30 0.00 0.00 2.37 16 E1_Ae KnownBoundary 0 2.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 3.71 0.00 2.83 1.46 0.00 0.00 6.50 10.22 9.25 7.87 2.98 2.05 8.85 0.00 2.45 0.00 5.36 0.00 0.00 0.00 17 ER1e ExonRegion 0 5.45 4.31 0.59 0.00 11.92 0.00 1.69 0.00 1.01 1.70 0.00 0.61 1.41 0.00 0.09 5.48 10.23 3.13 0.74 8.48 0.49 6.56 0.56 2.08 0.00 2.76 3.96 0.00 3.65 18 E1_Af KnownBoundary 0 5.19 4.85 1.54 0.00 35.37 0.00 0.00 0.00 3.17 3.60 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 7.19 14.25 4.62 0.00 11.66 0.00 6.47 2.41 5.86 0.00 2.19 5.81 0.00 5.38 19 ER1f ExonRegion 0 10.84 3.56 2.93 0.00 43.04 0.00 1.34 0.00 2.68 2.73 0.00 0.00 0.72 0.91 5.60 11.95 11.49 3.94 0.00 11.24 0.00 9.16 1.61 11.53 1.15 0.83 1.42 0.00 4.66 20 E1_Da KnownBoundary 0 10.74 0.00 0.00 0.00 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 7.65 1.33 0.00 0.00 4.13 0.00 4.33 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 21 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 E1a_E3a KnownJunction 0 5.01 4.85 3.81 0.00 41.26 0.00 2.92 0.00 4.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8.77 7.34 9.09 0.00 0.00 7.69 0.00 6.90 0.00 18.84 1.93 0.00 1.89 0.00 3.99 23 ER1g ExonRegion 0 5.08 0.10 0.00 0.00 10.11 0.00 0.70 0.00 0.43 0.01 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.88 1.81 0.00 0.00 0.66 0.55 4.77 0.68 1.07 0.55 1.49 0.00 0.00 0.30 24 E1_Db NovelBoundary 0 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.89 0.00 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E1b_E3a KnownJunction 0 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.04 0.00 0.00 3.22 0.00 0.00 0.00 0.00 4.47 0.00 0.00 0.00 5.54 0.00 0.00 0.00 26 I1 Intron 0 1.71 1.93 0.33 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.87 0.00 0.00 0.00 0.27 0.92 2.48 2.24 0.83 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 2.58 0.14 0.16 0.00 0.00 0.00 27 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 1.78 2.29 0.34 0.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0.85 0.00 0.00 0.00 0.32 1.09 2.06 2.53 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 2.95 0.17 0.19 0.00 0.00 0.00 28 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER2a ExonRegion 0 0.62 0.34 0.48 0.00 0.13 0.00 0.00 0.00 1.29 0.00 0.34 0.62 0.75 1.05 0.00 2.57 1.51 1.67 0.92 0.00 0.21 1.04 0.78 2.68 0.00 0.00 0.19 0.00 1.26 30 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 0.00 0.00 1.23 0.00 0.91 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E2a_E3a KnownJunction 0 2.36 0.00 0.00 0.00 5.89 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.99 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 32 E3_Aa NovelBoundary 0 3.01 0.00 0.00 0.00 5.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER3a ExonRegion 0 8.69 10.63 2.75 3.18 27.90 0.79 0.56 0.00 2.16 0.64 0.00 0.00 0.32 0.68 0.63 10.54 4.87 3.44 4.37 4.11 0.00 13.84 2.42 14.80 1.07 2.36 0.94 1.45 1.54 34 E3_Da KnownBoundary 0 0.00 9.70 1.40 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 35 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.37 1.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 36 E3a_E4b KnownJunction 0 2.71 0.00 1.35 0.00 6.34 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 1.62 0.00 0.00 6.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 6.34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.38 0.00 0.00 0.00 38 ER3b ExonRegion 0 2.30 2.46 0.82 0.00 0.00 0.31 0.00 0.00 0.33 0.53 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 2.22 3.29 1.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.95 0.39 0.00 0.00 0.00 1.47 39 E3_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.33 0.00 0.00 0.00 1.58 40 I3 Intron 0 1.53 1.76 0.20 0.00 3.49 0.33 0.00 0.00 1.00 0.09 0.00 0.07 0.00 0.59 0.33 1.82 3.38 2.53 0.38 0.00 0.00 0.43 0.22 3.72 0.00 0.09 0.00 0.19 0.16 41 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 1.54 1.76 0.20 0.00 3.50 0.33 0.00 0.00 1.00 0.09 0.00 0.07 0.00 0.59 0.33 1.83 3.39 2.53 0.38 0.00 0.00 0.43 0.22 3.73 0.00 0.09 0.00 0.19 0.16 42 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 3.68 0.00 0.00 6.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.00 7.27 5.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 ER4a ExonRegion 0 1.67 4.28 0.55 0.00 3.91 1.13 0.92 0.14 1.61 0.73 0.00 0.41 0.00 0.66 2.26 5.32 5.79 3.44 0.45 0.76 0.59 2.52 0.83 7.93 0.65 1.04 0.25 0.22 1.38 44 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 8.73 1.10 0.00 7.37 0.00 0.00 2.34 0.00 0.00 0.00 3.55 0.00 1.37 0.00 3.14 7.27 4.62 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 8.19 0.00 1.89 0.00 0.00 1.68 45 ER4b ExonRegion 0 4.66 12.35 0.67 0.00 3.87 0.78 1.97 0.08 2.41 1.61 0.00 0.59 0.08 1.00 3.92 3.68 9.57 2.22 2.61 0.63 0.60 4.89 1.26 7.30 0.20 0.60 1.02 0.45 2.06 46 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 16.87 1.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 0.00 0.93 8.37 0.00 5.02 0.00 0.00 3.97 0.00 6.32 0.00 2.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 47 E4_Db NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 E4_Dd NovelBoundary 0 0.00 3.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 49 ER4c ExonRegion 0 0.00 9.85 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.77 5.17 0.00 3.62 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER4d ExonRegion 0 0.00 3.28 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER4e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 I4_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.00 1.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 53 E5_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 6.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.70 0.00 0.00 0.00 1.75 54 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.51 0.53 0.00 2.51 0.22 0.00 0.00 0.80 0.69 0.00 0.00 0.00 0.21 0.00 0.39 0.47 0.31 0.51 1.06 0.00 1.43 1.15 1.36 0.23 0.98 0.00 0.00 0.53