Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	FBXO36	Gene	0	6.98	3.21	1.25	2.41	7.69	5.91	5.86	1.47	3.49	4.59	3.38	3.99	4.10	4.48	5.00	3.90	5.76	1.99	5.86	2.63	6.26	2.45	4.06	7.50	5.93	3.31	2.63	1.89	5.56
2	373652	Transcript	0	2.27	0.00	0.79	0.00	0.33	0.81	1.84	0.58	0.72	0.45	0.13	0.17	0.94	0.32	3.20	0.89	0.85	0.70	2.81	0.71	1.30	0.59	0.99	1.09	0.55	0.81	0.61	0.55	0.55
3	465090	Transcript	0	2.25	0.73	0.28	0.59	0.60	1.14	0.33	0.53	0.88	0.59	0.44	0.82	0.61	0.45	2.48	0.50	1.05	0.58	0.92	0.55	0.73	0.11	0.33	0.80	0.46	0.78	0.26	1.61	0.71
4	283946	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	409992	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	1.73	0.00	3.14	0.00	1.31	1.48	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.66	2.63	0.34	0.00	1.85	1.20	1.12	0.00	0.00	1.15	0.00	1.46	0.58	0.94	2.53	2.46	2.19	0.72
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	2.17	1.89	0.00	0.00	1.20	0.00	2.99	0.93	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	1.56	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.60	0.91	0.00	5.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER1c	ExonRegion	0	4.93	0.33	0.00	2.93	3.99	2.89	7.06	2.95	0.00	0.00	0.95	0.00	3.64	1.09	0.00	5.06	1.50	2.18	0.00	0.00	1.28	0.00	1.63	0.00	1.57	0.31	0.00	0.00	0.00
12	ER1d	ExonRegion	0	13.67	4.75	5.80	35.21	29.79	16.35	29.77	6.10	3.88	5.94	6.39	6.16	13.41	4.57	14.57	19.12	13.35	1.22	12.65	4.20	10.08	7.14	14.33	6.85	9.10	8.07	3.63	1.61	6.23
13	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	9.71	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	1.96	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	1.96	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	3.10	5.13	1.06	0.00	0.00	0.92	4.62	0.00	0.00	2.05	0.00	4.38	3.05	0.00	10.94	0.00	0.00	1.22
16	E1_Db	NovelBoundary	0	2.83	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	1.60	1.50	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E1b_E3b	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER1e	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
19	Ix	Intron	0	4.30	2.15	3.67	13.01	2.33	1.05	1.93	1.58	1.66	3.45	0.11	1.76	0.68	3.28	2.37	4.13	1.71	0.55	2.75	1.58	5.99	1.38	1.55	0.62	1.23	1.65	2.80	1.71	3.45
20	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.91	1.96	3.80	15.50	2.48	0.71	1.75	1.17	0.92	3.33	0.00	1.39	0.54	2.78	2.57	4.72	1.02	0.39	2.84	2.10	4.98	1.55	1.40	0.00	0.91	1.87	2.10	1.66	3.22
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.55	2.78	3.34	5.58	1.90	2.12	2.49	2.87	3.96	3.87	0.46	2.93	1.11	4.88	1.80	2.40	3.84	1.04	2.49	0.00	9.18	0.87	2.06	2.51	2.21	1.01	4.99	1.90	4.21
22	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.50	1.29	2.34	4.30	1.95	1.53	0.81	2.21	1.40	2.46	0.24	1.43	1.17	2.71	0.00	0.57	3.01	1.22	1.92	0.55	2.88	0.00	0.36	2.15	0.86	0.94	2.36	0.00	1.09
