Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC012487.1	Gene	0	4.77	4.13	2.43	4.30	5.58	4.83	3.70	3.60	9.34	4.71	2.78	2.35	2.96	2.30	7.23	4.44	7.17	3.05	2.66	4.82	8.61	2.44	1.99	4.91	3.07	6.57	4.18	7.51	2.55
2	397737	Transcript	0	2.14	2.15	1.36	1.44	3.18	2.36	1.78	1.49	4.87	2.96	1.52	1.07	1.44	1.04	4.89	2.58	3.80	1.70	0.93	3.41	4.02	1.55	1.04	2.88	2.00	4.25	2.03	4.05	1.31
3	322353	Transcript	0	0.51	0.00	0.80	0.00	3.49	0.98	0.95	0.44	0.67	0.69	0.00	0.44	0.62	1.90	0.00	1.77	0.36	0.92	2.28	0.00	1.02	0.00	0.00	1.02	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00
4	440975	Transcript	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	5.64	8.01	2.24	5.91	2.00	1.55	3.04	0.00	4.56	0.00	7.27	2.77	0.00	0.00	7.69	5.94	9.87	4.33	0.00	1.44	14.46	3.98	1.93	1.52
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.19	0.91	2.70	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.11	0.00	4.22	1.25	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.23	0.20	0.00
6	E1_Ac	KnownBoundary	0	2.60	0.00	4.34	10.14	13.71	1.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	3.82	2.63	4.62	0.00	8.19	7.66	0.00	2.02	0.00	5.46	3.95	2.34	4.04	0.00
7	ER1b	ExonRegion	0	2.14	0.00	4.01	7.31	4.98	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	2.53	2.36	2.73	0.00	5.62	4.58	0.00	1.42	0.00	4.29	0.56	1.83	3.73	0.00
8	ER1c	ExonRegion	0	7.85	1.32	1.79	5.37	1.46	2.58	1.31	1.03	1.11	0.88	0.13	0.27	2.87	1.27	1.12	3.50	3.90	2.42	0.65	7.72	6.15	1.69	1.20	0.88	2.27	3.29	0.63	4.45	1.29
9	E1_Da	KnownBoundary	0	15.87	0.00	4.04	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	2.62	2.04	0.00	0.00	6.21	1.86	0.00	3.60	12.09	10.02	0.00	3.80	15.32	2.19	0.00	0.00	0.00	3.95	0.00	15.55	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	5.64	8.01	2.24	5.91	2.00	1.55	3.04	0.00	4.56	0.00	7.27	2.77	0.00	0.00	7.69	5.94	9.87	4.33	0.00	1.44	14.46	3.98	1.93	1.52
11	ER1d	ExonRegion	0	11.62	5.27	6.64	30.80	15.76	6.20	10.35	4.14	6.16	1.97	2.57	5.21	10.12	3.03	4.95	4.48	7.20	2.97	1.57	9.73	15.07	11.91	1.77	2.11	1.11	20.36	14.83	34.03	2.17
12	E1_Db	NovelBoundary	0	8.08	0.00	4.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	1.51	1.24	0.00	0.00	0.00	4.43	0.00	0.00	0.00	0.00	4.08	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
13	E1b_E2a	KnownJunction	0	2.48	4.65	7.23	9.27	12.08	3.53	5.09	2.54	1.46	1.84	4.52	3.31	1.66	0.93	0.00	0.00	8.80	0.00	0.00	6.45	4.09	2.04	0.00	0.00	1.93	13.00	16.95	19.99	1.35
