Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP3-324O17.1	Gene	0	0.22	0.00	0.17	0.00	0.51	1.00	1.47	1.34	0.23	0.60	0.00	0.51	0.14	0.19	0.00	0.00	0.47	0.00	1.00	0.29	0.89	0.94	0.38	1.79	0.15	0.00	0.00	0.00	2.44
2	412178	Transcript	0	0.18	0.00	0.14	0.00	0.40	1.40	0.91	0.90	0.14	0.41	0.00	0.64	0.38	0.15	0.00	0.00	0.37	0.00	0.66	0.22	0.64	0.67	0.30	1.15	0.12	0.00	0.00	0.00	2.83
3	ER1a	ExonRegion	0	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.60	0.00	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	2.48	0.00	5.38	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.68	0.00	1.99	2.19	3.27	3.70	0.46	1.77	0.00	1.02	0.18	0.74	0.00	0.00	1.83	0.00	1.30	1.12	2.91	1.47	1.48	4.39	0.54	0.00	0.00	0.00	4.32
7	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	2.31	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.13
9	I2	Intron	0	2.52	3.73	3.03	2.03	4.25	3.98	2.04	4.81	4.01	4.56	2.97	4.76	2.14	3.78	3.42	4.31	5.52	2.31	1.35	1.16	4.10	5.86	2.60	6.33	4.14	2.89	4.53	3.30	2.76
10	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.41	2.12	1.10	0.00	1.29	0.54	2.66	0.49	0.81	1.14	0.16	2.76	0.86	0.78	1.22	0.56	1.97	0.00	0.84	0.73	1.13	1.43	0.71	3.40	1.32	1.45	0.00	0.86	0.53
11	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.09	1.87	1.48	2.61	2.74	2.26	0.29	2.91	2.63	4.25	1.93	3.96	1.74	1.78	1.53	1.58	4.25	1.03	0.70	0.20	2.49	3.38	1.93	2.63	1.66	2.29	1.20	1.44	2.29
12	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	1.41	0.71	2.15	3.15	6.76	5.26	1.33	4.56	1.78	1.75	2.55	4.32	1.28	1.00	1.21	5.68	4.87	2.39	0.00	0.61	3.76	2.87	3.69	3.88	2.20	0.33	4.83	3.89	0.88
13	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	4.20	7.40	5.95	2.56	6.63	6.47	3.50	8.30	7.59	6.22	5.40	6.28	3.72	8.04	7.42	7.87	8.45	4.45	1.66	2.54	6.89	11.15	3.99	12.52	8.06	5.16	8.65	5.37	4.75
14	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	6.32	3.79	2.73	0.00	3.83	7.62	2.95	9.32	5.39	12.26	4.43	7.57	0.90	5.15	2.24	8.25	8.04	4.26	7.17	1.08	6.92	8.76	2.18	5.49	7.88	2.47	12.83	8.24	4.37
15	Ix	Intron	0	10.07	7.49	5.01	6.35	9.31	5.05	5.08	5.77	13.02	6.79	2.43	6.59	1.85	7.70	8.70	8.26	14.43	6.95	8.05	3.84	7.19	4.17	1.60	11.42	5.94	6.63	1.50	3.77	3.51
16	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	10.10	7.51	5.02	6.36	9.33	5.07	5.09	5.78	13.05	6.80	2.44	6.61	1.86	7.72	8.73	8.28	14.47	6.97	8.07	3.85	7.21	4.18	1.60	11.46	5.95	6.65	1.50	3.78	3.52
17	E3_Aa	NovelBoundary	0	8.79	17.16	5.41	0.00	20.48	18.19	12.59	8.81	33.16	15.10	7.09	19.37	15.67	32.64	0.00	17.59	33.29	23.76	8.09	7.94	25.75	13.13	2.51	32.36	16.59	4.16	13.42	5.80	5.02
18	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	1.27	0.81	0.24	0.30	0.00	0.51	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.30	0.38	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71