23	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	1.11	0.08	1.37	0.00	0.00	0.37	0.00	0.60	3.08	0.00	1.64	1.08	1.79	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER2a	ExonRegion	0	7.35	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	4.67	2.32	2.89	0.63	0.52	0.00	1.14	0.94	12.79	1.72	0.97	1.69	11.24	2.86	2.37	2.38	0.23	3.78	1.26	0.69	0.00	0.00	1.48
26	E2_Da	NovelBoundary	0	15.40	48.67	9.87	0.00	26.82	48.57	68.31	9.46	81.64	32.80	23.47	21.17	48.79	28.18	17.14	34.27	10.80	0.00	0.00	10.92	36.22	27.71	23.44	21.71	22.62	22.23	27.38	20.08	10.86
27	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER3a	ExonRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	4.98	2.20	12.09	1.84	1.12	1.44	0.00	3.96	8.05	2.18	12.32	5.06	6.01	2.73	0.00	0.00	4.28	0.00	3.62	2.15	5.15	7.86	0.00	0.00	6.98
29	ER3b	ExonRegion	0	13.93	5.91	0.00	0.00	7.04	16.22	10.56	2.62	1.80	3.57	2.93	5.05	4.65	6.86	9.15	6.94	7.43	2.23	7.18	6.08	6.54	4.52	6.31	12.47	12.53	6.54	1.00	0.00	11.83
30	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	16.40	13.48	0.00	0.00	7.37	35.14	31.70	1.84	5.57	9.71	13.07	10.27	10.48	10.88	28.50	24.25	12.34	0.00	48.55	7.19	26.31	6.86	12.95	18.54	37.54	3.82	2.53	0.00	13.60
32	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER3c	ExonRegion	0	1.59	2.19	0.83	1.77	1.81	2.04	1.00	1.59	2.64	1.78	1.32	1.22	0.52	1.35	7.45	1.49	3.14	1.73	2.76	1.66	2.20	0.33	1.00	2.39	1.38	2.34	0.79	4.83	0.79
34	ER4a	ExonRegion	0	12.33	5.33	0.00	0.00	8.17	15.62	23.46	0.18	4.79	12.57	17.44	14.17	21.51	10.81	9.73	9.33	19.54	0.67	19.07	4.42	17.00	3.34	12.75	12.98	16.33	5.51	3.81	0.00	12.10
35	E4_Ab	KnownBoundary	0	20.53	4.46	0.00	0.00	7.22	15.69	22.26	0.00	4.45	11.06	9.40	15.24	15.44	11.34	0.00	7.50	20.64	4.62	0.00	7.69	11.15	4.57	13.20	14.18	7.20	12.75	5.07	0.00	15.91
36	ER4b	ExonRegion	0	18.60	3.28	1.39	0.00	17.79	13.78	15.30	0.00	2.12	7.46	3.47	6.46	8.27	12.40	1.55	2.80	10.10	3.14	8.32	4.49	5.02	2.59	7.51	11.85	11.96	3.72	2.00	1.31	11.54
37	E4a_E5a	KnownJunction	0	9.79	0.00	1.20	0.00	7.37	14.16	12.59	0.00	10.35	3.52	3.23	11.45	11.21	13.56	18.34	6.12	3.13	0.00	8.09	0.00	10.07	2.48	9.11	8.67	13.15	4.03	0.00	6.29	12.12
38	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER5a	ExonRegion	0	10.55	4.71	1.37	2.31	10.62	6.80	7.37	1.08	3.51	6.40	4.00	5.44	5.23	6.25	2.94	3.87	7.00	2.19	6.58	3.65	8.26	3.25	4.94	10.11	8.14	4.22	4.08	1.22	6.98
40	E5_Da	KnownBoundary	0	7.67	4.07	1.22	0.00	27.71	5.06	4.63	1.99	5.48	12.74	6.96	2.95	7.16	11.43	0.00	0.00	7.72	0.00	16.18	6.37	5.01	2.53	6.60	10.83	4.96	1.63	4.17	0.00	4.89
41	ER5b	ExonRegion	0	3.09	1.94	0.90	0.88	6.57	5.41	3.19	1.91	5.52	4.35	4.15	3.90	3.22	3.92	5.03	4.58	5.10	2.15	6.01	1.30	7.21	2.71	3.98	8.38	5.32	1.92	2.22	1.00	7.24