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.67	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.83	0.00	0.00	6.86	3.29	0.00	0.00	2.93	5.19	0.00	0.00	1.84	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	3.67	3.28	2.41	9.87	12.48	7.37	7.87	2.24	5.05	6.33	9.55	3.23	1.97	3.93	2.83	4.76	11.86	3.72	0.00	14.15	13.20	3.21	4.99	2.80	3.22	18.59	5.19	13.33	5.97
16	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.47	0.00	20.93	3.61	0.00	2.54	4.11	3.75	4.21	1.54	0.00	1.97	0.00	0.00	5.56	0.00	0.00	2.98	1.48	0.00	0.00	5.56	1.93	0.00	0.00	6.47	1.68
17	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2b	ExonRegion	0	2.37	3.30	1.78	0.00	3.37	3.34	2.21	2.61	7.84	3.01	1.22	1.84	1.00	2.14	2.14	0.00	9.52	0.41	2.22	5.21	6.07	0.40	1.47	6.16	0.79	3.23	3.15	3.90	3.19
19	E2_Db	KnownBoundary	0	5.96	4.85	2.49	0.00	0.00	1.50	8.75	0.00	7.19	2.04	4.37	2.80	5.99	4.83	0.00	0.00	12.88	0.00	8.09	16.21	5.05	0.00	2.07	3.05	0.00	2.15	0.00	14.51	5.25
20	ER2c	ExonRegion	0	4.79	5.23	2.33	3.60	5.73	5.74	3.97	4.99	12.65	5.80	3.39	2.87	3.08	2.42	9.58	5.56	7.60	3.67	3.72	3.59	10.07	2.12	2.24	5.87	4.02	5.76	4.72	6.82	2.75
21	E2_Dc	NovelBoundary	0	10.44	0.00	4.34	0.00	6.63	4.99	2.52	7.02	16.96	3.71	1.27	0.00	7.48	0.00	8.17	17.21	14.92	0.00	0.00	4.13	15.88	17.70	4.33	5.38	8.52	16.99	8.50	6.38	11.75
22	E2c_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E3_Aa	NovelBoundary	0	10.38	9.21	4.04	10.78	0.00	7.10	0.00	25.58	22.99	3.87	3.80	0.00	3.41	2.02	0.00	7.04	19.31	0.00	0.00	0.00	22.66	4.38	0.00	2.87	6.52	16.09	1.89	2.02	5.05
24	ER3a	ExonRegion	0	3.79	3.39	2.93	1.26	4.28	3.63	3.17	0.97	6.83	6.06	2.70	1.41	2.68	1.75	9.99	3.70	7.60	3.02	0.00	5.84	4.77	4.08	1.90	5.65	2.25	11.26	3.18	9.18	2.50
25	E3_Da	NovelBoundary	0	61.40	76.20	46.59	68.37	72.51	52.60	15.73	48.77	114.47	81.69	14.96	41.48	44.04	44.53	79.13	45.36	75.79	4.50	0.00	36.30	67.71	48.52	38.71	62.09	41.56	43.99	63.36	69.55	45.33
26	I3	Intron	0	1.71	3.60	1.87	1.15	0.78	0.44	0.32	2.94	8.42	1.15	3.62	0.79	1.35	2.02	0.00	2.78	7.88	1.54	3.06	2.96	0.91	0.86	0.00	1.72	1.14	6.03	0.00	4.69	3.64
27	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	1.72	3.62	1.88	1.15	0.78	0.44	0.32	2.95	8.45	1.16	3.63	0.79	1.35	2.03	0.00	2.79	7.90	1.54	3.07	2.97	0.92	0.87	0.00	1.72	1.15	6.05	0.00	4.71	3.65
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	48.96	242.18	138.03	134.81	96.38	158.34	82.39	60.66	73.73	170.21	164.37	104.88	76.46	162.43	207.49	194.54	256.85	111.99	153.76	81.05	136.98	61.21	78.21	184.17	119.68	58.53	138.21	59.62	76.95
29	ER4a	ExonRegion	0	1.02	0.00	1.59	0.00	6.98	1.97	1.90	0.88	1.33	1.38	0.00	0.88	1.24	3.81	0.00	3.55	0.71	1.84	4.57	0.00	2.04	0.00	0.00	2.03	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00