Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RFX8	Gene	0	2.96	1.86	0.10	0.14	1.42	0.67	0.51	0.11	1.56	1.18	0.28	0.54	0.00	1.82	0.39	0.97	2.49	1.25	0.50	0.11	0.75	0.42	0.46	1.17	0.58	0.52	0.18	0.22	0.43
2	428343	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
3	428203	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	481179	Transcript	0	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	484091	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00
6	376826	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	492238	Transcript	0	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.68	0.36	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.73	0.16	0.62	0.34	0.00	0.75	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05
8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	5.80	2.38	0.00	0.00	8.28	1.08	0.00	0.00	1.78	1.04	0.00	2.85	0.00	1.69	0.00	0.00	1.90	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	1.89	1.23	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E3a	KnownJunction	0	11.68	0.00	0.00	0.00	5.75	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	2.71	0.00	2.06	0.00	0.00	2.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER3a	ExonRegion	0	6.29	3.15	0.00	0.00	1.69	0.18	0.00	0.00	0.50	0.64	0.12	0.72	0.00	2.77	0.00	0.00	0.73	2.05	1.31	1.13	1.20	0.00	2.17	0.88	1.95	1.84	0.01	1.34	0.55
15	E3a_E4a	KnownJunction	0	3.01	4.85	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	2.83	0.00	0.00	1.87	0.00	1.13	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E3a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER4a	ExonRegion	0	6.67	3.71	0.00	0.00	0.00	0.78	1.24	0.00	2.39	1.19	1.73	2.57	0.00	1.04	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	1.13	0.29	0.79	0.00	0.00	0.61	1.48	0.00	3.49
19	E4a_E5a	KnownJunction	0	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.00	1.89	0.00	0.00	5.15	0.00	3.06	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	4.46
20	E4a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER5a	ExonRegion	0	5.79	3.06	0.00	0.00	2.18	0.00	0.30	0.00	0.52	0.48	0.00	1.69	0.00	3.59	0.00	0.00	2.45	0.00	1.14	0.00	0.10	1.91	2.20	1.26	2.23	1.35	0.00	0.00	0.65
22	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	2.04	0.00	1.33	0.00	1.99	0.00	3.21	0.83	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	4.38	0.00	0.00	0.00
23	E5a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E6a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER7a	ExonRegion	0	2.11	0.98	0.00	0.00	3.89	0.00	0.00	0.00	0.61	0.99	0.30	1.22	0.00	2.79	0.00	0.00	1.27	0.00	0.99	0.00	0.00	0.85	0.57	1.65	1.14	1.52	2.80	2.60	0.00
28	E7a_E8a	KnownJunction	0	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	2.04	2.47	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E7a_E13a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER8a	ExonRegion	0	2.53	4.76	0.00	0.00	2.78	0.63	0.93	0.00	1.64	3.29	0.92	0.57	0.00	5.03	2.12	0.62	5.00	3.54	0.00	0.00	1.18	1.17	0.20	0.99	3.26	2.02	0.91	0.00	0.62
32	E8a_E9a	KnownJunction	0	5.78	4.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.75	2.04	0.00	0.00	0.00	6.05	0.00	3.67	4.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	1.78	1.76	0.00	0.00	0.00
33	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER9a	ExonRegion	0	3.10	2.37	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	5.26	0.94	0.00	0.00	0.00	7.11	0.00	1.08	5.47	1.82	2.26	0.00	0.11	0.00	2.58	0.72	0.50	0.29	0.00	0.00	0.00
35	E9_Da	KnownBoundary	0	2.48	0.00	0.00	0.00	6.93	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	5.83	0.00	0.00	4.12	0.00	8.09	0.00	2.05	0.00	2.36	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	E9_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E9b_E10a	KnownJunction	0	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E9_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58
40	ER9b	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	4.49	3.67	0.00	0.00	0.00	6.46	0.00	0.00	3.46	0.00	1.70	0.00	0.77	0.00	1.28	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84
41	ER9c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	4.33	0.00	0.00	0.00	3.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
