Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	CXCR7	Gene	0	42.41	38.40	25.76	12.95	7.83	22.01	46.35	35.60	20.04	51.62	27.74	19.07	14.80	81.08	85.04	78.59	28.12	328.38	30.23	42.21	77.71	38.64	311.35	351.32	74.58	53.96	39.01	15.98	299.20
2	447924	Transcript	0	1.89	0.00	4.30	0.00	0.00	0.00	2.60	0.79	0.76	0.00	0.00	2.20	0.61	3.94	0.00	6.11	0.00	4.78	1.48	0.00	0.00	0.80	11.97	0.00	1.33	0.73	0.00	1.49	1.60
3	272928	Transcript	0	23.39	19.44	16.89	7.33	6.10	10.97	22.64	17.59	11.40	27.49	11.91	8.18	6.37	38.57	38.52	47.67	13.78	175.74	13.86	20.95	47.14	17.07	168.47	151.13	36.52	27.26	21.94	7.86	157.59
4	IG21_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	4.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	1.06	16.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	IG21_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.17	1.17	11.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	IG21_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	0.18	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	2.04	19.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00
7	IG21_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
8	ER1a	ExonRegion	0	3.78	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00	5.20	1.57	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	2.54	0.00	5.80	0.00	4.17	2.96	0.00	0.00	1.61	7.79	0.00	0.99	1.46	0.00	1.01	0.49
9	E1_Da	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	6.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	2.92	1.21	5.34	0.00	6.43	0.00	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	16.15	0.00	1.67	0.00	0.00	1.98	2.71
11	I1	Intron	0	6.15	1.41	2.95	1.13	0.00	1.65	7.82	0.58	4.97	4.83	0.60	1.23	0.22	6.95	4.59	8.93	2.21	26.93	1.11	2.29	4.18	0.06	5.08	8.07	3.92	1.14	1.04	0.46	3.06
12	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.16	1.41	2.96	1.13	0.00	1.65	7.83	0.58	4.97	4.83	0.60	1.23	0.22	6.96	4.59	8.94	2.22	26.96	1.11	2.29	4.19	0.06	5.08	8.08	3.93	1.14	1.04	0.46	3.06
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	19.11	0.00	6.28	0.00	0.00	3.53	2.92	1.99	0.00	5.87	1.61	0.00	0.00	7.00	8.37	2.98	0.92	32.36	0.00	0.00	2.05	0.00	4.28	5.80	0.00	0.00	4.97	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	16.29	6.49	12.28	9.01	11.40	7.87	22.89	12.91	6.15	22.96	8.76	7.04	5.93	24.36	19.88	46.15	12.06	149.80	4.59	13.95	31.31	13.70	202.28	53.45	30.49	25.45	14.48	7.32	125.70
15	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2a_E3a	KnownJunction	0	13.15	4.07	11.66	0.00	0.00	1.76	2.80	6.92	6.97	8.83	1.17	3.16	0.00	18.83	0.00	16.52	5.47	73.98	0.00	7.53	24.27	4.33	37.63	26.98	13.30	11.29	5.86	4.13	79.17
17	I2	Intron	0	1.16	0.46	0.91	0.31	0.00	1.30	0.33	0.22	1.03	2.00	0.61	0.40	0.08	3.33	2.06	2.88	0.71	17.83	1.03	0.82	2.34	0.18	3.12	3.56	1.45	0.95	0.82	0.28	4.13
