Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GPR35	Gene	0	2.09	2.88	2.96	0.47	0.48	4.55	1.05	2.12	3.94	5.67	3.80	1.47	4.66	2.81	9.16	6.33	7.12	5.27	1.30	6.96	6.20	5.76	2.08	16.47	24.00	7.50	7.96	2.56	11.78
2	319838	Transcript	0	0.00	0.11	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.31	0.85	0.54	0.67	1.73	0.00	0.19	0.70	0.00	0.31	2.20	0.05	0.06	0.00	0.12	0.16
3	403859	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	438013	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	407714	Transcript	0	3.32	2.85	1.09	0.00	0.00	14.65	0.00	0.31	3.83	8.84	5.68	4.53	5.80	1.76	1.09	1.31	1.71	1.06	0.25	9.07	14.13	8.25	3.25	15.94	46.20	18.72	29.70	3.85	53.95
6	430267	Transcript	0	0.58	0.24	0.00	0.00	0.00	0.65	0.29	0.01	1.55	0.30	0.01	0.34	0.14	1.08	4.68	1.63	2.61	0.53	0.00	1.03	0.56	0.20	0.01	0.10	0.93	0.89	0.08	0.60	1.90
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.36	0.34	0.40	4.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	2.02	0.97	0.00	0.00	0.65	5.60	8.71	2.79	1.48	0.00	0.70	0.37	0.25	0.00	0.62	0.93	1.65	0.00	0.00	0.82
9	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	4.36	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	6.11	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	3.82	7.02	4.62	0.00	4.13	3.77	2.24	0.00	5.56	1.93	3.95	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.76	0.52	0.20	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.79	0.56	0.38	0.00	0.37	0.00	4.94	6.98	0.78	0.00	1.59	1.16	0.97	0.10	3.23	0.78	2.41	0.35	0.04	1.52
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.38	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.44	0.12	0.10	0.80	0.50	2.59	5.28	0.66	0.00	1.36	2.14	0.94	0.57	4.51	0.00	1.86	0.12	1.10	1.30
14	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.43	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.01	0.53	0.01	0.01	1.22	0.05	1.83	2.26	0.00	0.00	0.76	2.79	0.00	1.24	5.13	0.19	0.12	0.00	0.47	0.64
17	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER4b	ExonRegion	0	0.35	0.85	1.03	0.00	0.00	1.79	0.54	0.00	0.78	1.79	0.00	0.96	0.63	2.29	2.37	7.63	4.36	3.12	0.00	2.72	2.28	0.49	0.52	7.97	2.06	2.35	1.98	2.47	1.07
19	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E4a_E5a	KnownJunction	0	3.01	4.36	1.30	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	4.45	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	3.82	2.68	0.00	0.00	6.78	1.68	0.00	2.41	3.05	1.40	0.00	0.00	0.00	6.47
21	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
22	ER5a	ExonRegion	0	0.77	2.11	3.59	0.00	0.00	2.14	1.69	0.16	3.81	0.70	0.00	0.13	0.00	2.30	7.70	15.95	7.23	6.97	0.00	7.38	3.23	2.35	0.65	17.36	0.46	3.31	0.00	0.52	4.05
23	E5_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	5.43	0.00	0.00	1.96	2.17	0.00	2.56	2.04	0.00	0.00	0.00	4.52	9.17	19.05	13.30	9.25	0.00	10.25	5.62	2.48	0.00	16.03	0.00	8.37	0.00	6.20	3.30
