Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LYPD1	Gene	0	39.66	4.13	2.97	3.79	0.21	1.89	4.73	1.67	1.21	1.77	0.18	0.87	0.82	4.93	14.99	3.83	1.42	5.64	0.88	3.86	2.38	1.60	5.81	1.27	2.99	0.93	4.88	2.45	1.63
2	345008	Transcript	0	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.18	1.13	0.46	0.00	0.00	0.00	0.23	0.10	0.00
3	397463	Transcript	0	21.54	2.30	1.60	4.70	0.00	1.01	1.87	2.16	0.58	0.75	0.00	0.29	0.39	2.24	19.35	3.88	0.45	3.23	0.35	4.95	1.17	1.38	3.56	0.94	2.54	0.26	3.16	1.11	1.35
4	449209	Transcript	0	6.25	0.00	1.07	0.00	0.00	0.25	1.66	0.00	1.77	0.59	0.00	0.36	0.00	1.24	0.00	0.02	0.96	1.73	0.00	3.11	0.00	1.04	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00
5	409034	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.70	0.36	0.18	0.92	0.00	0.00	0.00	0.47	0.21	0.00
7	E1a_E3a	KnownJunction	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2_Ab	NovelBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	3.95	0.00	0.00	1.68
9	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00
10	ER2b	ExonRegion	0	22.91	1.38	4.98	0.00	1.93	0.75	2.21	0.00	0.62	0.09	0.00	1.69	3.56	2.38	0.00	6.67	2.38	11.15	0.00	7.31	0.78	0.00	5.95	0.00	0.78	0.86	1.95	0.40	0.00
11	E2_Ac	KnownBoundary	0	8.43	0.00	1.49	0.00	6.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
12	ER2c	ExonRegion	0	8.36	5.98	0.96	0.00	1.39	1.35	0.20	0.00	0.00	1.30	0.00	0.35	0.00	0.85	0.00	1.06	1.04	1.26	0.00	1.46	0.83	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00
13	E2_Da	KnownBoundary	0	9.02	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	1.37	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	4.13	2.05	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2a_E2d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2d	ExonRegion	0	55.41	2.76	0.83	0.00	0.00	2.12	6.78	0.00	0.92	1.59	0.00	0.43	1.24	5.04	0.00	4.42	1.00	12.68	1.52	0.63	5.37	1.11	6.12	0.84	2.19	1.50	2.31	0.87	0.40
16	E2_Ad	KnownBoundary	0	61.88	3.49	3.36	0.00	0.00	1.50	13.73	0.00	1.40	7.67	0.00	0.00	2.55	2.26	0.00	9.49	0.00	0.00	0.00	0.00	5.25	0.00	18.22	5.32	5.76	0.00	14.31	4.58	1.68
17	ER2e	ExonRegion	0	78.25	13.95	7.61	0.00	0.00	7.21	19.69	0.00	0.59	6.86	0.00	2.04	4.31	10.35	0.00	8.07	3.98	13.01	2.36	8.02	7.96	1.96	16.96	3.55	5.66	2.66	21.87	2.15	4.14
18	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.09	0.00	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2b_E3a	KnownJunction	0	83.46	16.09	12.43	0.00	0.00	9.86	22.14	0.00	1.28	5.75	0.00	1.17	0.00	14.20	0.00	3.82	9.25	4.62	0.00	7.94	13.00	4.33	6.50	0.00	6.86	5.54	30.02	1.93	8.12
20	ER2f	ExonRegion	0	5.61	0.00	2.24	0.00	0.00	0.12	0.42	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	1.00	1.77	0.00	2.15	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2c_E3a	KnownJunction	0	10.74	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER3a	ExonRegion	0	173.85	14.78	12.16	0.00	0.00	6.47	20.08	0.00	4.39	8.29	1.14	4.02	1.96	25.08	0.00	6.68	4.87	15.29	3.38	7.07	9.09	3.63	16.88	3.96	7.61	5.82	13.82	8.87	3.53
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	5.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.44	0.00	5.94	0.00	0.00	1.27	0.00	3.43	0.00	0.00	1.08	4.62	0.00	3.97	0.00	1.80	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3a_E5a	KnownJunction	0	189.11	22.20	3.01	0.00	0.00	12.12	30.04	0.00	4.08	16.42	6.45	6.72	1.43	26.32	0.00	17.37	5.65	10.02	16.18	11.16	13.68	1.80	14.82	4.67	8.75	4.12	25.89	21.12	7.13
25	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER4a	ExonRegion	0	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.80	0.00	1.15	0.00	0.00	0.16	0.00	1.54	0.00	0.00	0.69	0.54	0.00	2.19	0.00	2.26	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00
27	E4_Da	NovelBoundary	0	13.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.33	0.00	0.00	0.00	0.00
28	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	1.10	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	7.10	0.00	0.00
29	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00
30	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.34	0.00	0.00
31	I4_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.66	0.00	0.00
32	E5_Aa	NovelBoundary	0	5.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.74	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98	0.00
33	ER5a	ExonRegion	0	35.81	4.06	2.72	0.77	0.52	1.73	5.79	0.00	1.38	2.07	0.56	1.36	0.47	5.44	0.00	2.77	2.45	4.21	1.41	1.38	1.94	0.42	4.63	0.91	1.53	1.12	5.64	4.42	1.22
34	E5_Da	KnownBoundary	0	5.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	2.07	0.00
35	E5_Db	KnownBoundary	0	8.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER5c	ExonRegion	0	43.07	4.60	3.20	9.40	0.00	2.03	3.74	4.32	1.16	1.50	0.00	0.57	0.78	4.47	38.70	5.66	0.90	6.45	0.70	6.15	2.34	2.76	7.11	1.88	5.07	0.51	5.40	2.23	2.70