Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-85F18.2	Gene	0	3.11	3.59	0.75	1.60	1.09	5.68	1.35	0.82	5.13	4.35	1.86	1.24	0.80	4.13	5.86	11.56	7.16	3.05	10.70	1.37	2.39	2.01	0.20	4.80	3.51	0.18	1.23	0.91	0.37
2	420537	Transcript	0	1.21	1.40	0.33	0.71	0.43	4.79	1.39	0.34	2.33	2.00	0.74	0.54	0.39	1.61	2.40	5.43	2.80	1.19	5.53	0.53	0.93	0.83	0.08	1.88	1.40	0.07	0.48	0.36	0.15
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.93	2.00	0.00	1.02	0.74	0.51	0.00	0.00	0.00	1.03	1.04	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.25	2.69	0.00	1.61	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	2.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	1.76	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.19	0.00	0.70	1.20	0.00	0.00	8.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	I2	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.24	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.98	1.05	3.17	0.00	2.04	0.59	1.21	0.77	0.00	1.37	0.00	1.67	0.00	0.00	0.29
9	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.24	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.98	1.06	3.19	0.00	2.05	0.59	1.22	0.77	0.00	1.38	0.00	1.68	0.00	0.00	0.29
10	Ix	Intron	0	0.82	0.00	0.51	0.55	0.37	0.42	0.31	0.28	1.93	1.00	0.14	0.52	0.15	0.40	3.10	0.90	4.01	0.00	0.00	0.95	0.33	0.28	0.21	1.40	1.10	0.36	0.00	0.25	0.10
11	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.88	0.00	0.55	0.29	0.40	0.45	0.33	0.29	2.02	1.03	0.15	0.51	0.16	0.43	2.94	0.75	4.25	0.00	0.00	0.97	0.29	0.30	0.22	1.36	1.16	0.39	0.00	0.27	0.11
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	4.54	0.00	0.00	0.00	0.05	0.60	0.40	0.00	0.64	0.00	0.00	5.96	3.20	0.43	0.00	0.00	0.53	0.85	0.00	0.00	2.07	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix	Intron	0	2.69	0.67	2.10	3.00	1.02	5.17	1.69	0.00	0.94	0.60	4.48	0.64	0.27	3.41	5.97	6.74	2.50	3.22	1.34	0.00	3.58	0.75	0.00	0.45	1.49	2.63	1.91	1.02	0.42
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.71	0.68	2.11	3.02	1.03	5.21	1.70	0.00	0.95	0.61	4.51	0.65	0.27	3.44	6.02	6.79	2.52	3.25	1.35	0.00	3.61	0.76	0.00	0.45	1.51	2.65	1.93	1.03	0.42
15	Ix	Intron	0	6.12	8.62	3.90	5.46	4.88	9.62	1.72	0.87	8.35	8.38	3.46	4.41	1.02	11.81	7.79	19.31	14.63	8.16	12.93	5.16	7.05	1.72	1.29	5.43	7.42	1.87	1.48	2.79	2.35
16	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.55	8.95	4.60	6.48	2.79	13.05	2.28	1.21	10.70	9.74	2.15	6.56	1.64	15.29	12.33	22.53	13.67	6.51	14.25	4.16	9.05	3.57	0.80	6.30	11.91	3.96	2.62	3.66	3.98
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.63	8.64	3.47	4.84	6.69	7.23	1.34	0.64	6.77	7.59	4.60	2.86	0.56	9.45	4.48	17.40	15.85	9.73	12.31	6.11	5.71	0.31	1.72	4.91	4.13	0.30	0.63	2.20	1.15
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.59	2.59	0.00	6.48	16.38	0.00	0.00	3.11	5.83	4.27	2.65	2.99	4.54	7.57	22.03	8.31	10.02	0.00	3.80	1.80	2.24	0.00	2.21	5.42	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	6.07	7.02	0.73	1.56	2.13	9.59	1.76	1.20	10.02	8.50	3.62	1.60	0.71	8.07	11.32	21.42	13.99	5.95	19.50	2.67	4.66	3.14	0.39	9.38	6.82	0.34	2.40	1.78	0.73