Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP4-539M6.4	Gene	0	0.89	0.84	1.10	0.00	0.15	0.90	1.14	0.44	1.87	1.38	0.14	0.99	0.41	1.43	1.95	3.06	1.51	1.86	0.86	1.35	0.94	1.88	1.51	1.60	1.53	0.51	1.42	0.78	2.21
2	402034	Transcript	0	0.56	0.63	0.89	0.00	0.07	0.39	1.11	0.21	0.81	0.96	0.07	0.78	0.20	0.67	1.25	3.46	0.99	1.02	0.31	1.07	0.38	1.72	0.57	0.74	0.99	0.22	0.24	0.37	1.58
3	437871	Transcript	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	2.50	7.57	6.50	1.19	4.62	0.00	7.19	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.44	0.00	0.42	0.00	0.00	3.10	1.03	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	1.80
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	1.82
8	ER3a	ExonRegion	0	0.00	1.19	2.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	4.56	3.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER4a	ExonRegion	0	0.00	1.86	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	0.00	1.42	0.00	0.85	2.80	1.18	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	1.12
11	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	1.13	8.37	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	3.60
12	E4a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.04	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	0.00
13	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.87	1.13	0.00	0.00	0.00	0.90	0.50	0.00	0.78	0.00	0.69	0.00	0.96	0.36	3.44	0.55	1.88	0.00	0.74	0.00	0.26	1.15	0.58	0.82	0.00	0.00	0.44	2.20
14	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.81	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
16	ER6a	ExonRegion	0	0.38	0.00	0.92	0.00	0.00	0.32	2.52	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	1.17	0.00	6.01	2.23	1.11	0.00	0.91	0.00	2.67	1.92	1.14	0.76	0.00	0.00	0.00	2.92
17	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	14.08	2.43	4.62	0.00	4.13	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
18	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
19	ER7a	ExonRegion	0	1.19	0.00	1.12	0.00	0.00	0.65	0.96	0.00	0.42	3.62	0.00	0.93	0.00	0.42	0.00	5.81	2.30	1.48	0.00	1.98	0.00	4.96	1.39	2.26	0.30	0.00	0.00	0.00	2.05
20	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	1.64	0.00	0.00	1.20	0.00	1.99	0.00	7.65	2.61	0.00	0.00	7.94	0.00	11.08	0.00	2.75	1.67	0.00	0.00	0.00	3.50
22	E8_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	1.20	0.00	1.77	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	1.52	0.00	0.00	0.00	1.85
23	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	1.12	0.00	0.00	1.24	0.00	2.38	0.00	5.06	2.00	0.00	0.00	2.81	0.00	6.76	0.90	2.69	1.43	0.00	0.00	0.00	1.68
24	ER8b	ExonRegion	0	0.25	0.00	1.06	0.00	0.00	0.09	1.30	0.00	1.42	0.00	0.00	1.38	0.00	1.96	0.00	2.33	1.53	1.29	0.00	2.51	0.00	2.18	0.36	2.24	0.56	0.00	0.70	0.00	2.77
25	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E8a_E9a	KnownJunction	0	4.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	3.82	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	2.05
27	ER9a	ExonRegion	0	0.84	0.00	1.59	0.00	0.00	0.59	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	1.05	0.00	1.63	0.88	2.65	0.00	0.00	0.00	5.58	1.84	1.67	0.47	0.00	0.38	0.00	2.90
28	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.60	2.51	2.99	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER10a	ExonRegion	0	1.36	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	1.84	0.41	0.00	1.56	0.00	2.18	0.28	1.08	1.25	1.01	0.00	3.51	0.00	2.30	2.14	1.08	1.07	0.00	0.00	0.00	2.31
30	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E10a_E12a	KnownJunction	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	2.50	7.57	6.50	1.19	4.62	0.00	7.19	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
32	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12
33	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15
34	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.60
35	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E12_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER12a	ExonRegion	0	0.13	1.15	1.38	0.00	0.08	1.40	1.29	0.15	1.80	1.76	0.02	1.34	0.09	1.80	2.76	4.25	1.77	2.86	1.04	2.04	0.81	2.64	2.53	2.36	1.54	0.41	3.37	0.33	2.06
38	E12_Da	KnownBoundary	0	91.25	69.32	177.02	89.30	26.97	93.92	46.17	75.74	207.63	124.63	32.11	175.72	81.17	147.83	84.91	73.13	484.65	4.50	16.18	62.52	103.89	42.49	54.37	94.21	86.68	127.71	93.83	129.85	96.66
39	ER12b	ExonRegion	0	6.30	3.40	1.78	0.00	1.28	4.48	3.78	3.51	11.40	4.88	1.40	1.35	3.88	3.20	9.20	4.70	5.40	3.80	5.85	1.86	7.29	0.92	1.98	4.57	7.03	4.11	4.58	6.53	5.07