Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC027612.7	Gene	0	12.30	5.13	14.61	0.60	12.60	3.20	18.45	37.22	10.43	7.57	6.14	7.73	2.26	8.50	10.95	3.24	5.84	0.48	7.44	16.98	2.61	4.65	11.29	10.20	21.41	4.45	2.29	3.53	4.84
2	271699	Transcript	0	3.52	1.98	5.99	5.93	5.02	1.05	4.60	24.92	4.35	4.71	3.01	1.68	0.66	4.37	4.17	2.84	2.08	1.23	2.34	4.06	1.27	1.60	6.16	6.25	15.36	2.72	0.86	1.30	3.00
3	423774	Transcript	0	0.27	0.00	5.17	0.61	2.91	0.00	1.34	4.30	1.69	1.14	0.50	0.93	0.27	1.06	4.09	0.32	1.13	0.23	0.38	0.00	0.36	0.00	1.13	0.90	4.25	0.33	0.23	0.20	1.06
4	ER1a	ExonRegion	0	2.14	0.00	10.43	0.00	7.41	0.00	4.72	6.47	1.67	1.80	1.19	0.94	0.41	1.48	3.42	2.16	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	3.00	1.00	1.03	1.63	0.72
5	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	1.07	0.00	17.39	0.00	9.96	0.00	4.03	3.68	4.49	2.17	1.19	3.71	0.65	1.81	2.80	1.27	3.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00	7.15	0.79	0.92	0.82	3.36
7	ER2b	ExonRegion	0	8.49	1.25	23.09	0.84	23.61	0.00	15.00	45.56	9.67	7.35	0.78	7.32	2.96	4.67	11.76	1.24	6.28	1.10	3.77	4.76	2.77	4.21	7.36	12.78	12.47	7.35	2.52	2.65	6.32
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2b_E3b	KnownJunction	0	2.83	4.17	9.09	28.26	6.19	1.73	0.00	60.91	9.01	11.42	7.24	0.00	0.00	8.29	8.37	10.71	1.96	4.62	0.00	0.00	3.61	4.38	16.10	13.64	46.79	9.83	2.09	2.02	9.47
10	E2b_E4a	NovelJunction	0	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	36.13	4.35	3.36	6.80	0.00	1.75	2.42	0.00	3.44	0.00	4.62	8.09	12.40	7.74	2.19	7.04	2.75	5.42	0.00	0.00	1.66	6.40
11	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.24	7.31	4.98	0.00	2.02	41.12	4.49	7.22	1.98	0.00	1.30	6.05	0.00	0.00	3.01	2.73	4.53	0.00	0.95	0.00	5.42	12.91	15.72	1.57	0.00	0.00	2.68
12	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	4.18	3.11	0.00	0.00	0.00	1.53	5.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	6.86	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.87	2.44	1.66	0.00	1.34	13.50	2.25	2.41	0.79	0.00	0.43	2.42	5.60	0.00	1.00	0.91	1.51	0.00	1.43	0.00	1.81	3.59	8.10	0.52	0.00	0.00	0.89
14	ER3b	ExonRegion	0	8.82	3.67	6.32	2.94	3.11	4.53	23.35	26.06	15.41	10.78	11.89	6.94	2.34	11.07	4.58	3.52	5.83	1.81	9.11	16.02	2.07	5.90	15.90	8.80	24.93	4.29	3.92	3.70	3.70
15	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3_Db	NovelBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	5.72	0.00	0.00	1.84	0.00	1.17	0.00	2.35	18.74	0.00	3.80	0.00	0.00	3.56	2.05	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	8.72	1.65
17	ER3c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.88	1.86	0.65	0.79	5.94	1.99	0.22	0.81	3.52	0.72	1.17	0.85	0.29	0.89	2.47	1.51	1.65	0.21	1.41	0.76	5.88	0.10	0.10	0.48	0.63	0.26	0.41	0.45	0.30
19	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.43	0.00	2.75	0.00	1.00	0.24	4.09	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00
