Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ATOH8	Gene	0	1.33	2.65	8.86	2.53	0.20	3.74	0.88	1.17	1.53	6.42	2.75	2.06	3.89	0.85	1.76	2.45	2.77	3.28	1.69	0.97	0.61	2.56	4.77	34.02	1.99	1.46	2.14	0.79	2.40
2	469442	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	377336	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	306279	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	463422	Transcript	0	0.14	0.29	0.78	0.32	0.22	0.88	0.17	0.20	0.15	0.70	0.32	0.19	0.20	0.30	0.37	0.46	0.17	1.12	0.78	0.15	0.38	0.08	0.52	2.08	0.17	0.14	0.96	0.04	0.47
6	485877	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	473116	Transcript	0	0.20	0.00	0.12	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.04	0.16	0.21	0.07	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.26	0.12	0.49	0.06	0.03	0.00	0.00	0.12
8	489682	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	2.68	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	11.01	0.00	0.00	0.00	0.00	2.97
12	ER2a	ExonRegion	0	1.25	2.40	5.67	0.14	0.00	3.23	1.18	0.02	0.69	4.42	1.09	0.70	2.80	0.66	0.38	2.37	2.28	3.32	0.65	1.12	0.39	2.76	4.00	23.39	0.58	0.85	0.50	0.18	0.86
13	E2_Ab	KnownBoundary	0	11.03	0.00	22.07	0.00	0.00	6.64	2.86	0.00	0.00	18.81	1.61	2.32	3.47	0.89	0.00	3.75	3.80	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	11.43	35.59	0.00	0.00	0.00	2.25	1.78
14	ER2b	ExonRegion	0	5.45	2.31	19.39	4.43	0.00	7.47	1.70	1.23	1.98	15.44	2.85	2.99	3.98	1.79	6.86	1.76	2.72	6.78	1.15	2.97	0.70	3.35	9.82	51.76	1.97	0.34	2.32	0.86	1.98
15	E2_Ac	KnownBoundary	0	10.74	0.00	16.29	0.00	0.00	19.45	0.00	0.00	4.81	38.63	10.79	2.71	7.80	5.74	8.17	5.97	5.02	4.62	0.00	0.00	5.82	2.14	6.35	111.97	6.97	2.19	16.70	4.58	4.39
16	ER2c	ExonRegion	0	8.89	6.18	24.85	9.40	0.00	8.98	1.01	1.84	3.10	24.71	6.71	5.90	9.89	3.17	1.97	5.18	10.51	8.61	5.31	4.84	1.69	2.66	15.05	93.28	4.01	3.80	2.32	3.26	4.29
17	E2a_E4a	KnownJunction	0	2.77	13.38	41.61	10.78	0.00	12.51	2.80	1.94	4.51	27.32	5.66	11.14	5.99	3.43	0.00	3.29	10.40	9.25	0.00	7.19	1.80	4.67	18.17	99.05	8.52	8.20	4.52	12.09	0.00
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.86	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	1.79	0.00	0.71	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00
20	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER4a	ExonRegion	0	4.95	6.33	33.04	9.10	0.00	11.74	2.33	4.00	5.35	30.56	8.82	10.44	10.30	2.92	1.90	6.95	12.90	13.40	4.13	2.36	1.41	11.76	17.79	120.59	5.17	8.93	4.52	5.48	11.39
22	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E4a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E4a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E4a_E8a	KnownJunction	0	0.00	4.36	41.43	0.00	0.00	10.17	0.00	4.43	8.13	30.32	7.24	14.76	10.60	3.06	9.97	3.67	12.61	4.62	0.00	0.00	1.76	8.80	13.84	149.78	3.60	9.27	0.00	0.00	10.80
26	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.56	1.13	0.00	0.00	0.24	0.44	0.00	0.00	0.25	0.00	0.09	0.00	0.08	0.60	0.87	0.26	3.15	1.12	0.23	0.50	0.00	0.00	0.83	0.13	0.00	4.61	0.00	0.00
27	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	5.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	2.24	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	2.45	1.86	0.00	2.48	0.00	0.00