18	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.26	0.34	0.62	0.44	0.00	1.66	0.12	0.46	1.20	2.95	1.03	0.65	0.00	2.71	3.44	3.22	0.65	17.00	1.78	1.20	2.61	0.39	4.54	5.67	2.30	0.83	0.96	0.76	7.21
19	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.87	0.74	0.36	0.00	0.00	1.64	0.44	0.00	1.33	2.76	1.03	0.40	0.00	4.26	2.50	4.37	1.08	17.48	1.73	1.19	6.33	0.00	4.32	6.19	2.18	0.34	2.78	0.00	4.66
20	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.56	1.35	0.16	0.00	0.00	2.01	0.51	0.30	1.02	2.80	0.84	0.78	0.00	3.71	1.97	5.27	1.20	18.08	0.40	0.67	1.84	0.00	4.61	2.28	1.55	0.60	1.16	0.00	6.83
21	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.33	0.00	0.58	0.00	0.00	2.08	0.00	1.79	1.28	0.70	0.68	0.00	0.00	5.62	0.00	7.30	0.63	11.77	0.00	0.32	1.43	0.00	3.15	0.80	0.90	0.00	0.00	0.00	6.63
22	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	5.82	0.00	7.59	1.00	14.33	0.00	0.00	1.07	0.00	2.56	2.15	2.74	0.00	0.00	0.00	6.82
23	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.73	1.29	0.91	0.45	0.00	1.55	0.35	0.23	1.42	1.98	0.10	0.11	0.03	4.90	2.96	3.00	0.61	17.19	1.64	0.17	2.47	0.56	3.51	3.64	1.64	0.17	0.91	0.51	4.82
24	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.10	0.50	1.03	1.19	0.00	1.06	0.99	0.00	1.06	3.33	1.21	0.31	0.72	4.62	5.99	2.65	0.42	19.39	0.37	0.85	2.24	0.00	3.00	2.43	1.49	1.13	1.41	0.00	4.36
25	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	3.86	0.00	1.12	12.43	0.00	1.24	0.00	0.00	1.12	2.17	2.38	0.00	0.00	8.71	0.00	0.00	1.00	12.83	0.00	0.00	0.00	0.00	6.51	1.94	4.72	1.57	0.00	0.00	6.44
26	I2_AR7	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.80	7.31	0.00	1.37	0.00	0.00	1.12	0.00	2.38	0.00	0.00	8.81	0.00	1.81	0.00	5.85	0.00	0.00	1.43	0.00	5.42	2.15	1.43	1.57	0.00	0.00	7.29
27	I2_AR8	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	7.31	0.00	1.37	0.00	0.00	0.45	0.00	2.38	0.00	0.00	9.43	0.00	2.53	0.00	25.93	0.00	2.81	1.43	0.00	6.51	3.87	1.43	1.10	0.00	0.00	8.46
28	I2_AR9	ActiveIntronRegion	0	2.86	0.00	0.00	6.09	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	9.68	0.00	2.53	0.00	35.02	0.00	2.81	1.43	0.00	7.23	4.30	0.48	0.00	0.00	0.00	9.40
29	I2_AR10	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	3.51	0.00	0.00	0.00	1.44	2.38	0.00	0.00	8.37	0.00	2.53	0.00	38.21	0.00	2.81	1.43	0.00	7.23	4.30	0.00	0.00	0.00	0.00	6.41
30	I2_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	5.19	0.00	0.00	0.00	31.76	0.00	2.81	1.56	0.00	4.60	2.54	0.00	1.29	0.00	0.00	4.27
31	I2_AR12	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.37	0.00	0.00	1.44	1.08	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	0.00	16.13	0.00	1.28	1.43	0.00	3.62	1.76	0.00	1.57	0.00	0.00	3.05
32	I2_AR13	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	2.02	0.00	0.00	1.44	1.19	0.00	0.00	2.72	0.00	0.00	0.00	16.83	0.00	0.00	1.43	0.00	1.81	2.15	0.00	1.57	0.00	0.00	0.89