20	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	7.47	1.29	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	5.60	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	1.52	2.38	0.00	0.00	1.32	0.00
21	I3_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I3_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.82	4.74	0.64	0.92	1.25	2.09	2.47	1.18	4.18	4.07	0.46	1.98	0.50	0.33	2.59	0.32	3.47	0.00	0.41	0.35	5.31	0.00	0.93	3.56	2.62	0.60	0.65	0.42	0.73
23	I3_AR10	ActiveIntronRegion	0	3.23	5.83	0.84	0.00	9.47	2.13	2.23	6.88	1.46	4.50	0.60	2.21	0.00	3.33	0.93	0.75	1.35	0.00	0.00	0.70	6.79	0.36	2.30	0.54	4.62	1.38	1.71	4.26	0.00
24	I3_SR5	SilentIntronRegion	0	2.95	0.89	1.15	0.00	5.28	1.66	1.25	5.05	1.20	2.28	0.57	1.79	0.09	1.27	1.27	0.76	1.85	0.13	0.66	1.41	3.60	0.25	1.04	0.81	3.13	1.00	0.72	1.34	0.60
25	I3_AR11	ActiveIntronRegion	0	8.25	2.88	2.01	0.00	2.35	0.66	5.33	12.84	1.35	3.13	1.72	2.96	0.00	6.20	1.32	2.82	2.15	0.00	1.54	0.66	4.80	3.47	2.18	2.07	3.09	3.78	1.32	2.74	2.25
26	ER4a	ExonRegion	0	16.12	7.69	14.15	0.00	11.52	4.60	20.89	41.04	10.94	7.80	7.65	9.12	2.27	10.42	13.26	4.17	6.39	0.00	9.54	24.37	3.05	5.25	13.13	10.98	26.66	3.94	2.07	4.16	5.14
27	IG8_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	3.10	1.22	2.02	0.00	2.94	0.87	0.00	1.57	2.49	2.12	0.26	0.33	0.00	3.78	0.00	2.96	2.36	1.71	0.00	0.00	2.60	0.00	0.25	0.97	1.87	0.18	0.00	1.77	0.00
28	IG8_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	0.66	0.00	1.12	0.00	0.00	0.63	0.00	1.84	0.78	5.22	0.00	1.24	0.00	2.02	0.00	2.53	2.39	2.73	2.79	0.00	1.43	0.00	1.81	2.15	1.43	0.00	0.00	11.66	0.00
29	IG8_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.22	0.00	1.41	0.00	4.29	0.07	0.00	3.14	4.22	3.91	0.00	0.92	0.00	1.94	0.00	3.71	1.73	1.88	4.45	0.00	3.00	0.00	0.12	1.22	1.87	0.00	0.00	8.35	0.00
30	IG8_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	3.96	0.00	3.37	0.00	0.00	2.54	0.00	8.92	1.90	0.89	0.00	2.19	0.00	0.91	0.00	4.48	1.77	5.46	1.74	0.00	6.14	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	3.26	0.00
31	IG8_SR4	SilentIntergenicRegion	0	3.52	0.00	1.40	1.41	2.89	1.82	0.40	3.32	1.19	2.73	0.12	1.43	0.00	0.92	0.45	0.69	2.74	0.70	1.58	0.27	3.17	0.00	0.71	0.86	2.81	0.19	0.36	3.06	0.13
32	IG8_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	2.84	1.28	1.61	0.00	5.16	2.18	1.62	6.94	1.26	7.65	1.98	3.14	0.00	1.73	1.45	1.97	5.10	3.39	1.69	2.42	3.50	0.24	1.43	3.43	5.04	2.71	0.00	0.30	0.00
33	IG8_SR3	SilentIntergenicRegion	0	1.88	5.63	2.09	0.76	3.62	2.06	2.77	7.29	2.61	6.11	1.14	2.19	0.51	3.29	2.09	1.82	7.03	2.89	1.02	3.90	5.04	0.91	2.48	6.49	5.70	0.60	0.78	3.32	0.71
34	IG8_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.94	2.49	3.32	2.01	7.87	1.96	4.59	6.48	5.48	7.43	2.19	4.00	0.11	5.96	5.19	2.28	4.96	3.03	3.13	3.20	6.79	0.19	3.24	12.51	9.87	2.26	1.22	1.76	1.05
35	IG8_SR2	SilentIntergenicRegion	0	2.33	2.10	1.45	0.00	1.06	1.49	1.75	3.20	3.53	1.57	2.07	0.27	0.85	0.88	4.19	2.15	0.65	0.91	2.77	0.60	1.24	0.00	0.38	7.00	1.24	0.34	0.00	0.35	1.46