28	ER5b	ExonRegion	0	0.14	0.29	0.78	0.32	0.22	0.88	0.17	0.20	0.15	0.70	0.32	0.19	0.20	0.30	0.37	0.46	0.17	1.12	0.78	0.15	0.38	0.08	0.52	2.08	0.17	0.14	0.96	0.04	0.47
29	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER6a	ExonRegion	0	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00
32	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.29	0.66	0.00	0.46	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	2.06	0.39	0.00	0.00	0.00	0.81
35	E7_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.84	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	1.46	2.04	0.00	1.54	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	8.73	1.86	0.00	0.00	0.00	2.05
36	ER7b	ExonRegion	0	0.83	2.49	1.48	0.00	0.00	1.26	0.00	0.71	0.28	0.21	0.00	1.19	1.22	0.00	0.13	0.00	0.58	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	7.25	0.90	0.00	0.00	0.00	0.35
37	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER7c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER8a	ExonRegion	0	3.42	3.42	37.09	15.39	0.00	8.18	3.53	2.21	7.40	20.09	5.14	7.89	14.82	2.47	9.33	9.23	9.13	7.25	5.00	1.46	1.95	17.45	13.00	115.60	5.94	8.45	3.13	4.26	6.96
41	E8_Da	KnownBoundary	0	5.01	9.50	26.98	20.92	0.00	12.74	7.21	1.89	5.79	24.85	9.78	12.53	17.13	1.13	8.17	7.27	5.04	9.25	16.18	0.00	1.89	22.41	14.43	120.83	8.30	8.75	7.60	10.02	12.97
42	E8a_E8b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER8b	ExonRegion	0	3.31	11.28	30.52	9.74	0.87	12.14	2.96	5.72	5.08	22.10	11.22	7.66	16.30	2.80	7.15	8.74	9.57	7.98	5.75	3.11	1.44	7.68	16.59	128.06	8.39	4.54	7.16	2.49	9.44
44	E8_Ab	KnownBoundary	0	0.00	3.49	12.16	0.00	0.00	30.16	0.00	0.00	8.56	9.47	12.12	7.71	9.94	0.00	8.37	3.82	8.58	18.49	8.09	0.00	2.05	4.86	9.16	78.36	3.45	7.98	0.00	2.11	6.27
45	ER8c	ExonRegion	0	0.62	3.00	15.70	4.15	0.00	7.62	0.79	0.80	6.61	3.04	6.15	2.21	5.70	0.01	3.69	4.73	3.64	4.17	2.24	0.80	1.01	7.57	6.99	66.61	5.41	3.10	1.97	1.78	3.17
46	E8_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	51.97	0.00	0.00	21.06	2.75	2.54	11.42	5.75	19.87	7.02	8.79	0.00	0.00	0.00	9.48	0.00	0.00	0.00	0.00	6.08	20.64	110.54	13.64	3.95	24.65	3.82	8.22
47	ER8d	ExonRegion	0	0.00	0.00	35.91	0.00	0.00	14.02	2.02	1.84	7.86	5.78	19.04	4.95	7.38	0.00	0.00	2.53	6.01	15.07	0.00	0.00	1.43	5.41	16.27	95.86	11.32	6.29	18.97	0.78	6.60
48	ER8e	ExonRegion	0	0.00	0.00	17.45	0.00	0.00	4.33	0.67	0.07	3.33	2.78	8.20	2.43	2.74	0.00	0.00	2.34	2.75	7.58	0.00	0.00	1.27	3.07	7.37	44.70	4.92	3.55	7.67	0.00	2.09
49	IG8_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	IG8_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	9.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	IG8_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.70	0.60	0.31	0.00	0.42	0.17	0.16	0.00	1.20	0.61	0.45	0.48	0.12	0.88	0.43	0.24	0.25	0.14	0.00	0.19	0.00	1.01	10.36	0.25	0.00	0.08	0.14	0.00
52	IG8_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.17	0.94	0.37	0.57	0.30	0.00	0.71	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	6.48	0.00	0.24	0.28	0.00	0.31