42	ER9d	ExonRegion	0	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	1.83	1.08	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00	2.19	0.48	1.87	1.03	0.00	2.24	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.30	0.00	0.14
43	E9_Dd	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	5.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	I9_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER10a	ExonRegion	0	5.51	0.00	0.00	3.21	2.40	0.61	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.42	0.00	1.58	0.00	1.33	4.12	0.86	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.96	0.00	0.70	0.00	0.73	0.00
46	E10a_E11a	KnownJunction	0	3.01	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	0.00	1.87	0.00	4.03	0.00	6.35	4.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER11a	ExonRegion	0	3.96	2.15	0.00	0.00	1.65	0.00	0.68	0.00	0.38	3.37	0.00	0.30	0.00	3.30	0.00	2.35	2.96	0.65	0.00	0.00	0.96	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E11_Da	NovelBoundary	0	4.84	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	1.29	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
49	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	E11a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	I11_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.82	0.00	0.00	0.00	1.16	0.33	0.00	0.00	1.20	0.34	0.00	0.29	0.00	0.54	0.00	2.72	3.08	0.00	0.00	1.18	0.68	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.55	0.00
52	E12_Aa	NovelBoundary	0	2.89	4.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	3.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	E12_Da	NovelBoundary	0	2.54	3.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	7.27	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
56	I12_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.05	0.00	0.34	1.44	0.00	1.04	0.00	0.00	1.24	0.87	0.12	0.00	0.00	0.36	0.00	1.68	2.05	1.23	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.98	0.29	0.73	0.00	0.16	0.00
57	I12_SR2	SilentIntronRegion	0	1.04	0.37	0.58	0.00	0.00	0.23	0.23	0.00	3.05	1.67	0.00	0.43	0.00	1.10	0.00	0.86	2.48	1.12	0.00	0.00	0.83	0.42	0.21	1.11	0.66	0.08	0.00	0.38	0.00
58	E13_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	7.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	4.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
59	ER13a	ExonRegion	0	5.43	2.09	0.00	0.00	3.17	2.68	1.22	0.00	2.73	2.71	0.00	0.46	0.00	2.39	0.00	1.61	5.24	1.22	1.04	0.00	1.22	0.73	0.59	0.70	0.93	0.00	0.00	0.09	0.00
60	E13a_E14a	KnownJunction	0	8.20	0.00	0.00	0.00	14.74	0.00	2.17	0.00	2.83	3.67	0.00	1.17	0.00	1.91	0.00	0.00	0.00	5.01	0.00	0.00	2.01	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00
61	ER14a	ExonRegion	0	4.04	0.00	0.00	0.00	5.24	1.14	0.15	0.00	1.37	0.94	0.00	1.55	0.00	2.36	0.00	1.39	7.34	0.26	0.00	0.00	1.05	1.69	0.97	0.38	0.45	0.00	0.00	0.72	0.00
62	E14a_E15a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	3.38	0.00	0.00	5.54	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	8.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00
63	ER15a	ExonRegion	0	4.01	1.43	0.00	0.00	0.00	2.10	0.89	0.00	2.62	0.00	0.00	0.09	0.00	1.70	2.05	1.67	4.69	3.54	0.00	0.00	0.96	1.40	0.80	2.54	1.53	1.39	0.00	0.00	0.00
64	E15a_E16a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	3.82	4.57	0.00	0.00	0.00	1.97	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	ER16a	ExonRegion	0	5.54	2.07	0.54	0.00	1.57	0.25	0.65	0.89	2.58	0.79	0.77	0.96	0.00	1.67	1.77	0.97	3.97	2.48	0.00	0.00	0.57	0.65	0.00	3.85	0.46	0.76	0.00	0.26	0.65
66	E16a_E17a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	1.25	1.84	0.00	0.00	0.00	3.08	0.00	0.00	3.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
67	E17_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
68	ER17a	ExonRegion	0	1.16	4.09	0.27	0.00	0.00	1.94	0.64	0.00	2.26	1.06	0.76	0.20	0.00	1.43	0.00	1.07	1.95	0.61	1.02	0.44	0.23	0.29	0.29	1.67	0.00	0.25	0.00	0.00	1.33
69	E17_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.47
70	ER17b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37