24	ER5b	ExonRegion	0	1.24	0.00	3.26	0.00	0.00	4.03	1.26	1.44	3.13	4.50	0.00	0.98	0.93	3.67	0.95	10.41	6.67	5.71	0.00	8.37	3.55	2.21	0.08	12.42	2.39	9.73	6.37	3.50	1.95
25	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	1.96	0.00	2.54	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	3.96	0.00	0.00	0.00	8.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E5a_E7b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	0.00	2.54	6.33	1.48	0.00	0.00	3.57	1.95	0.00	6.96	7.50	0.00	0.00	7.11	5.37	6.42	0.00	10.77	3.67	13.90	0.00	0.00	0.00
27	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.41	0.00	0.61	0.87	0.00	2.16	0.49	0.00	0.20	1.39	0.29	0.00	0.00	1.43	2.23	0.60	3.24	0.85	0.00	1.00	1.73	0.87	0.00	2.08	0.35	0.00	0.00	0.66	1.42
28	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.95	0.00	0.00	0.00
29	ER6a	ExonRegion	0	0.63	1.33	0.64	0.00	0.00	4.67	0.00	0.63	1.21	4.58	2.38	1.04	2.33	0.80	2.18	2.62	0.86	2.12	0.50	3.09	5.53	2.83	1.81	6.88	12.55	6.38	9.11	1.58	15.29
30	E6a_E7b	KnownJunction	0	6.02	4.36	1.54	0.00	0.00	24.63	0.00	0.00	6.46	13.10	8.98	8.01	9.27	2.73	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	15.05	22.74	13.66	4.68	25.00	79.86	31.07	50.29	6.11	92.60
31	ER7a	ExonRegion	0	0.58	0.24	0.00	0.00	0.00	0.65	0.29	0.01	1.55	0.30	0.01	0.34	0.14	1.08	4.68	1.63	2.61	0.53	0.00	1.03	0.56	0.20	0.01	0.10	0.93	0.89	0.08	0.60	1.90
32	E7_Ab	KnownBoundary	0	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	3.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	3.37	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	1.70	1.67	0.00	0.00	6.24
33	ER7b	ExonRegion	0	4.68	5.60	5.53	0.32	1.24	9.21	1.99	4.48	6.18	10.76	8.31	3.23	10.84	4.96	14.95	9.84	13.99	11.73	2.93	11.47	12.29	11.79	3.80	29.72	47.33	15.75	17.53	4.28	23.38
34	E7_Da	KnownBoundary	0	2.36	9.70	9.37	8.63	7.22	3.72	2.75	4.93	1.40	12.54	12.91	3.07	21.02	0.89	26.51	14.38	4.66	14.64	8.09	36.55	10.67	13.47	4.92	41.99	63.87	3.65	14.96	16.67	21.00
35	ER7c	ExonRegion	0	3.76	8.68	9.14	1.73	1.18	7.80	2.26	6.69	13.10	13.78	9.19	1.75	10.60	5.35	25.73	8.32	8.18	8.26	2.37	20.67	11.66	12.94	5.64	43.93	74.72	9.59	14.36	7.10	24.60
36	E7_Db	KnownBoundary	0	5.66	0.00	3.91	8.63	0.00	10.63	0.00	4.48	5.97	10.83	5.73	2.83	1.97	7.53	17.54	14.15	4.12	4.62	0.00	7.19	7.02	0.00	7.14	18.48	39.59	16.56	7.01	2.20	5.98
37	ER7d	ExonRegion	0	1.70	3.45	5.45	8.12	0.00	8.48	3.76	2.72	10.66	11.16	5.05	2.38	5.18	6.15	27.66	6.67	6.63	2.76	5.96	15.49	9.01	19.06	4.98	43.47	51.65	12.78	6.37	2.03	10.08
38	ER7e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	IG25_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	1.49	1.33	0.00	0.18	0.29	0.68	0.36	1.24	2.66	1.43	0.06	1.49	0.65	0.99	0.78	0.93	1.29	0.00	0.46	1.81	0.65	0.39	4.68	8.98	2.69	5.59	1.01	3.50
40	IG25_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.88	5.52	3.90	0.00	0.59	3.35	0.41	2.23	2.63	5.12	5.26	1.11	4.66	1.03	2.34	3.01	2.47	3.87	0.87	3.28	3.44	3.79	1.32	18.91	23.82	6.62	9.59	1.04	10.90