33	I2_AR14	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.31	0.00	3.09	2.02	0.00	0.00	0.54	1.19	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.13	16.03	0.00	0.00	1.43	0.00	1.81	2.15	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00
34	I2_AR15	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.31	0.00	2.06	2.02	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	2.60	2.72	0.00	0.00	1.00	16.38	0.45	0.00	2.28	0.00	0.90	2.15	0.00	1.57	0.00	0.00	3.22
35	I2_AR16	ActiveIntronRegion	0	0.71	0.00	0.87	7.31	0.00	2.75	2.02	0.00	1.12	0.00	1.19	0.00	2.60	3.93	0.00	0.00	1.00	17.28	4.53	0.00	2.38	0.00	1.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	5.37
36	I2_AR17	ActiveIntronRegion	0	0.76	0.38	1.84	0.84	0.00	1.26	0.47	0.00	1.54	1.55	0.53	0.22	0.01	3.92	0.27	2.22	1.04	23.50	1.45	0.16	3.14	0.09	2.72	0.82	1.50	0.81	0.00	0.77	3.22
37	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	0.78	0.00	0.38	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	2.03	3.06	0.25	0.18	0.11	1.19	0.00	1.79	1.04	15.99	0.32	1.99	2.17	0.00	2.22	4.36	1.14	0.38	0.00	0.00	0.44
38	I2_AR18	ActiveIntronRegion	0	1.14	0.00	0.97	0.00	0.00	1.39	0.36	0.00	0.20	1.71	1.02	0.28	0.09	2.74	1.98	3.10	1.59	18.61	0.56	2.19	2.19	0.00	3.27	1.89	0.37	0.78	0.00	0.00	0.86
39	I2_SR5	SilentIntronRegion	0	1.11	0.30	0.68	0.00	0.00	1.09	0.52	0.24	0.48	1.40	0.36	0.14	0.00	2.57	0.94	2.46	0.36	16.95	0.50	0.18	1.24	0.16	2.07	2.02	0.67	1.59	0.24	0.00	2.68
40	I2_AR19	ActiveIntronRegion	0	0.71	0.44	0.89	0.00	0.00	0.88	0.00	0.61	1.20	2.16	0.20	0.41	0.00	3.25	0.76	3.75	1.38	20.73	2.64	1.11	3.07	0.15	3.08	7.72	2.37	1.36	1.21	0.27	3.71
41	I2_SR6	SilentIntronRegion	0	1.33	0.75	1.61	0.00	0.00	1.12	0.12	0.11	1.04	1.95	0.35	0.76	0.00	4.44	3.49	3.09	0.46	16.66	0.19	1.79	2.42	0.10	2.06	4.60	1.67	0.73	2.35	0.00	4.17
42	I2_AR20	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	3.25	0.00	0.00	0.00	2.83	1.40	2.53	1.00	22.17	1.70	2.81	0.00	0.00	3.62	4.30	1.07	0.00	0.00	0.00	9.40
43	I2_AR21	ActiveIntronRegion	0	1.09	0.00	0.95	0.00	0.00	1.09	0.27	0.49	2.50	1.19	0.00	0.98	0.00	2.89	1.91	2.71	0.70	16.38	0.80	0.84	3.02	0.24	2.85	6.21	0.92	1.25	0.97	0.00	4.82
44	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.66	8.53	0.00	0.00	0.00	9.21	0.00	4.18	0.00	5.95	1.49	0.00	0.00	2.17	0.00	13.92	0.00	9.25	0.00	0.00	13.96	0.00	4.97	25.72	8.94	0.00	0.00	0.00	3.07
45	ER3a	ExonRegion	0	60.16	37.45	31.65	15.71	8.71	27.55	67.81	53.34	25.73	70.15	41.96	34.83	22.97	128.54	99.90	95.33	45.67	480.33	30.64	59.56	88.65	62.97	471.65	467.76	116.64	87.73	40.49	28.36	459.02
46	E3_Da	KnownBoundary	0	64.65	25.50	37.42	19.84	0.00	24.90	61.96	70.82	39.41	72.50	41.63	40.27	24.07	118.29	90.09	68.62	49.70	527.98	32.37	36.64	79.94	59.65	439.41	408.30	104.75	110.93	42.14	30.37	495.33
47	ER3b	ExonRegion	0	40.72	47.77	26.73	12.97	6.91	23.27	42.23	32.93	21.08	50.66	25.80	14.32	13.19	72.51	95.67	80.34	23.80	303.45	36.99	41.36	85.83	33.18	265.50	372.96	65.76	45.04	45.47	12.13	267.90