Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC096558.1	Gene	0	0.00	1.76	0.61	0.00	1.78	0.87	0.37	0.00	2.96	2.63	1.19	0.50	0.41	0.70	0.92	0.90	3.66	0.00	0.87	0.43	1.82	0.00	0.16	2.74	1.04	1.00	1.00	1.33	0.55
2	442794	Transcript	0	0.00	0.84	0.28	0.00	0.83	0.97	0.17	0.00	1.49	1.24	0.55	0.24	0.19	0.33	0.46	0.42	1.71	0.00	0.41	0.20	0.87	0.00	0.08	1.29	0.49	0.46	0.46	0.63	0.25
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	1.08	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	1.29	2.35	1.00	0.50	1.03	0.43	0.00	0.17	2.35	0.00	0.00	0.33	2.30	0.38	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00
6	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	1.24	1.30	0.00	0.00	2.19	1.91	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.61	4.16	0.26	0.76	0.22	1.14	1.20	0.70	4.02	2.57	1.89	1.24	2.16	1.36	2.82	1.70	4.06	2.15	2.14	1.80	3.65	0.22	0.20	3.49	0.81	0.69	0.84	0.62	0.93
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.74	1.51	0.45	2.33	0.00	0.22	0.65	1.79	2.91	1.87	1.16	0.20	3.57	1.13	3.00	0.81	3.25	1.88	1.56	1.34	0.70	0.00	0.47	3.44	2.03	1.02	0.00	0.53	0.32
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.77	17.91	1.08	16.20	1.02	7.93	14.66	0.30	7.91	12.15	4.05	1.09	3.54	1.38	22.07	10.24	2.17	2.36	1.03	8.56	5.76	2.91	2.76	39.09	5.04	0.25	5.03	0.53	1.94
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	4.85	1.05	0.00	0.00	2.99	2.46	0.00	8.31	5.67	1.33	3.07	7.48	2.30	16.74	0.00	16.39	4.62	0.00	4.13	10.07	0.00	0.00	5.62	1.59	4.16	0.00	6.65	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.00	2.85	1.48	0.00	1.44	1.62	1.19	0.00	7.41	5.50	2.81	1.09	1.34	1.59	2.88	1.46	9.68	0.00	1.88	1.40	1.66	0.00	0.52	8.82	2.11	3.24	3.24	1.44	1.77
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.78	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	9.71	12.98	1.61	5.63	10.13	1.99	48.04	0.00	17.80	0.00	8.09	0.00	15.80	0.00	0.00	8.97	3.56	0.00	22.71	0.00	1.62
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	0.59	1.87	0.41	0.24	0.78	1.24	1.23	0.32	7.48	3.32	1.49	1.55	1.56	0.86	3.36	1.72	5.54	0.21	0.51	1.67	2.32	0.18	0.33	2.86	0.66	0.58	1.18	1.17	0.82
15	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.76	7.85	1.49	1.27	0.87	0.99	1.83	0.65	15.32	6.80	2.11	3.00	2.65	1.20	11.01	2.18	11.33	1.43	1.70	4.76	3.11	0.32	0.33	7.78	1.22	1.68	2.29	1.74	3.45
16	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.61	7.25	0.00	0.00	0.00	0.99	1.33	2.76	8.87	2.74	6.25	4.44	1.95	0.68	10.21	3.31	10.39	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	2.66	5.88	3.45	4.71	1.32	2.45	3.97
17	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.80	1.43	1.77	0.00	1.17	4.35	1.82	0.82	23.15	8.45	1.99	2.95	6.11	2.05	12.69	3.53	15.09	0.00	0.76	3.30	1.97	0.97	1.60	13.53	2.87	1.13	4.38	1.73	1.60
18	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.70	1.68	0.39	0.47	1.27	1.95	2.63	0.30	13.97	3.08	2.38	1.90	2.13	1.06	4.48	1.06	6.26	0.38	0.62	2.31	1.97	0.32	0.09	3.81	0.77	0.28	0.77	1.17	1.15
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.89	0.17	0.75	1.53	0.00	1.12	0.25	4.24	1.44	1.91	1.49	1.39	0.39	2.89	2.12	4.59	0.00	0.00	2.02	2.24	0.00	0.00	2.02	0.40	0.24	1.15	0.69	0.00
20	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.65	0.00	0.00	0.00	1.13	1.33	0.00	4.31	2.82	0.73	0.54	1.59	0.00	5.42	7.43	1.58	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.90	0.00	2.01	1.70	0.00	7.20	0.00
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.44	1.36	0.19	0.00	0.39	0.70	0.42	0.21	2.03	2.76	0.78	1.02	0.59	0.67	0.76	1.57	3.52	0.09	0.41	0.84	2.50	0.03	0.27	0.65	0.21	0.49	0.88	0.98	0.38
22	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.43	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.37	2.10	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.87	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.01	0.00	0.42	0.00	0.00	1.43	0.00
23	E3_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.04	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	Ix	Intron	0	0.80	3.22	0.67	0.68	1.65	2.51	1.48	0.51	10.71	4.91	2.41	1.70	2.42	1.72	4.81	3.61	9.53	0.71	0.67	2.44	4.26	0.57	0.60	4.12	1.57	1.45	2.01	1.69	1.23
26	Ix_SR10	SilentIntronRegion	0	0.26	2.78	0.48	0.54	1.25	1.16	0.70	0.28	6.42	3.82	1.19	0.84	1.17	0.50	3.32	2.56	5.53	0.17	0.43	1.45	2.78	0.49	0.16	1.20	1.04	1.16	0.94	1.55	0.42
27	Ix_AR9	ActiveIntronRegion	0	2.67	5.50	0.46	0.99	4.05	5.20	3.52	0.29	28.61	7.80	1.79	4.34	3.82	2.33	8.76	2.95	15.34	0.00	1.77	2.05	8.05	0.25	1.00	4.16	2.76	3.26	3.54	6.74	2.61
28	Ix_SR9	SilentIntronRegion	0	1.26	4.89	0.43	0.91	2.47	5.43	3.23	0.94	21.84	6.96	2.90	2.67	4.21	1.90	5.23	5.82	11.91	0.49	1.08	4.41	6.42	0.38	0.69	6.07	2.92	0.93	1.78	2.21	1.63
29	Ix_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	13.14	2.24	0.00	0.00	5.50	5.18	1.84	24.56	4.54	13.94	2.47	5.94	0.00	5.60	7.59	11.73	0.00	1.29	6.83	4.28	0.00	0.00	10.76	6.33	0.00	0.00	0.00	2.68
30	Ix_SR8	SilentIntronRegion	0	0.00	13.14	2.24	0.00	2.49	4.12	6.05	1.84	22.47	5.78	14.68	2.68	7.14	0.91	7.47	7.59	16.03	0.00	9.05	10.77	4.28	0.00	0.00	14.34	7.15	0.00	0.00	0.00	1.34
31	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	1.30	6.25	2.33	2.72	5.86	9.41	4.71	1.89	32.08	13.02	8.04	4.86	10.86	3.75	13.91	9.28	20.64	1.64	2.18	6.06	8.01	2.19	1.54	17.04	4.97	2.65	6.17	3.67	3.47
32	Ix_SR7	SilentIntronRegion	0	1.31	7.07	1.17	1.58	4.14	5.86	1.77	1.97	29.63	7.23	4.26	3.09	6.73	3.06	17.20	6.54	29.96	1.62	2.20	5.90	7.80	1.52	0.69	14.89	3.26	4.34	2.85	2.81	3.69
33	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	4.45	5.78	3.06	0.87	7.75	7.39	8.85	2.92	48.15	14.09	7.41	6.62	11.13	6.18	25.71	16.92	37.53	2.12	1.95	10.66	8.01	4.40	3.53	32.02	7.85	8.25	10.06	7.16	11.16
34	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.52	6.47	1.21	1.15	0.64	5.54	1.94	0.44	17.78	7.87	6.23	3.39	3.12	3.09	4.29	11.74	12.86	0.31	1.28	3.98	6.38	0.58	1.02	4.51	1.49	0.88	0.88	2.78	1.43
35	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	0.90	3.93	0.28	1.20	2.60	4.25	4.34	0.31	16.40	9.64	4.36	2.73	2.75	1.51	6.72	7.43	10.54	0.85	0.54	1.06	7.52	1.25	0.30	4.09	1.54	0.93	2.09	0.78	0.80
36	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.69	5.10	1.02	0.00	2.96	4.13	1.83	0.37	14.91	7.43	4.21	3.04	1.97	2.07	3.81	5.52	11.39	0.46	0.28	2.39	5.28	1.05	0.99	3.90	1.63	1.63	2.11	0.70	0.64
37	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	2.14	4.60	3.25	0.00	0.00	4.12	2.02	1.84	7.86	8.37	16.66	2.47	4.55	1.63	5.60	0.00	7.31	0.00	0.00	2.81	2.85	0.00	2.17	6.45	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00
38	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.14	6.57	2.24	0.00	0.00	5.04	2.24	1.84	10.11	9.79	17.59	2.47	5.20	1.81	5.60	0.00	10.35	0.00	0.00	2.81	1.27	0.00	1.81	6.45	2.86	0.00	0.00	0.00	0.45
39	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.27	2.08	0.96	0.66	1.58	2.18	2.15	0.67	13.32	5.91	4.24	1.91	2.47	2.97	7.63	4.51	17.00	1.04	0.44	2.39	3.63	0.80	0.84	7.12	2.64	1.92	2.70	2.23	1.51
40	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.92	9.47	0.80	2.36	1.61	1.63	2.21	1.33	16.55	6.59	1.20	1.16	4.18	2.96	5.76	3.91	11.33	4.71	2.45	6.62	5.94	0.20	0.40	3.36	0.97	1.28	4.65	1.78	0.59
41	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.08	7.72	6.02	3.22	2.29	5.69	1.89	0.05	12.86	9.29	3.34	2.67	4.55	6.94	2.16	6.01	14.62	2.88	1.49	4.00	12.94	3.37	1.54	6.75	2.68	9.56	10.20	3.81	4.86
42	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.87	10.66	2.26	1.01	5.30	7.09	1.09	2.00	15.83	14.95	5.17	3.86	7.98	10.29	6.97	5.31	18.17	4.53	2.60	8.87	16.85	1.96	2.01	10.80	4.85	3.62	13.91	6.85	6.01
43	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.60	2.24	0.58	0.93	1.26	1.57	0.65	0.20	5.81	2.93	1.31	1.29	1.95	1.22	3.31	1.06	5.21	0.63	0.48	2.39	3.60	0.04	0.47	1.25	0.86	1.63	0.55	0.91	0.82
44	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.27	0.00	1.61	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER4a	ExonRegion	0	0.00	3.06	0.06	0.00	1.55	0.87	0.00	0.00	1.59	0.91	0.00	0.58	0.00	0.72	0.00	0.74	1.42	0.00	1.01	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	1.55	0.00